崇禎十三年庚辰，天下賊寇流橫。雖每有斬獲，屢報招降；然經略無方，不能解散，降而復叛。故張獻忠煽聚於榖城，羅汝才並起九營應之，合於房州，連陷湖南、湖北岳、鄂等處地方，復至澧陽。守道周鳳岐求救於七省參軍陳璸。璸即檄蜀鎮總兵溫如微領本轄兵五千，共萬餘人，於十一月十九日進援澧陽，與周鳳岐共籌制敵之策。二十夜，忽接常武告急，即發鳳陽兵三千往救；又發衛營遊擊劉以泗領兵劄新州，以禦水路；發茅岡營副將劉時早領兵劄公安，以拒襄郢，分布已定。二十四日，張獻忠大軍至常武，溫如微不敢守，棄城而遁。三湘亦隨失。陳璸等孤軍腹背受敵。
十二月初八日，璸將沅標兵三千、土司兵五千、牙兵五百、新募弓弩手六百，進復常武。初九日，過城子鰲山鋪，獻忠用驕兵計，凡三戰而璸三捷。獻忠合其眾再戰，璸大敗，死亡殆盡，惟有蒼頭劉光瑞率兵數十人，護璸逃遁六十里。而賊又至，光瑞同牙兵死戰衛璸。光瑞被殺，璸奔新斗鋪，為賊所擒。澧陽遂陷，周鳳岐亦被執。二十四日，解至公安馬驛橋孫家園，見獻忠。忠勸璸降，璸怒目叱之曰：『堂堂憲臣，肯從反賊』？獻忠大怒，斷其手足；罵不絕口，割舌剖肝。鳳岐亦大罵賊，咸被殺。時賊或攜藥囊著蔡、或賣卜星相、或為緇流黃冠、或為乞丐戲術，分布四方，偵覘虛實，互為接應。流毒焚掠，勢若燎原。過天星等七股，盡分道入蜀，陷大昌，犯夔州。河南瓦罐子、一斗粟諸盜，盡歸李自成。有黃梅貢士吳卿上言曰：『流賊奸宄，出沒尤甚，偵走日馳二百里，酗酒耽色，渴睡不醒。若得能將勇敢，銜枚夜襲，賊不及覺也。今兵不殺賊，反以仇民，窮鄉男婦，匿林逃難。割頭獻功，以愚主將；主將以愚監紀。監紀不知，遂奏其功。此弊踵行久矣，所當痛懲者也』。崇禎覽疏，是之，令朝臣各省撫按舉將才。是以芝鵬齎軍門薦本至京，恰合其機。先賂本省勢權縉紳，如吏部丁啟濬者（字哲初，泉州人，壬辰進士），然後關通閣部，相互會於崇禎之前，準授鄭芝龍南澳副總兵，以靖海疆。
崇禎十四年，荷蘭郎必即哩哥統船前來（有刻歸一王者誤也），被鄭芝龍燒壞五只。其餘船率領逃回，綑縛見王請罪。王曰：『勝負乃兵家之常，卿不必過於自損』。遂赦其罪。有國王之弟揆一王向前啟曰：『我國船隻，兵糧俱足，俟臣帶領一旅，前去與郎必即哩哥報仇』。王曰：『御弟欲領兵前去甚好；但唐朝人物不少，未可恃勇。卿欲去，須相機於附近地方先踞一處，安頓船隻，收拾人心。蔗得通知來往，積聚兵糧，養精蓄銳，窺其釁隙，進可攻、退可守，不致孤軍有覆敗之虞』。揆一王曰：『謹領諭教』，即挑選精壯，配駕夾板船十五只，辭王出師。王率文武餞行，臨別又囑其『步步小心，唐人多詐』。揆一王頓首拜命。順南風，不論日月而行。亦是天意使然，一日看前面山甚高，揆一王問左右曰：『不知此處是中國否」？內有舊跟郎必即哩哥軍士答曰：『看此處水色，不是中國。我們船尚在洋這邊』。王曰：『既是這邊地方，將船駛入，去看是何國』。眾船得令，乘風而入。王持千里鏡，照觀岸上，並無城郭。囑咐『將船一條邊灣住，預備火砲以防意外』。傳么子同蘭帶好漢一百名（么子、蘭咸是官名，么子有總兵職，蘭亦官銜，有守備職），每人長銃一、短銃三、腰各懸劍，駕小船巡看，偵問是何國。么子隨帶人上岸，見鯤身有些舊址，卻無鄉村，仍下船過江登岸，行里許，方見有人，篷頭跣足，赤身箛肚，佩弓負箭。么子令人招他，他亦就來；語言不諳，徒以手相比畫，引到社。適通事何斌同李英在澎湖被李魁奇追趕，船隻走到鹿耳門打破（鹿耳門，臺灣口子），兩船人咸淹死，僅存何斌與一二水手，被水漂至大線頭救起。身被海石蠔殼傷壞，調養才好，而又染病在社裏。隨出來與么子相見。么子問何斌，『此處何處』？斌曰：『名臺灣』。么子曰：『有國王無』？曰：『無。悉是散居』。么子聞言大悅，就邀斌同往船中，見揆一王，把終始陳說。王喜，厚待何斌，用為通事，事無大小，悉以諮之。又問斌：『此離中國多遠』？斌曰：『此處到澎湖四更、到廈門七更，共十一更』（海裏行船論更，亦似陸路論里）。王曰：『如此甚妙，此處既無統屬，我今就安頓在此』。朝夕與斌踏看地里，起築城池。為永遠計，擇於七鯤身首，置城一座，名安平鎮是也，又名「七星趕月」。用糯米和灰，磨磚堆砌，外附砲臺。對面赤嵌，亦起小城。王將帶來軍士悉與新港社土番結姻。即差夾板三只回國報命，並請給糧餉。迨工竣，又慮港門寬闊，船隻易入，防患難周；隨將舊夾板六、七只，乘巨石灣曲回旋，打船沈焉。凡船隻入臺者，必由砲臺前經過；若從別處，則觸沈壞夾板，其船必破。餘處水淺招多。如此策畫，固若金湯。
崇禎十五年壬午八月，鄭森赴福省鄉試。
但臺灣乃海外窮島，為荷蘭國揆一王築城所踞，未足為奇。乃有一座錦繡江山，普天人民，已受二百七、八十年恩澤，誤用庸臣，重文輕武，門生同年互相表裏，只知市私恩有家致富，那肯布公心為國培元；朋黨凌嚼，民不聊生，致四方盜賊蜂起。當事尚不知悔，上下蒙蔽，有錢賄賂者，則保題之。當時有出粟賑濟者，則咸指他沽名市義，必有異志，合疏交攻。是以最英明之君，被幾個草寇擺弄得昏迷。大眾相視，束手而待斃耳。
時崇禎十六年癸未七月，闖賊李自成設酒請草天王賀一龍，就席間斬之。隨馳馬至羅汝才營。汝才不知就裏，出來迎接，亦被砍死。遂得兩部人馬，共有百萬，據西安府為長安府。進攻榆林，破慶陽，連張獻忠為唇齒，還師西安過年。
崇禎十七年甲申正月，兵科給事中曾應遴薦山東登州副總兵鄭鴻逵緩急可用。詔益南贛兵三千，命逵鎮守。又擢南澳副總兵鄭芝龍為福建都督。是月賊夥牛金星、宋獻策、李巖等共尊李自成為帝，僭號大順，改元永昌。遣劉宗敏、李過等攻破大同，巡撫衛景瑗（字帶黃，進士，韓城人）罵賊，被賊碎剮。敏馳報李自成。成曰：『此關一破，便可長驅直抵』。留賊黨李友等守西安城。率眾從禹門渡河，巡撫蔡懋德領應時盛巷戰死。臨晉、河津、垣曲、絳州皆陷。
二月十八日，進攻代州，鎮將周遇吉（三韓人）退守寧武關。率二百餘人從城上縋下，殺入賊營。賊大敗，退二十里。相持半月，閹宦按兵不救。
三月初一日，城陷。遇吉統兵民禦敵，連砍數十餘賊，力竭被擒。勸降不屈，大罵遇害。妻白氏盡節。全城屠戮。自成嘆曰：『使守者盡如周遇吉，吾安得至此』！即投牒於兵部約戰。
三月十五日，自成至黎城，崇禎皇帝徵天下勤王。御史李邦華勸上南遷（華字懋明，進士，江西吉水人）。帝怒曰：『朝臣平日所言若何？今國家至此，無一忠臣義士為朕分憂，而謀及南遷。夫國君死社稷，乃古今之正，朕志已決，毋復多言』！又請太子撫軍。江南給事中光時亨大聲曰：『奉太子南行，將欲效唐肅宗故事乎』？諸臣遂不敢言。帝復問戰守之策，眾臣無一對者。帝嘆曰：『朕非亡國之君；諸臣實亡國之臣耳』！遂拂袖而起。欽天監奏帝星下移。總兵姜環通叛將白廣恩與太監杜勳降賊，巡撫朱之憑自刎。自成愈逼，帝召諸臣，相對泣下，並無他策。忽報昌平失守，崇禎色變。是夜賊犯平則門。早朝帝對諸臣無言，惟相向哭泣而已。須臾賊大至，報過蘆溝橋。俄報攻彰義門，城外三大營皆潰，火車巨砲、蒺藜鹿角，悉為賊有。反轉砲攻城，轟聲震地。諸臣方侍班，襄城伯李國楨匹馬馳闕下，汗浹沾衣。內侍呵止之。國楨曰：『此何時也？君臣即求相見，不可多得矣』。召入，國楨跪奏：『守軍不用命，此城難守』！叩頭欷歔。帝命內臣協力守城。內臣咸譁曰：『諸文武何為？我們甲械全無，焉能守城』？
十八日申時，彰義門啟，闖賊率群夥而入。帝召閹臣問曰：『卿等知外城破乎』？曰：『不知』。帝曰：『事急矣，今出何策』？俱曰：『陛下之福，自當無慮』。是夕，帝不能寐，同王承恩幸南宮。登萬壽山，望烽火燭天。徘徊逾時，回乾清宮。硃書諭內閣命成國公朱純臣提督內外諸軍，夾輔東宮。命進酒，連沃數觥，嘆曰：『苦我民耳』！以太子、永王、定王分送外戚，令妃嬪各自為計。忽報皇太后自縊，帝捶胸悲楚；繼報皇后亦自縊。入見公主，嘆曰：『何生吾家』！左手掩面，右手揮劍斷其臂而去。少頃，去靴換朱履綾襪，手持三眼槍，出中南門。至朱純臣第，閽人辭焉，仍回宮。登萬壽山之壽皇亭（煤山，宮內深處），咬指出血，書詔於衣袂曰：『朕自登極十七年，逆賊直逼京師。雖朕薄德菲躬，上干天咎；然皆諸臣之誤朕也！朕死無面目見祖宗於地下！去朕冠冕，以髮覆面，任賊分裂朕屍。勿傷百姓一人』！遂自縊。太監王承恩亦縊於旁。
