四月初一日（戊戌），徐嗣曾奏言：自興化、泉州馳抵廈門一帶，察看緊要口岸；即■〈氵义〉港紛岐處所，亦皆派撥員弁帶領兵役梭織巡查。臣又隨處傳集濱海耆民及澳中漁戶，面加獎勸。該居民等，咸知踴躍。現復據漳浦縣羅澤坤稟報，盤獲臺灣逃回匪犯林壬（即陳壬）一名，解赴督臣李侍堯審辦。臣於三月十四日回至省城，擬將一切事件速行趕辦，再赴緊要口岸，親往搜拿。又因調派廣東兵四千名，由廈門、蚶江分渡會剿，臣昨往來泉州，將應行事宜，面同督臣商酌。督臣擬赴廈門一帶巡查，即料理粵兵東渡。臣巡閱口岸，亦以興化、泉州一帶為最要。計粵兵之由蚶江前進者，正在其時，臣即暫駐蚶江，督率照料，務俾妥速飛渡。俟粵兵開船後，趕回省城辦理秋審及一切事件，亦不至誤。至於應需糧餉等項，布政使伍拉納及鹽法道戚蓼生現在泉州隨同督臣辦理。已節次委員齎銀前往接濟。臺灣本系產米之區，一面委員就地採辦，一面運米前赴支放。仍令各屬動碾倉谷，運貯泉州，聽候撥用。藥鉛等項，亦已籌備充裕。奏入，報聞。
初二日（己亥），上命軍機大臣傳諭常青、李侍堯曰：康熙年間，奸民朱一貴聚眾滋擾，經提督施世驃統領大兵，悉由廈門進剿，不及一月，即已收復蕆功。蓋因大兵會合一路，由廈門進攻，聲威壯盛、賊匪望風膽落，故能一舉殲滅。此次，賊匪起事之初，黃仕簡、任承恩領兵進剿，分路配渡，其餘將弁又各由別途陸續進發，已覺兵勢稍分。伊二人一抵臺灣，即應彼此會合厚集兵力，直搗賊巢，將首惡擒縛，餘黨自必瓦解。乃黃仕簡、任承恩僅派撥將備零星打仗，四處堵御，以致賊匪從而生心，得由山徑繞道蔓延，各處嘯聚。官兵轉為所牽掣，兵分而力見單。幸而賊匪不過么■〈麻上骨下〉草竊，並無謀計；設遇狡黠奸徒，逞其鬼蜮伎倆，豈不又蹈木果木之覆轍耶？著常青抵臺灣後，即將各路官兵調集會合一處。其添調粵兵，遵照前旨全歸常青統率，以期兵威壯盛，士氣振奮，專力全赴賊巢搜剿。斷不可又蹈黃仕簡、任承恩故轍，輕分兵力，觀望遲延，俾賊匪得以四散牽掣蕆事，致稽時日也。
初三日（庚子），黃仕簡奏言：總兵郝壯猷、柴大紀等，馳赴南北二路剿匪，郡城為全台根本，不可無大員彈壓。且附郡之大穆降、本縣莊、岡山、羅漢門等處，介在南北之中，均離郡城不遠，各處有賊匪往來出沒。臣親督官兵居中堵御搜捕，並為兩路軍兵接應聲援。此在郡未敢遽離之情形；但臣前奏未能詳悉聲明，實屬糊塗之至。迨諸羅、鳳山先後克復，賊匪復於附近村莊潛聚滋擾，臣派撥官兵嚴密擒捕；而諸羅之大武壟、礁吧哖各莊，仍有匪黨聚集。該處山路最為險峻，現在整兵進剿；日內督臣常青到臺灣，臣即親率官兵到處剿捕。掃除之後，隨赴諸羅督同總兵柴大紀進攻斗六門、水沙連等處；繼至彰化會同總兵普吉保等攻剿大里杙賊巢。務期生擒逆首林爽文解京究辦，並剿盡匪夥、斷不敢稍有遷延觀望，自取罪戾。至臣染患風症，前在內地時發時愈，自到台灣，因機務焦迫，心神倍加恍惚，氣力日見頹憊。惟念職任海疆，只得竭盡駑駘，是以未敢將症病據實奏明。茲節次欽奏上諭訓飭，臣感激涕零，悚惶無地！惟有躬率士卒，奮勉剿匪，淨盡根株，以期克日蕆事。