城陷，太監王德化率內宦三百人迎自成於得勝門，令仍舊職。時有官民進表云：『比堯、舜而多武功，邁湯、武而無慚德』之句。自成受朝賀，毀太祖廟。鑄永昌錢不成。尋崇禎於煤山，命以雙扉舁帝后於東門側，殮以柳棺，覆以蓬廠，莫有敢哭者。襄城伯李國楨踉蹌奔跪梓官前，放聲大哭。賊黨執楨見自成。楨大哭不止，以額觸階，流血滿面，賊眾持之。自成好言勸降，楨曰：『三事從我即降：一、祖宗陵寢不可發；一、葬先帝后以天子之禮；一、太子、二王不可害』。自成允諾，為易梓宮，帝戴翼善寇，袞玉滲金靴；后袍服如之。以丹漆殯帝，以黝漆殯后，葬田貴姬墓側。楨一人斬衰徒步扶送，葬畢自殺。時自成下令搬倉庫，向戶部主事范方取倉鑰。方怒，令斬方。方神色不變受刑（范方字介卿，號雨雨，泉之同安縣高浦所人。辛酉解元。因自成欲向方討倉鑰，方怒目叱之曰：『此鑰乃朝廷之物，非爾賊所可問者』。成怒，斬之。時人嘉之曰：『生為真解元，死為真主事』）。又拘國丈嘉定伯周奎，三夾不死，搬出銀七十餘萬（先時崇禎令各官助餉，奎以窮對。皇后私出銀五千與奎助餉，奎只出三千，其餘二千私自肥己）。陳演獻銀三萬、金三千、珠三斗。其餘拷掠凌辱者甚眾。又脅寧遠總兵吳襄（掌中軍都督事）寫書，遣降鎮唐通往山海關招伊子總兵吳三桂。
時三桂守山海關，接邸報，見陝西總督余應桂上疏言曰：『賊眾百萬，非天下全力當之不可。請調左良玉，吳三桂、高傑、唐通、周遇吉、黃得功、曹友、馬科、張天祿、馬岱、劉澤清暨王國寶、劉良佐、葛汝亮及副將邱磊、惠登相、王光恩、孔希賢、金守亮等會師津定之間。督輔之外，加一督師，如史可法、王永吉其人者，賜以尚方。懸公侯之賞，以鼓勵之，庶幾可滅』之疏（東旭曰：古來命將出師，未有二其權可以成功者也。如唐之裴晉公，憲宗委以都督軍外事，予以便宜討吳元濟，故雪夜深入於蔡。宋太祖命曹武惠南征李煜，命之曰：『江南之事，一以委卿』。故武惠得抒其胸中秘略，遂定江南。故明之壞，限以資格，動以掣肘，如用太監，又用監紀，此輩誤人不淺。際此緊急之時，尚欲督輔之外加一督師。噫，苟督輔可用，何必督師？若督師可用，則又何必督輔？故韓信之拜、諸葛之師，未聞尚有別人。宜乎天下瓦碎，上下蒙蔽；大勢已去，別無長策，徒有相對垂泣已耳）。吳三桂既見邸報，恐不日旨下，即欲起行，遂操演兵馬以俟。後又見一報：廷議『山海關重地，若召吳三桂入衛，則山海關誰守？棄地亦非善策』。知不果行。迨接三月十九日報：『賊陷京師，皇帝死煤山』。頓足望南慟曰：『庸儒誤國至此』！謀欲勤王。
四月初二日，唐通至，出其父襄書，並誇獎新命，犒賞銀四萬兩。三桂疑惑未定，通說以『運數既終，大事已去，父命當尊。且擇木而棲、擇君而事，棄暗投明，歷代有之；魏徵、尉遲，皆名臣良將。史冊昭然，非自將軍始』。桂意頗順。送通回，自調兵馬緩程入京。自成望通不至，疑三桂違命，將吳襄三千餘口盡行誅僇。僅走其姪吳勳，中途傳襄凶信，三桂悲號切齒，遂駐軍。單騎奔遼東，見清世祖章皇帝請師。世祖允諾。即調攝政王、豫王、肅王同洪承疇統八旗兵馬，長驅而進，軍聲大振。
唐通見李自成，言：『陛下何殺吳襄之太驟也！通費多少唇舌，說其歸降，業已拔營而來。今已殺襄，三桂聞之，豈肯甘心；必定關外乞師，將奈之何』？自成令秘之，遣人急促三桂。至中途，偵知三桂已出關求師，遂不敢往，馳回告自成。成忙令劉宗敏、祖光先、谷大成、白承恩等立十二大營於城外，首尾相顧，以備禦敵。又令李巖與唐通、李牟等統兵八萬迎敵。二十一日，相遇於一片石，通列陣招降。三桂咬牙指通，罵不絕口。參將徐有容出馬逼戰，通迎敵。未幾合，遂被有容刺死。李牟見唐通被殺，飛馬出救，被馬寶旁射一箭。牟傷額，幾乎墜馬，賊大敗。三桂急飛軍追趕。至永平復戰，殺賊萬餘級。李巖喪膽奔回，宗敏等不敢屯營，悉退城內，各自為計，咸無戰志。攝政王督諸師環劄城外。
李自成與牛金星、宋獻策等相議守禦。金星曰：『滿洲人馬強壯，弓矢嫻熟，況吳三桂少年猛勇。我師連敗兩陣，已無斗志。不如暫退陝西，養精蓄銳，再來恢復。今若遲疑，恐變起肘腋，悔之莫及』。其姪李過亦曰：『丞相之論極是。十個北京，不如俺一個陝西。退守為上策』。自成意遂決。二十六日，誅陳演、朱純臣諸勳戚，空御庫珠寶。自成先行，令祖光先、谷大成等斷後。
二十八日，大肆掠出城。夜焚五鳳樓。清世祖見連勝兩陣，又逢初夏，恐馬力疲倦，暫傳安養。忽見城內火起，哭聲轟天，知是賊潰。即令三桂追趕，滿兵副之。親統諸王額真等，分九門入。撲滅餘火畢，下令安民。收拾倉庫圖籍，追謚崇禎為「懷宗端皇帝」，皇后為「烈皇后」。吳三桂追李自成至三十里，大殺一陣，奪其輜車無數。谷大成見桂追到，布成陣勢。三桂奮勇沖過，大成隊亂，被殺。自成聞大成已死，趲軍從西北遁去。
桂至定州報捷。京中臣民勸進，於五月初一日擁戴世祖皇帝登極，國號大清，改元順治元年。封吳三桂為平西王，洪承疇為經略，招撫江南。
但江南諸臣於三月二十五日聞京師陷、帝后殉社稷，齊集魏國公徐弘基第，以太子、二王不知存亡，天下豈可一日無君，議立親藩討賊。時潞王、福王、周世孫各避賊淮上，鳳陽總督馬士英言：『福王是萬曆神宗之孫、泰昌光宗之姪、大行皇帝之兄，倫序當立』。可法、大器執不可。屢議未決。四月二十七日，右都御史張慎言、戶部尚書高弘圖、詹事府詹事姜曰廣、吏部給事中李治、河南道御史郭維經、誠意伯劉孔昭、太監韓贊周等會議。可法、大器後至，而孔昭、贊周力主如士英言，遂迎福王於儀真燕子磯。
五月朔，至江南。初四日，監國。御史祁彪佳曰：『先受監國，其名極正，使海內聞之，方知無倖位心，示謙讓也。今既發喪，宜登大寶，布告天下，為先帝報仇』。諸臣與魏國公皆然其議，乃於十五日即位。詔以明年為弘光元年，上崇禎謚「思宗烈皇帝」。後易為「毅宗正皇帝」（王諱由嵩，萬曆第三子諱常洵之長子。附記：禮部尚書余煜上言曰：『聞先帝謚「思宗烈皇帝」，竊以為未妥。按謚法：道德純一日「思」，追悔前過日「思」。先帝英明天縱，神武性生，憂勤十七年，念念欲為堯、舜者也。時遭家不造，亂階頻起；而所用之人，又皆忍於欺君，率致誤國，於先帝何咎焉？道德純一，則似氾；追憶前過，則似譏，於覲揚無當也。且唐、宋以來，從未有謚「思」者。唯周之思王己則弒君，而弟又殺之。漢之後主闇弱任奸，以亡其國，何足述乎？謚法：有功安民曰「烈」。今國破家亡，以身殉難，何烈之有？若激烈之烈，又非謚法之謂也。周之烈王、威烈王、漢之昭烈、魏之烈祖宗、唐之光烈帝，未嘗殉難也。他日書之史冊，將按謚法乎？不按謚法乎？故曰「思」「烈」二字舉誤也。然則謚宜云何？先帝英明神武，人所共欽；而內無聲色狗馬之好，外無神仙土木之營；汲汲皇皇，臨難時，則又慷慨必合「國君死社稷」之義。千古未有之聖主，宜尊以千古未有之徽稱。恨考訂古今，未足以奉揚其美，不得已而擬其似，當謚曰「毅宗正皇帝」。雖於內外賓服，亦未甚切；然先帝懿美及臨難一段不負宗社之氣，庶足盡之』。忻誠伯趙之龍亦言：『「思」非美字』）。
弘光設四鎮，晉黃得功靖南侯，駐廬、和。得功字滸山，京營名將也。每戰身自衝突，勁疾若飛，江淮呼曰「闖子」。曾為群商執鞭往都，經山東，值響馬，眾商俱逃遁，得功獨手提兩驢蹄禦賊，賊無不披靡，其勇如此。時高傑興平伯駐揚、滁，忌得功威名，伏兵劫功於土橋，屢戰。事聞，以太僕寺少卿萬元吉監軍江北解之，始各罷兵。按高傑字英吾，系降將，曾從孫廷傅子曾頭犘破賊。越次年，郟縣潰，潼關不支，率其部下李成棟、楊繩武等十三總兵統眾四十萬渡河，大掠晉中，鼓行南下，頓師邳、泗間。既位列四鎮，忌黃得功威名，且得民心，率三百精騎襲得功。功甫至土橋，解鞍下馬作食，傑伏騎猝起。功角巾緩裝，出其不意，亟擐甲，而飛矢雨集。所乘馬值千金，俄而矢中蹄，騰而上他馬馳去。傑即遣兵，戒之曰：『必生擒得功』！時有梟卒十七騎，追之且及。得功大喝反鬪，發腰間所餘七矢，殺七人，遂揮長刀復砍三人，幸其軍到，獲免；從行百騎皆歿。傑又將千人襲黃儀真城，被黃守將邱鉞、馬岱設守，不得入。岱開門出擊，盡殲之。於是怨愈深。萬元吉偕伊將張文昌、李樓鳳調停兩間，意未解。會得功有母喪，元吉乘間說之曰：『土橋之釁，無論智愚俱知其非。今將軍以國故、親故遂蠲盛怒，是歸其曲於彼，而將軍收名於天下』。得功稍和。元吉又令傑出千金為黃母賻，二憾之搆始釋。傑雖為人抗暴，然慷慨識機變，可說而動。平日折節事僧德宗，曾問德宗以終身之事。宗曰：『居士起擾攘，今歸朝廷，為大將、為通侯，此不足為居士重。惟率眾從史居士（指可法也），儒家稱聖人，我法所謂菩薩，居士與之一志並力，可謂得所歸矣』。傑之妻邢氏饒有權智，一見史公，出至誠相待，亦勸高傑傾心。史公亦喜傑馴擾，大事有賴；命王相業監其軍，加李成棟、賀大成、王之綱、李本源、胡戎楨為大將，連騎之任，專制河南。高曰：『傑既以身許公，再無亂心』。
封劉良佐廣昌伯，駐鳳泗（佐字明宇，東撫朱大典舊將也）；封劉澤清東平伯，駐淮、徐（澤清字鶴洲，為人好聲色，無將略）。又調鄭鴻逵、黃蜚、鄭彩為總兵（彩字羽良，泉之同安人），加鴻逵鎮海大將軍，守鎮江；彩守三叉河口，為釆石、蕪湖備。
六月，史可法、馬士英奏：『北京李賊，系吳三桂出關請師攻破』，遂封吳三桂薊國公，遣中書阮廷揚海運米十萬石、銀五萬兩，濟其軍。繼報大清定鼎燕京，高弘圖等會議為中國復仇，宜遣使通好，而難得其人。應天巡撫左懋第請行，加兵部右侍郎，以太僕寺少卿馬紹愉副之。並命懋第經理河北，聯絡關東諸軍。懋第曰：『臣此行致祭先帝后梓宮，訪求東宮、二王蹤跡，並通兩國之好，責不敢辭。至於封偪重寄，非使臣之職，乞解臣經理職銜。且馬紹愉前臣曾劾罷，今豈可共事？請停其行』。皆不許。懋第又請：『臣此行生死未卜，敢效一辭：臣望者，恢復；而近日朝端行事，似少恢復之氣。願陛下時時以先帝仇恥為心，瞻高帝之弓劍，則思成祖、列聖之陵寢何存？撫江上之黎民，則思河北、山東之赤子誰恤？更望廷臣時時以整頓士馬為事，勿以和議為必成、勿以和成為足恃。必能渡河而戰，始能扼河而守；必能扼河而守，始能畫河而安』。眾韙其言。齎白金十萬兩、幣帛五萬匹，左都督陳弘範帶兵三千護行。（附記：懋第八月渡淮。十月朔，次張家灣，止許百人入都。懋第衰服往館鴻臚寺，以不得赴梓宮，即於館遙祭。是月二十八日遣歸。甫出京，至滄洲追回。改館太醫院，懋第處之怡然。一說系弘範密通，欲身赴江南招降，故追懋第回。迨至乙酉閏六月，聞江南失守，拊心慟哭。其從弟懋泰先為吏部員外，來見勸降。第曰：『此非吾弟』。叱之出。是月十二日，與從行兵部司務陳用極、遊擊王一斌、都司張良佐、劉統、王廷佐俱被殺。懋第，萊陽人，辛未進士。父喪，三年不入內；事母極孝。其絕命詞云：『峽折巢封歸路回，片雲南下意如何？寸丹冷魄消難盡，蕩作寒煙總不磨』）。
七月，報山東濟寧薙髮歸順。馬士英薦阮大鋮知兵，有旨賜冠帶陛見；舉朝皆駭。高弘圖請下九卿會議。士英曰：『會議，則大鋮必不得用』。弘圖曰：『吾非阻大鋮。舊制京堂必會議，於大鋮更光明』。士英曰：『吾非受其賄，有何不光明』？弘圖曰：『何必言賄？一付廷議，國人皆曰賢，然後用之』。士英疏言：『魏忠賢之逆，非闖賊可比。弘圖、曰廣諸人護持局面，於所愛而登之天者，曰先帝原無成心也；於所惡而墜之淵者，曰先帝定案不可翻也』。姜曰廣疏言：『臣前見文武紛競，既慚無術調和；今見欽案掀翻，又愧無能豫寢。遂使先帝十七年之定力頓付逝波，陛下數日前之明詔竟成故紙。梓宮未冷，增龍馭之怨恫；制墨未乾，駭四方之觀聽。惜哉維新乃有此舉！臣所守者朝廷之典章、所畏者千秋之公議而已』。郭維經、羅萬象、詹兆恆、陳良弼、王孫蕃、左光先、懷遠侯常延齡、太僕少卿萬元吉、兵部郎中尹民興等，各疏諫不聽。大鋮召對，陳「聯絡、控扼、進取、接應」四策，又陳「長江兩合、三要、十四隙」，稱旨，用為江防兵部侍郎（尋而升兵部尚書，構釁，欲誅東林黨）。
禮部尚書黃道周請祭禹陵，出杭州。
濟寧飛報：檄各處地方薙髮投誠，甚急。可法請督師淮、揚，詔其即行。可法抵白洋河，行文四鎮備禦。招撫江南副將唐起龍齎攝政王書與可法，有云：『念累世之宿好，棄近日之小嫌；嚴整貔貅，驅馳梟獍。入京之日，首崇懷宗皇帝后謚號，卜葬山陵，悉如典禮。郡王將軍以下，仍其故封，恩典有加。耕市不驚，秋毫無犯。擬天高氣爽，遣將西征，傳檄江南，連兵河朔，陳師鞠旅，戮力同心，以報汝君父之大仇，彰我朝廷之厚德。不意南中諸君子，苟安旦夕，不審事機，聊慕虛名，頓忘實禍，余甚惑之。夫國家之撫定燕都，乃得之於闖賊，非得之於明朝也。賊毀明朝之主，辱及先人。國家不憚征繕之勞，代為雪恥。萬世仁人君子，當如何感恩報德耶？乃乘逆賊稽誅，王師暫息，即欲雄踞江南，坐享漁人之樂。豈江淮以南，天塹足憑，遂不能飛渡耶？況闖賊為仇明朝，未曾得罪於國家也。徒以薄海同仇，共伸大義。今若擁號稱尊，是天有二日，復為勁敵。余將簡西征之銳兵，且釋彼重誅，令為前導。夫以中華全力，受制潢池；而以江左一隅，兼支大國。勝敗之數，無待著龜矣。至於南州諸君子，賁然來儀，則爾公、爾侯，列爵分土，自有平西王之典例在。惟執事實圖利之』！史可法得書上聞。復其書云：『突聞我大將軍吳三桂借兵貴國，破走逆賊。殿下為我先帝發喪成禮，梓宮歸葬；撫輯群黎，且免薙髮之令，示不忘本朝。此等舉動，振古鑠今。凡為大明臣子，罔不長跪北面，頂禮加額，豈但如明諭所云「感恩報德」已耶！謹於八月薄治筐篚，遣使犒師；並欲請命鴻裁，連兵西討，是以王師既發。乃辱明誨，引「春秋」大義來相詰責，善哉！推而言之：此為列國君薨，世子應立，有賊未討，不忍其君之說耳。若夫天下共主，身殉社稷，青宮世子，玉石俱焚，宮殿飛灰，山陵鬼哭，宗社蒼生，數月無主，是瞻烏逐鹿睥睨神器者，當不知有幾人？若拘牽不即位之說、坐昧大一統之義，中原鼎沸，倉卒出師，何以維繫人心，號召忠義？勢不能支，乃舉祖宗之天下，拱手而擲之他人；不獨上以貽二祖、列宗之羞，下以快亂臣賊子之志。是守經泥古，徒為宋襄不擒二毛之仁；其重遺貴國之憂，當不知又何如也？紫陽「綱目」踵事「春秋」，其間特書：莽移漢祚，光武中興；丕廢山陽，昭烈踐祚；懷、愍亡國，晉元嗣基；徽、欽蒙塵，宋高纘緒。是皆於國仇未復之日，亟正位號，「綱目」未嘗斥為自立；卒以正統與之。甚至玄宗幸蜀，太子即位靈武，議者疵之，亦未嘗不許以行權，幸其光復舊物也』。又有『若乘我國運中微，一旦欲移鼎東下，而以前導命元兇；義利兼收，恩仇倏忽，獎亂賊、長寇讎，不惟孤本朝藉力復仇之心，亦甚違殿下仗義扶危之初志矣。且契丹和宋，只歲諸輸金繒；回紇助唐，原不利其土地。況貴國篤念世好，兵以義動，萬代瞻仰，在此一舉。茲乃手足之難，實同秦、越，視此幅員，為德不卒，是以義始而以利終也』云云。
高傑發總兵李朝雲防守泗州，參將蔣應雄、許占魁、許茂榮、李玉防守徐州。
九月，遣都督陳謙齎敕印封福建都督鄭芝龍「南安伯」。
十一月，豫王進師宿遷，史可法赴援，拔營去。
十二月，往北使陳洪範南還，稱『清兵旦夕即南下』。馬士英惡之曰：『有四鎮備禦，何患焉』？
順治二年乙酉（附明福王時在江南，稱號弘光元年）正月，高傑率兵防河。至睢州，總兵許定國享傑，謀殺席上。以其眾薙髮投誠（高傑於前歲九月之十日祭旗，疾風折其旗，西洋砲自裂。應廷吉私謂其友曰：『明年太乙在震，角亢司垣，始擊掩逼壽星之次，法當蹶上將。吾懼阻眾，不敢直言』。許定國，太康人，故總兵。赦罪出，毀家養士，大掠京城，負其功不得封土，出惡言詆高為賊。高由是怨許，常曰：『我見必殺』。定國聞之，遂懼）。正月十一日，高兵至睢州。定國匿其軍之壯者，率羸卒於數十里外跪馬首迎。高扶起之，曰：『許總兵奈何行此禮』？定國頓首曰：『知公怒，請死』。高曰：『公累疏指我為賊，何也』？許曰：『定國目不知書，咸假手於記室。入公之名，定國不知也。若以此殺定國，不亦冤乎』？高索記室者姓名。許曰：『彼知公之怒，先期已遁，尋之不獲。他先去，而定國不知，可見易公之名者，非定國意也』。高粗人，見其屈服，不但不憾，且憐之，遂信無疑。中有千戶馬說定國有謀。高於馬前笞五十，送許誅之。遂殺牲約為兄弟。定國飾美妹進，高屏不御。笑謂之曰：『軍中未可事女子。且蓄之，俟功成以娛老乎』？高屯大營，離城二十里。僅隨驍健三百人，十三日入城。是日，定國張燈盛席厚禮興平伯，令其少弟飲諸將於別所，婦女賓客雜坐歡飲，酒至半酣，許弟動靜失常，眾頗疑焉。對高密語曰：『定國有謀』。高推之以手曰：『去！夫何敢』？眾意亦遂坦然。三百人皆醉，別所休息。寢興平伯於睢人甲第內。夜半，壯士數十人踰垣而入。傑忽覺，索衛身鐵杖，已失。猶奪人槍力鬪，傷脅被執。定國喋血南坐曰：『三日來受屈辱於爾，今如何』？傑大笑曰：『吾為豎子所算』！呼酒來，痛飲而死。明日，日中城不開，李本深、王之綱等攻東門入。定國已渡河北去。吏部聞高實信，有「中原不可復」之痛（定國少年猛勇，手攀簷前椽舍，全身懸空，能左右換手，走長簷數遍，顏色不變。曾定河南屬邑，值流賊奄至，箭發如雨，定國立敵樓，以刀左右揮，箭盡兩斷，無一矢能傷其身者。有賊持版自護，定國射以鐵枝箭，貫入於版，死焉。賊驚遁。高欺其老，聽其謾語，遂墜術中）。