同日，李侍堯奏言：官兵前往臺灣剿捕逆匪，所有糧餉等項，固須接濟無誤，尤防冒濫多支，致將來按例報銷，或至追賠懸宕。臣於到任後，即飭司查核。茲據伍拉納匯查，自上年十二月起至臣到任以前，共撥藩庫銀三十三萬餘兩。臣意，用兵未久，何至如許之多！及閱所開各款，有鹽菜等項，例應支給者；有餘支俸餉等項，數月內即可扣還者；有過兵地方借領，以應差務，將來除核銷外應繳還者；亦有解往台郡備用，正在途次，該道府具稟時，尚未接到者。緣倉猝調兵，務期迅速應付，以利遄行。且台郡遠隔重洋，往返動需時日，不得不多為預備，是以動撥較多。但近據臺灣等縣開報雇用夫價等項，已有例不准銷者。臣以軍務緊急之時，固不便一一駁核，致地方官轉得藉口，或至貽誤。但一任濫付，將何所底止，隨即嚴行檄飭將來著落賠補外，仍一面通飭各屬，嗣後一切款項，均須查照部頒軍需則例動支。其則例所未載而事在必需，如海運水腳等項，則酌量先行應付。其餘概不得濫給。庶軍務無遲誤之虞，而帑項亦不致有多糜之弊。至臺灣府、縣，本各有倉庫，其三縣雖已殘破，而府城保守無虞，尚應實貯。據藩司查明，府庫應存銀二十五萬餘兩，倉谷應存十二萬餘石；乃接據臺灣道府稟稱，銀谷俱已用盡。並未將作何動用之處，詳悉開報，隨嚴飭該道府等逐一查明，到日核辦。現值軍務緊要，自當先以接濟糧餉為急。臣惟有隨時酌量應付，以期無誤。昨據署臺灣府楊紹裘稟稱，逆匪林爽文與各賊黨，將大里杙一帶，掘濠放水，復築士牆，安設砲位。是現在賊黨方盤踞穴巢，並力拒守，未經大創，斷不肯自行潰散，則此時尚不慮逸匪竄入。其附船入口者，類多被難之人，窮無所歸，思回本籍。而各口岸兵役，藉有稽查之名，遇此等渡海來者，留難勒索，難保其必無。是以，臣嚴飭各員，務宜分別良歹，不得藉端擾累。現據各口岸委員盤獲數起。如逃兵汪中鯉等四名，臣已按律辦理。其餘被難之人，檄令各州縣訊明，如確有證據，立即釋回，庶奸匪不致倖逃，而難民亦不致受累。至將來攻破賊巢時，匪黨四散，逃入內地者必多，尤當上緊擒捕，毋使一名漏網；又不得以此中或有難民，稍存姑息。又提臣任承恩委弁押解賊目林家齊一犯前來，咨稱該犯系逆首林爽文族長，去冬曾誆哄彰化文武官，願將林爽文帶來投到，以致猝不設備，釀成巨案等因。臣查該犯既系林爽文同謀之逆黨，自應解京審訊，隨派委巡檢程鏜、把總姚世貴將該犯押解，於二十日起程。均奏入。