左良玉憤馬士英竊權誤國，稱天子密旨討之，傳檄云：『大義之垂，炳於星日；無禮之逐，嚴於鷹鸇：天地有至公，臣民不可罔也。奸臣馬士英，根原赤身，種類藍面。昔冒九死之罪，業已黥面為奴，剪髮為僧。重荷三代之恩，從爾狐窟白門，狼吞泗上。會國家多難之日，侈言擁戴勸進之功。以今上曆數之歸，為私家攜贈之物。竊弄威權，煬蔽聰明。恃兵力以脅人，致夫子閉目拱手；張偽旨以讋眾，俾兵民重足寒心。本為報仇而立君，乃事事與先帝為仇，不祗矯誣聖德；初因民願而擇主，乃事事拂兆民之意，何由奠麗民生？幻蜃蔽天，妖蟆障日。賣官必先姻婭，試看七十老囚，三才敗類，居然節鉞監軍；漁色罔識君臣，托言六宮備選，二八紅顏，變為桑間濮上。蘇、松、常、鎮，橫征之使肆行；檇李、會稽，妙選之音日下。江南無夜安之枕，言馬家便爾殺人；斗北有朝彗之星，謂英客實應圖讖。又有皇嗣幽囚，列祖怨恫。海內懷忠之臣，誰不欲食其肉？敵國向化之士，咸思操盾其家。本藩先帝舊臣，招討重任，頻年痛心疾首，願為鼎邊雞犬而無從；此日履地戴天，誓與君側豺狼而並命……』之句。隨分兵做三隊南下。士英懼，調劉良佐、黃得功、方國安、鄭彩、黃斌卿同劉孔昭、阮大鋮、朱大典共禦於釆石磯。史可法疏言：『良玉原不敢與君父為難，豈可調各鎮離汛？若北兵一至，宗社危矣』！不知士英蒙蔽，至此不報。
四月二十二日，豫王會肅王各進兵渡淮。史可法請救，弘光召諸臣問方略。諸臣皆請救淮揚。弘光亦以淮揚宜守，不可撤江防之兵。馬士英厲聲曰：『吾君臣寧死於清，不願死於左良玉之手』！
二十四日，豫王師猝至揚州，攻新城。可法督總兵劉肇基、翁萬裕、楊鳳翥等禦之。二十五日下午，撤圍，退二十餘里，詐稱黃蜚提兵來援。可法縋人出詢，詭說：『撥兵一千，入保城池；餘屯外作犄角』。可法信之，開西門；遂中計，可法自刎。
時左良玉正揮兵欲前，忽病死；子夢庚為黃得功所敗。豫王屯揚州，沿江設渡，鄭鴻逵帥水師禦於京口。豫王令眾編筏，張燈向鎮江；別隊從老鸛河渡龍潭。探馬飛報：『北師編筏，將乘風而南』。又報：『江中一砲，京口城壞四垛』。楊文驄來報：『江中有數筏，因架砲城下，火從後發，震倒城半垛。早發三砲，江筏粉碎矣』。士英將前二報捆打，而重賞楊使。自是，警報寂然。
五月朔日，弘光召對，諸臣無一言。王鐸請經筵講期。弘光曰：『且過端午』。至夜半，有人書一對於長安門之東西柱云：『福人沈醉未醒，全憑馬上胡縐；幕府凱歌已休，猶聽阮中曲變』！初九日，豫王令開閘放舟，蔽江而南。鄭鴻逵、鄭彩棄鎮江而遁。初十日，放三宮淑女還家。午後，召優人入內演戲，與內宦韓贊周、屈尚忠、田成等雜坐戲飲。至二鼓，弘光率一姬，韓贊周隨之，開聚寶門出奔，百官無一知者。十一早，馬士英詐稱奉太后旨，召守陵黔兵自衛奔浙。百姓共出王之明於獄，即位武英殿（之明即士英所指為偽太子者）。
十四日，豫王至。忻城伯趙之龍以之明出降。安民畢，封之龍為興國公。弘光是夜倉卒至太平府，百姓閉城不納。奔蕪湖，總兵黃斌卿已遁，匿於中軍翁之琪舟中，往就黃得功。功泣奏曰：『陛下死守京城，臣等猶可借勢作事。奈何聽奸臣之言，而輕出至此？今進退將何所據？此乃陛下自誤，非臣等之負陛下也』！居兩日，將謀幸浙。劉良佐奉豫王命追至，且招黃得功降。功大怒，單騎馳出，大罵：『良佐背主匹夫！鼓唇舌以說他人。我黃將軍，頭可斷而膝不可屈』。良佐大恨之，立令眾軍發弩，中得功喉。功嘆曰：『吾恨無力擒爾，當為厲鬼以殺賊』！遂拔劍自刎。良佐揮軍劫其營。翁之琪戰敗，投江而死。副將田雄（後為浙江提督）挾弘光投誠。光至江南，豫王置酒於靈璧侯之第，坐弘光於太子之下（太子即王之明）。酒半，王問弘光曰：『汝先帝自有子，汝何自立？既已自立，而不遣一兵討賊，於義何居？先帝遺體逃難遠來，既不能讓位，又磨滅之，於心何居』？光不能答，終席俛首，汗流浹背。
六月，豫王命世子貝勒羅托同總督張存仁（字完五，父中沖公，同進士，被戍遼東，遂籍廣寧衛學）、撫院蕭啟元、總兵田元等平浙江。馬士英奉太后至杭，浙撫張秉貞迎太后入城，士英屯兵城外。潞王謁太后，禮甚恭。英欲立之，潞王辭不可。禮部尚書黃道周奉祠禹陵在杭，劾馬士英疏略云：『大臣幸從，早夜圖維；宸陛承歡，起居定省。何至三輔遠於六飛，龍車遙於鳳輦？間關載道，險阻多嘗；此誠臣子之積愆，黔黎之巨創也！自五月十一日，距今越二旬矣，士林未知行在。而首輔馬士英擁兵自衛，迎憩西湖。士民詰問，空言聖駕在靖南黃得功軍中。馬輔誠知聖駕所在，而輕離左右，則有不臣之心！誠不知聖駕所在，而托言厚載以保其家人；則罔上苟偷，神人所共憤也』！太后覽表，欷歔而已。忽報駐防豆腐濱總兵吳志逵、黃蜚戰敗被擒，俱不屈而死。貝世子統兵至江陰，進兵嘉、湖。馬士英仍自帶黔兵，潛奉太后渡江。至紹興，原任九江僉事道王思任請斬馬士英，疏云：『士英獨掌朝綱，知利而不知害，知存而不知亡。朝廷篤信，以至於此也！今事急矣，政事閣臣可以走乎？兵部尚書可以逃乎？不戰不守，而身擁重兵，口稱護太后之駕；則聖駕獨不可護耶？一味欺瞞，滿口妄說。英雄所以解體，豪傑所以灰心也。及今猶可呼號泣召之際，太后宜速趣上照臨出政，斷酒絕色，臥薪嘗膽；立斬士英之頭，傳示各省，以為誤國欺君之戒』。又遺書與士英，有：『叛臣至，則束手無策；強敵來，而先期已走。致令乘輿播遷，社稷坵墟。閣下謀國至此，即啄長三尺，亦何以自解？以今上計，莫若明水一盂，自刎以謝天下』。又有：『吳越乃報仇雪恥之國，非藏垢納汙之區也。職當先赴胥濤，乞素車白馬以拒閣下』。士英得書，愧憤不能答。貝世子至，浙江鼎沸，各自為計。獨潞王不去，曰：『禦者無力，逃者非策，適足以殘生靈。不如降為上策，庶百姓得安』。六月十三日，舉城降。貝世子厚禮之。入城安民。率師至江邊，見波浪滔天而無舟楫，難以飛渡。徘徊之際，見一白鬚翁，手執藜杖，竟從水中渡過。世子訝曰：『人既可渡，豈我師不可渡耶』？遣人下探，水僅沒脛，即揮全軍渡過。登岸，往試其深險，汪洋弗可言。當時有『火燒六和塔，沙漲錢塘江』之讖。貝世子遂分兵追趕星散餘師。紹興將空其城，獨鄭之尹子遵謙出家帑，糾集鄉勇，會張國維。維曰：『事急矣！無主不可以號召天下。魯王在臺州，宜迎監國』。遂與方逢年、林廈卿、宋之普、陳函煇、熊汝霖、孫嘉績、鄭之尹等，於閏六月望日迎魯王監國於紹興府（王諱以海，字巨川，別號恆山，又一號常石子。太祖第九子檀，封山東兗州府，為魯王。王其十世孫也。崇禎六年七月，封王為鎮國將軍。十五年，兗州陷，兄魯王，以派、以洐、以江及王長子、三子同日遇害，鎮國夫人張氏以磁器觸喉死。撫臣題請，下部議覆，應繼王位。冊使甫出門，而北京陷。弘光立，移封浙江臺州府）。封方國安荊國公，守嚴州；張鵬翌永豐伯，守衢州；鄭遵謙義興伯；王之仁武寧伯。賜張國維上方劍，便宜行事，督師江上。維見諸師主帥各治其軍，疏請於王，略曰：『克期會戰，則彼出此入，我有休蕃之逸；而攻堅搗虛，人無應接之暇，此為勝算。然必連諸帥之心化為一心，然後使人人之功罪，視為一人之功罪』。遂會方國安率王國斌、趙天祥、湯斌、李應世等與貝世子大戰於草橋門。忽風雨暴至，火砲弓矢俱濕，各收兵。貝世子沿江築木城下營，對江相拒。
夏五月，大清兵至杭州。黃道周、曾櫻、何楷、郭朝汾、黃景昉，蔣德璟、路振飛、張家玉、朱繼祚等逃入閩。鎮海將軍鄭鴻逵、總兵鄭彩俱陳師江口。而唐藩從河南逃難至，逵、彩請見。語及國難，泣沾襟袂。二人奇之，令副將江美鰲（字龍弼，泉之同安高浦所人。復改文職，任廣東連平知州，投誠）、鄭升帶兵衛之入關。逵、彩聞杭城降，撤全師回至閩省。會巡撫張肯堂、巡按御史吳春枝、禮部尚書黃道周、南安伯鄭芝龍，議立唐藩監國（唐藩，諱聿鍵，性剛直，喜讀書，善文翰，洒洒千言。初封南陽，以父騕失愛於祖端王，兩姬謀奪嫡，未得請名。及端王薨，守道陳奇瑜、知府王三桂始為請嗣。後以統兵勤王，擅離南陽，被錮。會被難，逃於江口）。黃道周執筆為諭曰：『孤聞漢室再墜大統，猶系人心；唐宗三失長安，不改舊物。豈獨其風俗醇厚，不忘累世之澤哉？亦其忠義感憤，豪傑相激，使之然也。孤少遭多難，勉事詩書；長痛妖氛，遂親戎旅。亦以我太祖驅除群雄，功在百姓；方十三葉，而屬彝驁然，睥睨神器。為子孫者，誠不忍守文自命，坐視其凌遲也。二十年來，狂寇薦驚，孤未嘗兼味而食、重席而處。北方二載，兩京繼陷，天下藩服，委身奔竄。孤中夜臥起，嘗涕縱橫。誠得少康一旅之師、周平晉鄭之助，躬率天下，以受彤弓，豈板蕩哉？今幸南安（芝龍）、定鹵（鴻逵）二大將軍志切匡復，共賦無衣。一二文臣，以舂陵、瑯琊之義過相推戴。登壇讀誓，感動路人。嗚呼！昔光武、昭烈，皆起布衣，所遭絕續，與大敵為仇；而能正言舉義，躬承舊業。況今神器乍傾，天命未改。孤以藩服感憤，間關逢諸豪傑，應節投袂。知明赫之際，神人葉謨，上天眷顧我太祖紹其子孫，猶未有艾也。書曰：「與治同道，罔不興」。傳曰：「多助之至，天下順之，得道者多助」。自六月初二日監國伊始，一切民間利病，許賢達條陳。孤將悉與維新，總其道揆，以副海內喁喁之意焉』。
唐藩監國正議出師，有艷翊戴者，咸請正位，方可號召天下。諸臣多言監國名正，出關尺寸，建號未遲。李長倩亦有「急出關，緩正位，示監國以無富天下心」之疏。惟鄭芝龍、鄭鴻逵亟請正位，不正位無以壓眾心以杜後起。遂定議。於閏六月十五日，共奉唐藩即位福州，改元「隆武」。命禮部尚書黃道周草詔曰：『朕以天步多艱，遭家末造，憂勞監國，又閱月於茲矣。天下勤王之師，既已漸集；向義之心，亦以漸起；匡復之謀，漸有次第。朕方親從行間，鼓舞淬勵，以觀厥成。而文武臣僚咸稱：「萃渙之義，貴乎立君；寵綏之方，本乎天作。時哉不可失，天命靡不勝」。朕自顧觖然，未有丕績以仰對上帝，克慰祖宗；而臨安委轡，尊讓無期，大小泛泛，如河中之水。朕敢不黽勉，以副眾志，而慰群望？稍稽載籍：漢光武聞子嬰之信，以六月即位鄗南，即以是年為建元元年，誕膺天命；昭烈聞山陽之信，以四月即位漢中，即以是年為章武元年，立宗廟祖稷。艱危之中，豈利大寶？亦惟是興義執言，系我臣庶之故也。以今揆古，即以是年為隆武元年。其承天、翼運、定難功臣，悉以次第進爵，分茅胙土。稍俟恢復，以勒勳猷。其翊運、宣猷、守正文臣，亦以次第進級，別需表章。孝秀、耆宿軍民人等，俱依前諭優給。所在山川鬼神，除淫祠外，皆遣官祭告，以示朕纘緒為天下請命之意焉』。以布政司署為大內，改福州府為天興府。以黃道周、何楷、蔣德璟、蘇觀生、黃景昉、路振飛、曾櫻、陳洪謐、林欲楫、黃鳴俊、朱繼祚為大學士，入閣辦事；張肯堂為吏部尚書，李長倩為戶部尚書，曹學佺為禮部尚書，吳春枝為兵部尚書，周應期為刑部尚書，鄭瑄為工部尚書，馬思理為通政使，鄭英為錦衣衛都指揮使，鄭芝龍為平鹵侯，鄭鴻逵為定鹵侯，鄭彩為永勝伯，林察、張明振、周鶴芝、陳霸等各為伯。分天、建、延、興為上游四府，汀、邵、漳、泉為下游四府，合兩浙、兩粵、滇、黔、晉、楚地方。隆武凡有批答，皆親為之，不假閣臣。且曾皇后性亦賢敏，頗知詩書；群臣每召對，輒於屏後聽之，共決進止。隆武同廷臣共議戰守，定兵二十萬。自仙霞關起，宜守者一百七十處，每處兵多寡不同，約計十萬；其餘十萬，演習操練，以便出師。遣兵科給事中劉中藻齎詔往浙。熊汝霖曰：『吾知奉吾君而已』。不受詔。國維曰：『同是高皇子孫，當此之際，豈可異視，而受前龍後虎之迫乎』？遂勒手疏馳上隆武曰：『國當大變，凡為高皇子孫臣庶，所當同心並力。成功之後，入關者王。監國退守藩服，禮制昭然。若以倫序，叔姪定分，在今日原未假易。且監國當人心奔散之日，鳩集為勞。一旦南面正朔，鞭長不及，猝然有變，唇亡齒寒，悔莫可及！臣老矣，豈若朝秦暮楚之客也哉』？隆武覽疏，雖止問罪之師；然閩、浙水火矣。馬士英欲謁魯王，張國維參其誤國十大罪。英懼，不敢入，依方國安。
時張國維督師奪富陽。八月，復奪於潛。雖兵馬雲集，而各治其軍，地方反受騷擾。
隆武以翊戴功，晉鄭芝龍為平國公，加太師；鄭鴻逵為定國公；林察、周瑞、張明振、周鶴芝、陳霸等，各為侯；陳秀、郭曦、楊濟時、施天福、劉全、張進等，各為伯。以御史郭承汾巡按貴州（陳秀、郭曦系芝龍舊將，命守二關。劉全系香胞弟。承汾字懋袞，別號有水，泉之晉江人、癸未進士。至己丑歲，被可望所執，不屈而死。屍棄東郊，歷月餘，顏色如故，諸獸蟲不敢犯。總兵許盡忠暗稱奇，陰令家人黑夜瘞之）。隆武召黃道周、何楷、曾櫻、路振飛、黃景昉、蘇觀生、何吾騶等諸文武入朝，會議戰守策。鄭芝龍首站東班。楷讓之曰：『文東武西，太祖定制。今鄭芝龍妄自尊大，不但欺凌臣等，實目無陛下』。龍曰：『文東武西，雖古來定制，然太祖已行之，徐達業站東班首』。道周曰：『徐達乃開國元勳。汝敢與達比乎』？龍曰：『以今日較之，我從福建統兵恢復，直至燕都，功亦不在徐達下』。楷曰：『俟爾恢復至北京，那時首站未遲』。遂互爭殿上，隆武亦無奈何，各為慰解罷。自此文武不睦（東旭曰：余讀攝政王之書，『中華全力受制潢池』；又『南中諸君子，苟安旦夕，不審時機，聊慕虛名，頓忘實禍』。閱崇禎血詔：『朕非亡國之君，諸臣實亡國之臣』！又：『賊裂朕屍，勿傷百姓一人』！則未死之臣獨無耳目心思乎？應須猛省，志切匡君報國。若天命有在，人事不臧，然後如文相國也可。乃尺寸未建，空慕虛名，共相推戴，既正大位，身為宰輔，當如蕭相國籌餉關中，以佐軍需；否則，如狄梁公汲引人才，以鞏皇國。何計不及此？徒以區區班位，互訐廷陛，此愚之所不解也！然何楷、黃道周、蔣德璟、黃鳴俊、黃景昉、林欲楫、朱耀祚、陳洪昆、王忠孝、唐顯悅、林蘭友、沈佺期、郭貞一等，皆與芝龍梓里，當痛哭流涕，導以忠義，感以貞誠：今日之事，不但東班首位，且薄天子而不為也。抑鄙芝龍出身綠林，非資格正途，不屑教誨耶？即不屑教誨，不應比肩事主；既已比肩事主，宜效藺相如朝而稱病、遇而避舍，先國家而後私仇。頑石尚可點頭，況於人乎？諸君子不顧其君以全國，徒重其禮以使氣，互相訐激，一旦芝龍拂袖，不接糧餉，群然計絀；不得已，請師募兵，請從海道。且有甚者，急而散去，致隆武孑然一身，挈後而奔。噫！是誰之咎歟？諸君子有知，不但不敢再閱崇禎帝詔語，且亦不敢再讀攝政王書也）。
九月，隆武聽知於潛、富陽之捷，即仿淮陰故事，令人築壇郊外，拜鄭鴻逵為大元帥，率周鶴芝、張明振、楊濟時、陳秀、郭曦、陳霸、鄭升等領兵五萬，諸葛倬等為監軍，出仙霞關，往嚴、衢接應張國維、方國安等恢復浙東；鄭彩為副元帥，率施天福、鄭聯、鄭斌、張進、朱壽、劉全、江美鰲等領兵五萬，以張家玉為監軍，道出五福、杉關，連江撫楊廷麟，會楚撫何騰蛟合師。
同月，張國維、方國安等與貝世子對江相拒，屢戰未分勝負。王之仁上書監國曰：『事起日，人人有直取黃龍之志。乃一敗後，遽欲以錢塘為鴻溝。天下事何忍言？臣為今日計，惟有前死一策。願以所隸沈船一戰。今日死敵，猶戰而死。明日即死，恐不能戰也』！魯王覽畢，計無所出，遂遣都督陳謙入閩，啟稱「皇叔父」，不稱陛下。隆武不悅，下謙於獄。芝龍力救。監察御史陳邦芑密奏：『謙為魯王心腹，芝龍至交。今日若不除，恐為後患』。隆武信之，夜半出片紙，斬謙於獄（弘光時，曾差陳謙為使，齎印敕到閩封芝龍「南安伯」，敕內誤寫「安南伯」。謙教龍留印換敕。謙回至浙，弘光已蒙塵。故龍與謙厚。謙系獄，芝龍力救不得。以為有虞必經門首，然後免冠請救；豈知夜半斬於獄中，有『我未曾殺伯仁，伯仁實為我而死』之句哭祭之）。
鄭鴻逵引其子肇基陛見，隆武賜姓出。芝龍聞知，次日亦引其子森入見。隆武奇其狀。問之，對答如流。隆武撫森背曰：『恨朕無女妻卿』！遂賜姓，兼賜名「成功」，欲令其父顧名思義也。封為御營中軍都督，儀同駙馬、宗人府宗正。自此中外咸稱國姓。
十月，日本國王懼芝龍威權，認翁氏為女，妝奩甚盛，遣使送到安平，即成功生母也。
鄭鴻逵、鄭彩各提師逾關，未及百里，上疏請餉，逗遛不前。大學士黃道周、何楷因與芝龍爭班位不睦。楷辭回，過烏龍江，被劫，截其耳而去。道周憤諸將不前，以其坐而待亡，不如身自出關。奏請『以師相募兵江南，江南多臣門生故吏，必有肯效死力者。且可連楊廷麟、何騰蛟等，伺動靜作進取計』。隆武允請，朝餞啟行（東旭曰：拚他七尺酬千恨，何必三年臥一樓）。道周率諸門人中書蔡春溶（有刻蔡紹謹者，誤也）、賴繼謹（有刻賴雍者，誤也）、陳駿音、兵部主事趙士超、毛玉潔等，並子弟可千人。次芋源，作責躬詩一章：
『天地何高深！日月猶循環；星宿陳其巔，動靜恆無端。舉翼不能翔，而作醯雞觀。大命一以至，不能復研鑽。鬼神欲告之，翕吸近古難。傷哉草木頹，不得留朱顏』！道周沿途招征。至延平乏糧，駐軍上疏請餉。隆武命芝龍助資。龍奏曰：『現今兩師進兵，動以千萬。餉且不足，焉有餘糧接應此未經操演之眾乎』？不與一粟。隆武無奈，惟給空劄數百道應之。道周亦以空劄付，鼓勵勸進，又得百人。進師建寧，劄崇安縣，遣人通楊廷麟、萬元吉等為聲勢。尋有以「外交諸藩」蜚書聞於隆武，武遣使馳示道周。周自陳疏曰：『臣耕無半畝，居只一椽。幸以是見憫於主上，見信於親友；然不能以是見諒於犬豕豺狼。臣於二十九日退居後堂，有人持小書云：「是舊按臣陸清源的，呈上手拆」。臣錯愕展玩，有云：「東南立主，臣當元勳」。臣驚欲死。念清源生平謹慎，何至有此。臣行年六十，無險心酖語，為兇人所仇；無奇功異能，為要人所嫉。獨恃一片肝腸，為高皇、列宗與天下黎庶共對白日耳。臣雖庸下，亦讀書至老。遭逢陛下，魚水相期，猶一月之內，四疏乞師。何至以元勳微腥，為狹邪所謗？至若子弟慕義勤王，雖天性使然，亦恐臣孤身只手，陷身絕域，每一相見，涕泗漣洳。當二十六日以前，溽暑未收，毒水四下，臣兵自延過寧，渴而谷飲，病者八九。一日下操，十隊之士，呼半不起，遂損去健將陳伯輿。念其雄略，十射九破；千筋之力，盡於盆水。四顧環堵，何能不哀！今稍稍平復，遂相對強顏勸臣出關。嗚呼，此喟喟者亦臣子也。顧曾讀書，受朝廷之寵眷，而攄憤至此。今在廷諸臣，不滌腸剖胸，誓同將卒分膽共薪；而■〈言翕〉■〈言翕〉訿訿，望影射沙，欲何為者？陛下不屑為昭烈，臣亦不屑為孔明；陛下不屑為宋高宗，臣亦不屑為李伯紀。取法不高，則庸佞狎來；視人太卑，則奸豪肆志。古今讒賊，偏中於高明；近代人才，沈淪於苟賤。惟陛下垂察』！隆武覽表，馳手劄慰之。道周遂出崇安分水關。