上命軍機大臣傳諭常青、李侍堯曰：黃仕簡不過因遷延日久，連奉諭旨嚴飭，為此飾詞以掩其退縮之罪。幸而朕先事預籌，派令常青前往督辦，黃仕簡得有所藉口。若使朕不派常青前抵臺灣，黃仕簡又將何辭？豈竟思久坐郡城，以待賊之自斃乎？況林爽文既歸巢穴，其餘附近賊匪，不過么■〈麻上骨下〉草竊，如易連、陳邦光等皆可堵截搜捕，又豈專賴提督大員坐擁重兵，以防其復來滋擾之理？即總兵柴大紀、郝壯猷等收復二縣城後，自應統領官兵直抵大里杙賊巢，奮勇剿除。乃該鎮等即以防守為名，並不上緊追捕截拿，任其竄伏團聚，以致賊匪得以繞道蔓延，官兵轉為所牽掣。是該鎮等效尤觀望，畏葸不前，即郝壯猷之罪，亦與柴大紀之失陷城池、漫無籌畫者，不相上下。現據李侍堯奏，逆匪林爽文與各賊黨，將大里杙一帶掘濠放水、復築土牆、安設砲位等語；賊黨盤踞穴巢，以圖並力拒守，看其光景，別無他圖竄匿之計，轉可聚而殲戮，其事尚屬易辦。恐大兵雲集，四路圍攻，賊匪計窮力蹙，或竄入內山，希圖苟延殘喘，搜捕轉稽時日，不可不預為籌辦。著常青抵臺灣後，即將各路官兵調集會合一處，揀派精銳，親行帶領，直赴大里杙奮力圍剿，務將首惡林爽文一鼓擒獲，餘黨殲除淨盡。其堵截賊後路，不使竄入內山一事，專派柴大紀帶兵在內山路口，嚴密堵御。並著常青詳悉曉諭柴大紀，伊系臺灣總兵，致賊滋事，失陷城池，已屬有罪之人；且收復諸羅後，效尤觀望，其咎亦與黃仕簡、任承恩無異。念其從前守御郡城，尚屬出力，姑令帶罪圖功。現在大兵進剿，賊匪竄入內山之路，最關緊要，即責成該鎮專力堵截。若能將賊首拿獲，餘黨不使一名竄逸，不但宥其前罪，並當仍錄其功。倘再不能實力奮勉，立功自贖，以致賊首林爽文從伊防守之地竄逸，及餘匪復有逃入內山等事，則惟柴大紀是問。恐伊不能當此重罪也。再據李侍堯奏，附船入口者，類多被難之人，而各口岸藉有稽查之名，不無留難勒索等語。綠營此等惡習，實為可惡！俟事竣後，當嚴查處治，以示懲儆。又臺灣倉儲庫貯額數，不為不多，府城又復保守無虞，何以未及數月，即已用盡？地方遇有此等事件，該處官員即使各出己貲，設法防護，亦所當然。況閭巷小民，尚有好義急公之舉。若地方官竟有藉辦軍需為名，浮用冒銷，飽其私橐，則是天良昧盡，即立置重典，亦所應得。但現在正值會兵進剿之時，若遽行查辦，恐伊等各懷畏懼，辦公更多觀望。著常青、李侍堯俟事竣後，徹底嚴查。如果有侵欺情弊，即嚴參重治。想昧良之輩，天理難容，亦無所逃罪也。
初四日（辛丑），常青奏言：二十三日至廈門登舟，因春令北風甚少，在料羅寄椗。三月初六日風順開洋，初九日由澎湖進鹿耳門登岸。抵臺灣府城，面晤提臣黃仕簡，即以欽奉上諭與看，令其回奏。並詢以剿賊機宜，黃仕簡語言不甚明白，更兼步履艱難，是病憊屬實。及臣接見在城員弁，訪問臺灣近日情事，復悉心體察剿捕事宜，詎料與該提督等從前咨報，逈不相符。緣臺灣地廣人稠，遊手者眾，自逆首林爽文攻縣戕官，各處奸徒皆效尤搶劫。然大兵初到，賊眾聞風逃散，此時兩提臣乘其銳氣，自有破竹之勢。因黃仕簡惟坐郡城，任承恩惟守鹿仔港，而分派鎮將亦皆觀望遷延，不思爭先賈勇。
臣在泉州時，以重洋阻隔，盼望情殷，聞收復彰化、攻克諸羅，而鳳山又克日可復，臣一時忻幸，意謂大勢已定，即請將浙、閩兩省備調之兵撤回，以省糜費。今臣親至臺灣，得諸目擊，始知彰化、諸羅、鳳山等縣，被賊攻陷，焚劫已空。而又以栽竹為牆，無險足據，故賊聞官兵將至，即舍城而爭險要之地。官兵既已入城，因即以克復城池咨報。如柴大紀一到諸羅，賊仍佔據斗六門，使我兵南北二路，至今不通。並聞普吉保帶兵前赴彰化，中途被劫車輛，則道路梗塞，較前更甚。任承恩帶兵由鹿仔港登岸後，既不駐紮彰化縣城以逼賊巢，又不與柴大紀夾攻斗六門，惟知退守鹿仔港。近聞賊人仍往來彰化城中，是何得謂之克復！至郝壯猷系正月間經黃仕簡派往南路，在大湖扎營月餘，於二月二十一日據報克復鳳山。乃臣於三月初九日到臺灣之時，已聞初八日郝壯猷所帶兵丁二千餘名，被賊沖散。該總兵及副將以下等員，先後奔回，止存敗殘兵四百餘名。又副將徐鼎士前到淡水，未見寸功。因距府路遠，尚無實信。兩月以來，折兵糜餉，應請將遲誤之提督黃仕簡、任承恩、總兵郝壯猷、柴大紀、普吉保分別治罪。臣在泉州不能覺察，並請將臣交部嚴加議處。但黃仕簡患病衰頹，在軍無益，應令其仍回廈門。任承恩雖未能向前，但北路避賊人民，俱在鹿仔港，若遽撤動，恐賊乘虛；柴大紀雖不能將斗六門一帶打通，然上年在府城外堵御，尚屬奮力；普吉保系後到之員，調往北路未久，俱仰懇暫令伊等帶罪督兵，以觀後效。至郝壯猷等自鳳山敗回，是否賊多兵少，致被衝散，抑系畏葸脫逃；並前此鎮將等咨報克復縣城，以及攻莊殺賊各情節，有無藉事鋪張，容臣一並嚴查明確，再行請旨。務令功罪分明，軍威復振。但臺灣賊匪，從前止有逆首林爽文、王棻等數人，從賊者亦止附近賊巢數千人。今則：南路險要各處，有賊首莊大田、莊錫舍、王坑郎、藍九榮、陳靈光、陳建平等；北路險要各處，賊首林爽文之外，又有陳泮、吳領、蔡福、葉省等。或為林爽文羽翼，或效林爽文所為，自立旗號，肆出滋擾；凡稍可踞佔之民莊，盡為賊人所有。惟府城、鹿仔港、笨港沿海三、五處，亦屢有賊來攻擾，尚能共相保護。故避難者偕來聚處；但將來亦恐有人滿乏食之虞。而逆首林爽文等，狡猾異常，復將所掠錢米廣為散給，要結人心，以致無食遊民盡皆從賊。查臺灣額駐兵丁，經三縣被陷傷亡已多，尚未據該鎮查報實數。然約略存剩之兵，似不堪用。其內地調到兵萬餘，各路打仗，又多損失。當此賊勢蔓延，必須添調重兵，方能痛加剿洗。現在鳳山復陷、賊更鴟張，已到府城十里之外。臣派遊擊蔡攀龍帶兵往桶盤棧堵御，並督率道府永福、楊廷樺、同知楊廷理等，各帶義民同守，郡城可保無虞。再令普吉保速與柴大紀夾攻斗六門，以通南北之路。飭署守備陳邦光保守鹿仔港，催任承恩前赴彰化，先將附近縣城賊夥殲除，即相機攻搗林爽文大里杙賊巢。並飛檄徐鼎士會合署都司易連，將北路新莊、艋舺等處賊匪剿盡，漸次自北而南與任承恩會合，並力搜捕。