秋七月，道周師至廣信府。聞徽州破，遣將守馬金嶺。集紳衿父老，諭勸捐助，得萬人。乃整部署，分道進兵。遊擊黃奇壽戰捷於牛頭嶺，遂營之。其出婺源者，參將王加封失防伏兵，戰死；遊擊李忠被擒。黃奇壽聞報，援之莫及。參將李瑛、倪彪出童家坊，被馬步沖突，亦潰。參將應士瑛從間道出援，屯高偃橋。道周遂馳疏請兵，略曰：『臣今年六十有二，才能智勇，不過中人。而自請行邊，拮据關外，譬之雞然，風雨如晦，雞鳴不已。即有不寐之人，起而刀俎之，亦無可奈何而已！臣少而學道，於物無競，於人寡尤。直以出師之故，為異志所排。寡識之人，群起和之。千端百出，以阻其成；旁勾曲引，以幸其敗。或叩關門，數日不達。饑疲之眾，寧死中野？臣何所營而坐困於此哉？臣遭會風雲，甫及一月，五疏求去。直以皇上英武洞燭遐邇，嘗鑑臣於言語形跡之外，所以荏苒焦嘵，瘁毛鎩羽，以為朝廷守一日藩籬。非曰能之，亦各盡其義而已。今敵之來者，日以壓境；眾之附者，日以攜志。蠢冥何知？惟利是視。貪生怖死，則前後異致。信州閭巷，雞犬方集，今復翻然欲舍而去已。據徽人來者咸云：敵一百六十騎守婺源，又五百騎守婺境，自海口煖水焚掠殆盡。煖水距廣信百餘里。臣師屯八都者僅千五百人，皆村落新募，月食一兩之卒。其東出馬金嶺者，僅七百餘人。又千二百人西去饒、撫，馳收未回。所餘帳下千二百人而已。臣自八月以來，東弭臺、寧之釁，西消金嶺之孽；精力疲於文告，歲月馳於期會。未有一智一謀佐於其內，一膂一力助於其外；空以老瘁，一意報主，為愛己所憐、異己所笑。今事勢甚急，可亟命方國安以一萬之眾，從嚴州出老竹嶺，直搗徽州，乘其西馳，可以破敵。即不然，亦可解信州之危，成牽制之勢』。隆武覽表，無以應之。道周計窮。
十二月，集門人諸將議曰：『敵人雖眾，虛聲耳。若延來春，則彼弓弛馬懈，即可破也。奈糧餉不足何？與其半途潰散，廢卻前功，不如決戰以報朝廷』。相持泣下。復進兵攻婺源。至童家坊，忽報樂平已破，信州士大夫各致書迓道周。道周以成師既出，義不反顧，遂鼓勵諸門人帥義師千餘人以前。次明堂里，僅三百人，馬十匹，糧三日。又移軍婺城之十里。天微曙，報提督張天祿率兵四至。道周策馬揮賴繼謹等督師鏖戰。參將高萬榮請於道周曰：『當引兵登山，憑高可恃』。道周從之。正移師間，一隊騎兵，從間道突出，箭如雨。軍遂亂，道周被執。輿至婺源，張天祿親至勸降。道周罵不絕口。繼而門人蔡春溶、賴繼謹、趙士超、毛玉潔亦解至。道周絕粒斷漿，作自悼詩八章：
『昔時為柳下，今日見薇陽；此道原無可，於生亦不傷。雲霓人絕望，金石鬼劑香。莫信惠連後，遂無日月光』。
『樂毅未歸趙，魯連不入秦。兩書傳白璧，只手動青蘋。行止吾何憾？微名世所親。蒼茫樵採者，不易寫啼麟』。
『自我甘重繭，為誰賦鼓刀？全生憐七獲，結侶失同袍。此事不經見，於心良獨勞！長年耽正則，垂老重離騷』。
『已發英雄嘆，仍多親戚憐。經營文謝後，可在殷房前。夫子寧欺我？長文尚有天。春秋二百載，研淚紀新編』！
『求仁何所怨？失道未忘愁。故主日初旭，餘生烏自投。斷崖千尺網，一葦大江舟。狂稚看吾獨，馳驅答眾尤』！
『天步憑誰仗？狂瀾失一壺。麟心衝駟鐵，鳳掌落雕弧。干羽柔無力，旗常凍自枯。逍遙河上老，頗憶鄭大夫』。
『匡坐慚顏閔，抒籌負管蕭。風雲生坐次，毛羽合飄颻。大廈難棲燕，江橫卻斷橋。可憐委佩者，晏晏坐花朝』！
『聞言誰敢信？屢卜轉多疑。截指留軍令，開心割子期。千金修駿冢，三尺斷鍪旗。射兕當熊意，君王安得知』？
左右承貝勒、洪承疇命，命侍者跪進茶一杯。道周接在手，躊躇未飲。左右懇曰：『求相國用清茶一杯』。道周因聽「清茶」二字，遂擲杯於地，亦周薇、周粟之義也（俗無果泡茶，名曰「清茶」。東旭曰：余戊午歲會陳駿音於粵之韓江，年八十有奇矣，問及石齋先生事。駿音涕泗沾襟曰：『我，先生之罪人也。死無以見先生於地下！當先生至明堂里，知事不可為，志決來朝。恐一生事業泯滅，遂將所有稟疏詩文書札悉交駿音，令連夜從間道還家。夫人偵知往索，詭應無有。辛卯夏，攜出姑蘇，欲梓行世。不意至杭之江口，是夜鄰家失火；駿音驚惶逸出，行李灰燼。既不得同時受難，名流後世；又不能表揚遺烈以闡師德，誠先生之罪人也』！語畢又哭。余亦惻然。故余知先生甚詳，且惜先生一腔真血之不盡傳也）。
原禮部尚書兼文淵閣大學士傅冠從江西入閩陛見。詢方略，條陳稱旨。詔為湖南總督，賜上方劍，便宜行事，督師恢復。至邵武五福關，餉告匱，軍不得前。屢疏請，不報。兵部職方清吏司江隨疏言：『傅冠擁兵糜餉，玩敵擾民』。寇連四疏稱不才，告辭解權。隆武詔杖，隨免冠謝事；遂住於泰寧縣（傅冠字元輔，別號寄庵，江西進賢人。初名元範，中萬曆丙午舉人。改名冠，中壬戌進士。至崇禎己卯，乞休歸里。弘光乙酉，闖黨王得仁入進賢，拔其家，取其積藏，殺其嫡孫傅鼎，故冠入福建）。
魯王大犒將士，每早銀二錢，責限過江，攻取杭州。張國維、方國安、王之仁等於五更，從朱橋、范村、六和塔、張家山、五雲山、入盤嶺等處，列隊進攻。熊汝霖、孫嘉績、鄭遵謙等從牛頭堰，列隊合進。張存仁同撫院蕭起元分撥朱馬喇、腦因多利、合托幾什哈、田雄、張杰、馬得功、常進功、王進功、王之綱、巴成功、楊佐、孟全勝、徐登華等分路迎敵。腦因多利陣斬王明義，諸軍咸遁。
豫王遣朱術珣、邵承堯、陸萬治、故翰林陳于鼎、總兵王所召、黃兆龍到浙招撫張國維等。張存仁以術珣系明宗室，姑不論，但觀其人才幹不足稱其使，且嫌疑亦不可不慎重。其王所召等，與之面談，竟無奇謀遠大之見，尚慮陰懷投閒之宄。借端遂其歸志，縱奸如其所願，倘僨厥事，不反胎群逆所笑乎？獨陳于鼎看破局面，仰體天意，忠肝義膽，足貫金石，不特饒蘇、張之舌，而且擅班、彪之才，使於四方，誠可謂不誣其人矣。今可將王所召等撤回另用；安撫之事，留陳于鼎一人任之，庶無眾多掣肘之虞，亦免互相推諉之端。語云：『千人牧羊，不如一人驅而走之』。言其有專責也。啟豫王，王遂召諸人回，獨于鼎在浙，後為浙學院。
順治三年丙戌（附明唐王時在福州稱號隆武二年）正月，貝勒檄至，調道周赴江南。周復進水漿。臨發，作「婺源詩」三章示賴敬孺（繼謹字也）、蔡時培（春溶字也）。
『火樹難開眼，冰城倦著身。支天千古事，失落一時人。碧血題香草，白髮逐釣綸。更無遺恨處，■〈火參〉髮為君親』。
『搏虎仍之野，投豺又出關。席心如可卷，鶴髮久當刪。怨子不知怨，閒人安得閒？乾坤猶半壁，未忍蹈文山』！
『諸子收吾骨！青天知我心。為誰分板蕩？不忍共浮沈！鶴怨空山曲，雞啼中夜陰。南陽歸路遠，恨作臥龍吟』！
途至新安，上元燈節，作三章：
『為世存名教，非關我一身。冠裳天已定，得失事難陳！姓氏經書外，精神山海濱。高懸崖上月，偏照夜行人』。
『世盡遺君父，我何愛此生？焚香燒藁本，拔劍割薇蘅。苦乞西山士，遠辭東海濱，荷鋤與賣藥，難作古人情』。
『羹沸猶餘鼎，魚空守暮磯。依然城廓在，仿佛人民非！溪淺須眉照，山深薇蕨肥。黃冠黃海裏，望望未曾歸』。
又見魚龍百戲，世事不競，再絕粒。十八日，過新嶺，弔金正希詩四章：
『愛爾才名盛昔時，欲依麟閣共匡持。蕭蕭風雨雞鳴日，千古令人誦飫支』！
『續經溪口萬重山，捄爾尚差旬日間。自是岱華須破碎，嶺雲終古不開顏』！
『旋聽灘頭飛鳥斜，傷心何處動悲笳？英雄運盡無良算，身亦輕來陷左車』。
『殘棋垂手已難工，又是論人成敗中！但說丹心無所用，一時張眼念臧洪』（正希諱聲，原字子駿，休寧甌山人。隨父客嘉魚，遂籍焉。戊辰進士，授庶常，官歷修撰。乙酉，古城起兵抗王師，被擒。送江南，與參軍江天一同日斬。天一，字文石，歙之寒江村人。晚年有澄清志，與正希舉義師敗，天一呼曰：『吾與金公同舉，不可使公獨死』！挺身追及金翰林，自呼曰：『我參軍江天一也』。遂並執之）。
眾廷臣與諸當道帥師不前，不但恢復無期，且恐失備禦。蔣德璟疏請行關，確察情形，相機督戰。隆武聽之。璟至關，竟以疾去。
二月，隆武下詔親征，以兵部尚書吳春枝留守。吏部尚書張肯堂與郎中趙玉成同籍金陵，疏言：『臣等生長海濱，請以水師千人，從海道直抵君山，襲取金陵，以迎陛下』。隆武大喜，亟催芝龍造艘。龍佯諾，亦不果。隆武行，駐蹕延平。