此時，不必僅以收復空城為得計，而必以爭據險隘、攻搗賊穴、殲擒賊目為先。除嚴飭提、鎮、副將等員，各思激發天良，出力報效外，一面飛咨督臣李侍堯，將原備南澳、金門、銅山、海壇各營兵一千名，再調同安營兵四百名、海壇鎮兵三百名、金門鎮兵三百名，又調原備廣東兵三百名、浙江兵二千名，再挑幹練勇往之遊擊守備等十員，配船渡海，俱由鹿耳門進口。會齊，臣即親自統領，必不再行分撥，致減兵力。先盡南路鳳山縣境，以致諸羅、彰化、淡水席捲而前，務期將逆首林爽文並其餘賊目一並生擒，不使賊一名漏網。又查臺灣府城，雖系插竹為牆，而各門城樓磚土砌就，亦頗高大。臣隨出城外細看地方形勢，防範尚未周密。謹將恩旨蠲免臺灣府全屬本年地丁錢糧，謄黃遍諭各處；復傳喚士紳商民當面曉諭。各紳士義勇人等，莫不感激踴躍。現在府城內外街市，貿易照常。再查該提、鎮等咨報克復三縣，其彰化並無官兵駐守，鳳山現已復陷，惟諸羅一縣，自柴大紀駐紮之後，賊人尚知畏避，居民亦漸次回歸。臣因柴大紀不能打通南北道路，是以一並參奏。但其能守諸羅，非若彰化、鳳山之既克而不能保守者可比。是柴大紀功過，原不相掩，臣仍遵旨先行嘉獎，再觀後效。又逆首林爽文，前據該鎮稟聞被砲打傷之語，原無確據。現聞大里杙莊一帶，豎立旗號及偽帖告示，寫有「順天」字樣，並自稱盟主大元帥。此等悖逆不法，寸磔不足蔽辜。至義民等獻出王芬首級；系何人所殺，是否真實；義民等在先曾否附賊；挑斷腳筋之楊禮等十一犯有無搶奪，容臣逐一查明核辦。
同日，黃仕簡奏言：二月初九日，有南路弁兵紛紛來至郡城，臣隨飭遊擊孫全謀詢問。據稱初八日賊匪從鳳山縣東南門放火擁入，官兵接戰，抵敵不住，以致衝散。初十日總兵郝壯猷到郡，據稱初四日參將瑚圖里稟報，自山豬毛被賊攔截，不能過溪。該總兵派令遊擊鄭嵩帶兵六百名前往，又派官兵三百名接應。午刻，鄭嵩回稱行至硫磺溪，遇賊圍截衝散，官兵未回甚多。未刻，賊匪來攻營盤，並攻縣城東門。初六日，該總兵將城外官兵，移駐城內。初七日，賊四面攻城。初八日，賊匪益見加增，攻城更急，午刻賊由南面進城，四處放火攻殺，以致官兵衝散等語。查南路自克復鳳山，總兵郝壯猷等原帶官兵，合計有三千餘名，在該處防守縣城，足資堵御接應，何致賊匪衝散官兵。現在督臣常青於三月初九日到臺灣府城，臣差查南路官兵存亡確數另報，統聽督臣查核辦理。均奏入。
上命軍機大臣傳諭常青、恆瑞、李侍堯、徐嗣曾、琅玕曰：據常青奏，到臺灣後，查明官兵遲誤，據實指參，及添調兵丁情形，所辦俱合機宜。惟任承恩身為提督，乃畏葸不前，既不駐紮彰化縣城，以逼賊巢，又不與柴大紀夾攻斗六門，其罪奚辭；豈可復留該處，再令帶兵，仍滋貽誤。著遵前旨，將任承恩一並拿問，解京治罪。柴大紀一到諸羅，不能將斗六門賊匪搜除盡淨，開通道路，實有應得之罪。但前此守御郡城，尚能奮勉；且駐紮諸羅後，賊人頗知畏避，居民亦漸回歸。常青所稱該鎮功罪不相掩，自屬公論。所有陸路提督一缺，著加恩暫令柴大紀署理。並著常青傳諭該鎮，令其載罪圖功，以觀後效；若伊玩誤不前，必當二罪俱發。至郝壯猷守衛鳳山，即賊多兵少，亦當效命捐軀，國家自有優卹。乃竟棄城逃回，怯懦已極，軍律斷難姑息，已明降諭旨，即於軍前正法，以肅戎行。其所遺海壇鎮總兵員缺，著常青於現在帶兵將備內，詳加體察實有奮勇出眾人員，則不拘階級之崇卑，即奏請破格超擢，以示獎勵。如此，賞罰嚴明，自必人人感奮，可期鼓勇集事。至常青現在飛咨添調本省及廣東、浙江兵共七千名，俱由鹿耳門進口，會集，即親自統領，必不再行分撥，致減兵力之處，所見甚是。粵東潮、碣二鎮兵丁，前據李侍堯等奏，業經檄調四千名；已較常青所調者多一千名，於三月十六日自粵省分起起程，即可陸續到彼。至浙省兵向來柔懦，更遜閩省，且距閩稍遠，此時徵調亦緩不濟急，著傳諭琅玕竟可停止派撥。現於常青原調兵數止少一千名，朕思福建駐防滿兵，雖不能如京師健銳火器等營勁旅所向無前，究屬心力堅定，較之綠營恇怯，尚為得力。況常青曾任福州將軍，駐防兵皆其舊屬，呼應自靈。著恆瑞於滿營內挑選一千名，並派得力之協領、佐領等官，分起管帶，恆瑞即親身統領，前赴臺灣，會合進剿。所有兵丁口糧、配渡各事宜，即著徐嗣曾妥為料理。其福建續調之綠營兵二千名，即著藍元枚親身統領，前往臺灣會剿。內地亦不可無提督彈壓，所有水師提督事務，著漳州鎮總兵常泰暫行署理。現在粵省添調兵丁四千名，及本省續調之內地官兵，自已陸續至廈門會齊。著李侍堯妥速料理，即令其配渡。常青於新調官兵未到之前，固不宜冒昧輕進，然坐待稽延，恐賊匪又生別計，亦非良策。自應將現有官兵內，詳加挑選擇其壯健者，派令奮勇將備帶領，先至南路鳳山一帶，搜捕賊匪、逐一殲除淨盡，俾後路肅清，將來大兵往北攻剿，不致有反顧之慮，較為妥善。至鳳山駐守兵丁三千餘名，何至遇賊即行潰散；現據常青奏先後奔回之兵，止存四百餘名，餘兵皆向何往，豈有俱從賊之理？著常青俟事定後，嚴查為首之人，從重辦理。其現在退回之兵，按照兵法俱應概予駢誅；但念人數眾多，究系領兵將弁不能首先奮勇，以致兵氣不振，姑暫貸其一死。著常青明白曉諭該兵丁等，令其激發天良，奮勉自效。
上又諭內閣曰：郝壯猷系派往南路剿捕大員，既經收復鳳山縣城，自應一面派兵設卡防守，一面親率將弁追剿賊匪，乃安坐營盤；既聞瑚圖里被賊攔截，不即親往接應，以致賊匪乘勢攻圍，縣城復陷。況該總兵所帶之兵，計有三千餘名，當賊匪來犯時，兵丁等畏賊退避，該總兵即應立時正法數人，使知儆懼，同心抵御，何至紛紛潰散！即或賊多兵少，勢不能支，亦應奮不顧身，殺賊而死；甚至無能自刎，庶不失城亡與亡之義。從前征戰緬甸時，如明瑞、觀音保、扎拉豐阿，皆因綠營兵丁恇怯，不能勝敵。