道周至金陵，幽於禁城。既而改系尚膳監。諸當道與故知者，悉承貝勒意勸降。周曰：『吾既至此，手無寸鐵，何曾不降』？勸者曰：『欲降須薙髮』！周失驚曰：『君薙髮了？噫！幸是薙髮國打來，即薙髮；若穿心國打來，汝肯同他穿心否』？勸者慚退，道周閉目。次日，見玉梅盛開，索被襪不得，愴然作詩四章，示諸子。洪承疇承貝勒命，親詣尚膳監請見。道周喝曰：『青天白日，何見鬼耶？松山之敗，承疇全軍覆沒。先帝曾設御食十五，痛哭遙祭，死久矣！爾輩見鬼，吾肯見鬼么』？遂閉目。有欲南回者，蔡、賴、趙、毛各有家報。請命道周，周不作書。但署蔡書皮：『蹈仁不死，履險若夷。有隕自天，舍命不渝』。又署賴書皮：『綱常萬古，性命千秋。天地知我，家人何憂』？又斷粒，計有十四日，復進水漿。夜聞鐘聲，感諸舊事，書十二章。
吳炳從江西至延平，陛見。擢吳炳為福建布政司，提調棘闈。以編修劉以脩為主考，詔如兩都例，各省士子得與試。取中舉人葉瓚（福州府人，原姓萬）等二百一十七名。
三月，賜姓成功條陳：『據險控扼，揀將進取，航船合攻，通洋裕國』。隆武嘆曰：『騂角也』！封忠孝伯，賜上方劍，便宜行事，掛招討大將軍印。魯王遣柯夏卿、曹維才入聘。隆武加夏卿兵部尚書、維才光祿寺卿。遣都御史陸清源齎手書出浙東報王曰：『吾無子。王為皇太姪。同心僇力，共拜孝陵。吾有天下，終致於王。取浙東所用職官，盡列朝籍，無分彼此』。
貝勒諸王見道周抗節不屈，益重之，令人再勸。承疇亦遣門生往勸。道周書一聯：『史筆流芳，未能平鹵，忠可法！洪恩浩蕩，不思報國，反承疇』！粘疇署前。疇見笑曰：『庸儒不識時務！毋使彼沽名而反累我』。遂啟諸王，出道周於曹街。周從容自若，望南謝君恩、望東謝親恩，坐於舊紅氈，引頸受刑；乃壬子日也。同時受難者漳州賴繼謹與蔡春溶、侯官趙士超、六合毛玉潔等（黃道周字幼平，一字石齋，漳之詔安縣銅山所人。以易登天啟壬戌進士。閣部路振飛至其地，勒銅山三忠臣於風動石上：一黃道周、一陳璸、一陳士奇。奇字平人，任四川上川南副使。士奇率兵屢敗張獻忠，遷淮揚巡撫。徐而朝議，恐奇懦不知兵，以龍文光代之。已交代，出重慶，忽獻賊大至。瑞王素知奇名，留共守。奇毅然應之曰：『四川乃我舊撫。今日獻賊大至，豈盡新撫之事？推委以負朝廷乎』？遂與瑞王督軍民共守。城陷，奇罵賊不屈而死。璸字亶州，事見前。東旭曰：有客過余廬，余敘石齋先生事，見而嘆曰：『先生忠則忠矣！若為人謀國旋轉乾坤，則未敢為先生許』！予駭然曰：『公何言？先生舉動光明，柏節松操。千萬年後，流芳青史者，舍先生其誰』？客曰：『子獨未聞魏徵「寧作良臣，莫作忠臣」之語乎？況甲申之變，天崩地坼，此乾坤何等時？先生何不麻衣痛哭四鎮之庭，貞誠以感，使若輩知有君？先生何不連進諫章，痛哭流涕，請除君側之奸，以回弘光庸主之心？至其自序，召至江南，見雜沓無可共事，請祭禹陵，出居浙東，寂無一言。任馬、阮蹂躪，徒作夢高皇語謂「卿舍我去」；且對曰：「朝廷舍臣，非臣舍朝廷」之語。又製一衣，刺「大明孤臣黃道周」於裾，語弟子「南都必敗，當以識吾屍」。噫！東南半壁，多士濟濟，何謂孤臣？果識其敗，明系袖手旁觀，蹈文人舌筆欺愚後世。繼又失策，不奉其君於豫章，居中調度，同楊廷麟徵湖南之何騰蛟、東川之曾保英、兩粵之丁魁楚、滇黔之李定國，運籌備禦，策畫糧餉。而如在蜀者請入蜀，在吳者請入吳，乃姑息從事，偏安閩土，正蘇老泉所謂「惟賢者能致不賢，非不賢者能致賢也」。故能容人者，然後能用人；雖汙身降志，士君子亦當先受其過耳。何不降志相從，以保其社稷，而為過激附會作老道學？殺陳謙不出一言，致中漁人之利；議親征不決其行，作離盜跖之漸。輔佐王猷，未有其人；折衝禦侮，未有其人。以出師為兒戲，稱江左多臣門生故吏，必有應之。是薄其君父，德澤不施於天下；重其縉紳，恩惠可結於門黨。一木欲支大廈，毛錐欲去禦敵。過建水，稱五月渡瀘；弭金釁，仿六出奇能。又表稱「不屑為孔明、伯紀」，不但不能曲突徙薪；抑且不能作焦頭爛額。春秋責備，是誰之咎？故張國維激憤曰：「誤天下者，文山、疊山也」』！予曰：『公之論固是；但時勢不同，亦責人所難。先生孤掌難鳴，獨木難支。況天命有在，亦不得已之極，思惟有盡其臣衷而已』。客曰：『子之言謬矣！夫武王伐紂，夷、齊叩馬而諫。諫不聽，然後去首陽。聞譏周薇，不食而死。未曾以不諫而去首陽也。盡臣節者，夷、齊耳』！予曰：『不然，公之評先生若何』？客曰：『先生特博學鴻儒，繼道統，尋乾淨死地，完讀書之名，全生平之節而已』）。
貝勒世子大驅舡只，開堰入江。張國維遣王之仁統水師，半渡襲戰。會南風大起，之仁揚航奮擊；國維又督諸軍渡江以應，大捷。適陸清源齎手書報王，並齎詔至江犒師。時馬士英依方國安，唆國安殺清源，且為檄數隆武罪。國維聞之，嘆曰：『自相戕毒，禍不遠矣』（隆武曾斬魯使陳謙，國維故云）！
忠孝伯賜姓成功叩陛，辭回安平。隆武曰：『卿當此有事之際，何忍舍朕而去』！成功頓首曰：『非成功敢輕離陛下。奈臣七歲別母，去秋接到，並未一面。忽爾病危，為人子者心何安？以其報陛下之日長，故敢暫為請假。稍愈，臣即兼程而至』。隆武允成功馳驛省母，准假一月。成功謝恩，出歸安平。
貝勒因江上之戰不得取勝，悒悒不已。招撫江南經略洪承疇與招撫福建御史黃熙胤獻策曰：『唐藩雖然稱帝，但兵馬錢糧，悉出鄭芝龍手。不如密書賂彼，若全舉版圖，許以王爵，則彼自棄暗投明。福建可不勞一矢，浙中諸醜俱散』。貝勒大喜曰：『二公所論極高，計成，開國第一功也。宜速行，勿滯』！一面按兵；一面著熙胤同承疇修書入閩（承疇號亨九，壬辰進士；熙胤辛未進士，皆泉之晉江縣人）。芝龍因廷爭拂意，雖奉詔諭，口應心違。
四月，隆武見諸帥不前，責芝龍攬權逗兵。龍免冠頓首曰：『臣武夫，賦性戇直，不能逢迎。今既見疑陛下，安敢負此重擔？情願角巾私第，以終聖世』。隆武曰：『朕之大事，悉以委卿，豈疑卿乎？但人有言，不得不為卿道耳』！固留之。下詔切責兩帥：『倘畏縮不前，有國法在』！鄭鴻逵、鄭彩雖出關，仍上疏請餉，逗留如前。
芝龍接承疇、熙胤書許以三省王爵，決意投誠。不通其弟鴻逵、子成功，即馳札泉州，召熙胤子志美（乙卯舉人，後官粵東南海知縣）謀復書，有『遇官兵撤官兵，遇水師撤水師。傾心貴朝者，非一日也』之句，交志美。美密遣老蒼頭送出浙江與承疇、熙胤。廷臣會議出江西會楊廷麟，未果。鄭芝龍疏稱：『海寇猝至。今三關餉取之臣，臣取之海。無海則無家，非偏征不可』。拜表即行。隆武手敕留之曰：『先生稍遲！朕與先生同行』。使者奉敕至河，芝龍已飛航去矣。且密諭與守關將施天福（字昆玉，泉之同安人）、郭曦（漳之龍溪人）、陳秀、周瑞等撤關兵。
貝勒以長江未易渡，遣一旅從紹興別道奪盤山關，以分其勢。守關總兵盧若驥（泉之同安縣人）會諸將堅壁死守，屢攻不下。相持兩月，適韓固山平左夢庚，用降將劉孔昭為鄉導，滿漢齊集。若驥兵寡糧匱，遂議決戰，大開關門出敵。後營副將周茂首先沖殺，被箭傷死，若驥復收殘兵入關。諸將見勢逼援無，請投誠。驥忖人心已離，夜半率子弟親隨三百餘騎，棄關從溫州渡舟山。固山統大軍定臺、溫、福寧，會師福州。
魯王知國安殺清源，恐閩發兵問罪，遂抽師令國維西禦。起禮部尚書余煌兼兵部尚書，代國維督師江上。因此江上之師單弱（余煌字武貞，浙江山陰人。天啟乙丑狀元。入史館，直言忤時，以禮部尚書假歸；弘光屢徵不起。貝勒世子平浙時，整衣冠欲死；為義師鄭咸一救之，勸其共事魯王）。
五月，招撫經略洪承疇、黃熙胤接芝龍復書，遂啟貝勒。貝勒揮南北岸軍齊進，用火砲攻方國安營壘。適國安食，一砲擊碎其席，並廚灶無有完者。安嘆曰：『此天奪吾食也』！又見北岸兵勢強盛，於五月二十七夜與馬士英、阮大鋮潛劫魯王而南。次日，諸帥聞知，各潰散。鄭遵謙移資入海，獨王之仁一軍不動。國維與之仁相議抽兵五千，分守各營。之仁泣曰：『壞天下事者，方荊國也（國安封荊國公）！北岸屯師數十萬，倏然而渡，孤軍何以迎敵？之仁有舡可入海。公兵無舡，速自為計』。國維不得已，乃進旅追扈魯王。王為國安、士英所困，欲挾入關獻功。適守者病，王得脫，遇張明振、張斌卿，安於普陀寺。明振等船泊穿山港，後被總兵張杰同援剿總兵王之綱所擊，始揚帆遁入舟山。登海舶，聞國維至黃石巖，傅維遏防四邑。維提師行，凡欲過之橋，業為國安斷矣，不得進。
六月，貝勒師將至紹興。督師余煌放城中婦女，出匿山谷。正衣冠，北向叩首，出東門渡東橋，赴水死。陳函煇、鄭之尹、王思任、吳存魯、陳潛夫、葉汝衡、高岱等皆死之。張國維聞義烏破，眾勸維入山。維曰：『誤天下者，文山、疊山也！一死而已』。報貝勒師至七里寺，國維正衣寇，南向再拜曰：『臣力竭矣』！作絕命詩曰：『艱難百戰戴吾君，拒敵辭唐氣勵雲。時去仍為朱氏鬼，精靈嘗傍孝陵墳』。從容赴園池死。興國公王之仁載其妻、妾、二子、二婦、幼女、諸孫，盡沈于蛟門下；捧所封敕印，北向再拜，投之水。獨至松江，峨冠登岸，百姓駭愕聚觀。之仁從容入見內院洪承疇，自稱：『仁系前朝太師，不肯身泛波濤。願來投公，死於明處』。勸薙髮，不從。於二十四日慷慨就刑。