今日適有松潘鎮總兵穆克登阿來京陛見，經朕詢問，據稱伊即在彼跟隨明瑞等打仗，目擊彼時情事，將軍等非不可以退出，而明瑞等僉言受恩深重，兵散勢窮，寧死於賊，不死於法。即或退出後，幸邀寬典，亦何忍靦顏視息。是以不肯生還等語。朕聞其言，猶欲為之墮淚！明瑞等能知大義，咸以身殉，其身後既邀優卹世職，復予專祠，子孫至今受恩弗替，歿有餘榮。郝壯猷以專閫大員，寧不聞知？乃亦效綠營兵弁恇怯惡習，自罹重辟。且日前因郝壯猷收復鳳山縣城，尚為出力，曾諭令常青查明，如果郝壯猷堪勝提督，即行奏明候朕簡放。今似此畏怯倖生，若不明正典刑，其何以肅戎行而昭軍紀？常青接奉此旨，即將郝壯猷在臺灣郡城傳集眾將弁，將伊正法。並將前旨本欲用為提督，及現在又因其棄城潛回，是以按軍法從事各緣由，向其宣諭，俾知賞罰分明，禍福惟其自取；郝壯猷即身伏刑誅，亦當死而無怨。至瑚圖里身系滿洲，前於賊匪滋擾鳳山時，乘馬馳歸郡城，已有應得之罪。第念其究因倉猝兵散所致，與自行脫逃者有間，是以仍令帶罪效力。今據黃仕簡奏，該參將又於山豬毛地方被賊攔截，不能過溪。若系賊人踞守溪河險隘，尚屬可原；倘竟系該參將畏懼賊勢，借詞躲避，亦如郝壯猷之逃回，則其罪更無可逭。著常青即查明，此次瑚圖里如果有畏葸逃回情事，亦即一面奏聞，一面將該參將正法示眾。至柴大紀、普吉保，姑念其從前奮勉，現令帶罪自贖，暫著從寬交部嚴加議處，以觀後效。常青從前率據黃仕簡等咨報，冒昧入告，咎亦難辭。但念其遠阻重洋，未能得知確信；且該督現在臺灣督辦，本日奏到各摺，悉合機宜。常青著加恩免其議處。此事現交常青督辦，常青即著授為將軍。恆瑞、藍元枚著授為參贊。俾事權歸一，軍威益振，以期迅奏蕩平、綏靖海疆。
上又命內閣曰：前因李侍堯奏南北兩路提督，各有牽掣，不免坐費時日，已降旨將任承恩革職拿交刑部治罪，黃仕簡撤回廈門候旨矣。伊二人抵臺灣後，並不親臨行陣，定期會攻，一南一北，互相觀望，果不出朕所料；以致賊匪日久蔓延，迄今未能撲滅。其玩延貽誤，厥罪維均。即或黃仕簡因年老患病，不能親身帶兵，及任承恩到彼後，不能不零星堵御，抑或賊匪眾多，兵力實有不敷剿辦之處，伊二人早應隨時據實直陳，候朕指示籌辦。乃伊等並無一字奏及，是其種種貽誤，實無可置喙。而黃仕簡系水師提督，臺灣乃其專轄，現在剿捕事宜，又經朕特交督辦，乃如此畏葸因循，更無怪任承恩之意存推諉，其罪視任承恩為尤重。任承恩既經革職拿問，黃仕簡亦難予寬宥，昨已降旨將黃仕簡撤回內地，俟伊到廈門時，著李侍堯即傳旨將伊一並革職拿交刑部治罪。所有福建水師提督員缺，著藍元枚調補。其陸路提督，自當擢用現在臺灣出力總兵。柴大紀於林爽文等滋事，不能預為防範，到諸羅後，又不能進剿斗六門賊匪，本不當復邀升擢；但念其防守郡城，尚能奮勉出力，功罪自不相掩，所有陸路提督員缺，著加恩令柴大紀暫行署理，以觀後效。