七月，貝勒、張存仁統滿、漢平服紹興諸處，有原吏部尚書商周祚、兵部尚書邵轉忠、太僕寺卿姜一洪、兵科給事中謝秦宗等薙髮投誠。惟閣部朱大典據金華府，貝勒用元真勾合紅衣砲攻擊。十六早，城破，大典同其子萬化縱火自焚死。師至衢州，永豐伯張鵬翼守衢州，部將秦應科為內應，鵬翼戰死；樂安王、楚王、晉平王、督學御史王景亮、知府伍經正、推官鄧巖忠、署江山知縣方召皆被殺。馬士英、阮大鋮、方國安、方逢年等擁兵數千，疏請入關。隆武以其罪大，不許。走臺州，韓代追之，總兵葉承恩、李發叩馬迎降。士英計窮，遁入臺州山寺為僧。阮大鋮、方逢年同新建伯王業大、總兵陳學貫、任和、高猶龍、黃明卿、高懋明、徐大錦、邵思績等皆薙髮投誠。徐而士英被獲，同總兵趙體元解至，與刑部尚書蘇壯，貝勒俱令隨內院辦事。
守關將施天福等接芝龍密諭，遂聲言乏餉枵腹，難以禦敵，盡撤兵四潰。掠至建寧，按院鄭為虹與科道黃大鵬閉城，發倉庫犒賞，歡聲而去，一郡得全。
八月十三日，掛征南大將軍印貝勒羅托、總督閩浙張存仁、撫院佟國鼐統滿漢，從衢州拔營平閩。師次漁梁，郭曦、陳秀獻仙霞關，貝勒從容渡嶺。鄭為虹按浦城，百姓請降。虹曰：『不可』。再請，虹執決不可。眾背虹獻城，擁為虹見貝勒。令之跪，虹仰天大笑，不屈。貝勒嘉其從容節操，不忍害，勸其薙髮。為虹曰：『負國不忠，辱身不孝，忠孝俱虧，生我何為？寧求速死，髮不可薙也』。明日復令見，責其輸餉；虹曰：『清白吏何處得金』？百姓爭欲代輸，虹以民窮財盡答之。大罵，奪刀自刺胸膛見殺（虹字天生，江都人，癸未進士，百姓哀之，為立祠）。時有民謠曰：『峻峭仙霞路，逍遙軍馬過。將軍愛百姓，拱手奉山河』（將軍，指鄭芝龍也）。
隆武知仙霞失守，芝龍又去，獨立無靠，遂決意幸贛。於八月二十一日啟行，從者惟何吾騶、郭維經、朱繼祚、黃鳴俊而已。二十三日，貝勒至延平，知府王士和縊死。詢土人，知隆武由汀州欲遁江右，遂遣總兵李成棟領師追之。貝勒提大師至福州。禮部尚書曹學佺（字能始，乙未進士，福州人）奔鼓山，向佛前問休咎。甫拜下，見繩一條。佺急取袖之，馳回家。將書案四，立改為棺。整衣寇題壁云：『生前一管筆，死後一條繩』！投筆自縊。通政使馬思理縊死，侯官縣貢生元綸不食死，閩縣民趙節拜辭父母自縊，指揮使胡上琛飲藥死，一妾同死（琛字庫公，福州人），齊巽不屈被殺（字望子；時有『八閩齊望子，金雞第一聲』之稱）永福武舉趙子章死。
貝勒入城，安民畢，遣韓代、提督趙國祚、總兵孟全勝、王之剛、副將楊佐、王進功、王邦俊等領兵平興化、泉、漳等府。守興、泉總兵陳天榜、茅一經，薙髮投誠，守漳總兵劉文謙同黃光煇、武剛伯陳秀、靖安伯郭禧、亦薙髮投誠。獨安平為鄭芝龍所踞（安平即安海），軍威甚盛，船隻齊備，不肯投順。
有原巡撫劉中藻，乘貝勒全師入閩，起兵破慶元縣，聲勢大振。蕭起元同提督陳雄，知會張存仁，仁飛檄駐防總兵馬得功、副將李榮、楊虎，合副將袁仲等星馳進剿。中藻率總兵葉司孔等列陣三十餘里迎敵，我師奮勇殺勝，追至城下，閉門固守。得功傳令，乘其未備攻城，城上矢石如雨。楊虎、袁仲分頭奪上城，生擒葉司孔，中藻自縊。
黃斌卿乘潮犯寧都東門江口，張杰親督副將常進功、參將閻進功，自巳至酉，大戰未分勝負。後因副將李讓被杰陣殺，遂敗遁。韓代馳報，貝勒遣投誠兵部尚書郭必昌持書招之（昌字太徽，己丑進士，泉之晉江人），其略曰：『吾所以重將軍者，以將軍能立唐藩也。人臣事主，苟有可為，必竭其力。力盡不勝天，則投明而事，乘時建功，此豪傑事也。若將軍不輔主，吾何用將軍哉？且兩粵未平，令鑄閩粵總督印以相待。吾欲見將軍者，商地方故也』。芝龍得書大喜，厚待必昌，遣員同必昌進降表。其子成功勸曰：『吾父總握重權，未可輕為轉念。以兒細度，閩粵之地，不比北方得任意馳驅，若憑高恃險，設伏以禦，雖有百萬，恐一旦亦難飛過。然後收拾人心，以固其本。大開海道，興販各港，以足其餉。然後選將練兵，號召天下，進取不難矣』。龍曰：『稚子妄談！不知天時時勢。夫以天塹之隔，四鎮雄兵，且不能拒敵，何況偏安一隅。倘畫虎不成，豈不類狗乎』？成功曰：『吾父所見者大概，未曾細料機宜；天時、地利，有不同耳。清朝兵馬雖盛，亦不能長驅而進。我朝委系無人，文臣弄權，一旦冰裂瓦解，釀成煤山之慘。故得其天時，排闥直入，剪除兇醜，以承大統。迨至南都，非長江失恃，細察其故，君實非戡亂之君，臣多庸祿之臣，遂使天下英雄飲恨，天塹難憑也。吾父若藉其崎嶇、扼其險要，則地利尚存，人心可收也』。龍曰：『識時務為俊傑。今招我重我，就之必禮我。苟與爭鋒，一旦失利，搖尾乞憐，那時追悔莫及。豎子渺視，慎毋多談』！成功見龍不從，牽其衣，跪哭曰：『夫虎不可離山、魚不可脫淵；離山則失其威，脫淵則登時困殺。吾父當三思而行』！龍見成功語繁，厭聽拂袖而起。成功出，適遇鴻逵於途，告以始末。逵壯之。功遂密帶一旅，遁金門。鴻逵入，芝龍語及成功少年狂妄輕躁，不識時務始末。鴻逵曰：『夫人生天地間，如朝露耳！能建功立業，垂名異世，則亦時不可失也。吾兄當國難之際，位極人臣，苟時事不可為，則弟亦不敢虛鼓唇舌。況兄尚帶甲數十萬，舳艫塞海，餉糧充足，輔其君以號召天下，豪傑自當響應。何必委身於人？此弟深為兄所不取也』！芝龍曰：『吾弟所言，眼前之事，非長遠計耳。甲申之變，天下鼎沸，亦秦失其鹿，故清朝得而逐之，業已三分有二。若以小丈夫之氣，振一旅而敵天下兵，恐亦不量力也。不如乘其招我，全軍歸誠。正棄暗投明，擇主而事，古來豪傑亦往往有行之者。清朝正未必忍相棄耳』！鴻逵曰：『既吾兄志決，亦不可不為之慮』。芝龍曰：『人以誠心待我，我即以誠心應之，何疑焉？吾弟靜聽，俟吾單騎往會貝勒；看他如何相待，再作商量』。鴻逵曰：『吾兄已有成算，弟亦將奈何？惟有洗耳聽佳音耳』！龍令李業師、周繼武等挑選好漢盔甲鮮明者五百人隨從，刻日往省面貝勒。又差往金門，尋成功同行。功不從，上書有『從來父教子以忠，未聞教子以貳。今吾父不聽兒言，後倘有不測，兒只有縞素而已』之句。芝龍見之，嗤其狂悖。即喚季子渡同行。
貝勒得必昌復命，隨敕府縣接應，凡所過驛站，供奉威儀甚壯。塘汛飛報貝敕，即差官過烏龍江，遞茶遠接，又令文武郊外相迎。龍見貝勒相待殷勤，滿心歡喜。進城見貝勒，貝勒握手，歡若平生，且恨相見之晚。龍請以擅立唐藩之罪。貝勒再三安慰曰：『此足見將軍之經權有方，可為則為之、不可為則擇主而事。況兩粵未平，海濱地方非仗將軍熟識，未可一旦而奏膚功。今日得見，實朝廷之福，將軍休疑慮焉』。龍頓首稱謝，遂薙髮。大開筵宴，賞賜倍厚。貝勒密與諸內院議曰：『聞芝龍平生桀黠多智，好持兩端。今大隊不來，而單騎至此，實有觀望之意。古云「擒賊擒首」，若縱之去，恐有意外之慮，以貽生靈憂。不如乘夜召其陛見，挾其北上；則蛇無首，其餘碌碌，無能為也』。諸內院曰：『殿下所見甚明』。張存仁曰：『不可。四方未定，當以誠信待人；芝龍今既真心相向，一旦挾之北去，恐失後來慕義向化之心。貝勒不聽，命督撫連日筵宴。至第三夜，內院到鄭芝龍寓所，傳：『有旨意，欲公陛見，面詢方略，以平兩廣』。守至天曙，即與芝龍同上北京。
總兵李成棟奉貝勒命，領兵追隆武。隆武駐蹕順昌，偵報延平追騎將至，遂率曾后等倉皇上馬。惟忠誠伯周之藩從駕，給事中熊偉率兵五百餘隨行（偉字文江，江西南昌府人，癸未進士）。中途后鞭墜地，之藩不令士卒，自下馬檢獻，親為帝后前驅。帝后不名其官，惟呼我兒，權同父子。適隆武口渴覓茶，之藩以小桶伋之進，曰：『願陛下一統』。隆武喜飲，至袍袖俱濕。抵行在。
二十七日薄暮，之藩辭欲出教場提調備敵。隆武不允，令其護衛，至三鼓回宿。五鼓上朝，到行在門首，忽聞嘈咶聲，未敢突進。停足聽之，方知帝后口角。嘆曰：『此何時也？倘敵兵突至，將奈何』？天明，隆武出視事。見之藩勤勞，加之藩總督御營。問諸輔臣，僅黃鳴俊、朱繼二一人，何吾騶、郭維經悉逸去。至關帝廟前，成棟追兵到，群呼問曰：『誰是隆武』？之藩挺身應曰：『我即是也』。問：『欲何為』？之藩詭認，殆欲脫主難耳。群矢齊射，之藩鏖戰，胸膛連中八箭，隨中隨拔去，手擊死數十人。忽腦后中兩箭，墜馬被殺。時秋暑正盛，群屍敗腐；獨之藩越九日夜面如生。鄉人奇之，收葬於汀之羅漢嶺。
隆武與后等奔至三元角，成棟追兵又至。熊偉抽劍督二十餘人向前與鬪。偉為箭傷喉，墜馬死。隆武與後逃入汀州府堂。腹飢，從者市湯員二進。方舉筋，成棟領騎兵衝入，揮箭齊發，隆武與后嬪諸人悉為射死。朱繼祚、黃鳴俊俱遭擄（東旭曰：隆武帝后死於汀州府堂，乃順治三年八月二十八日。諸家紀事，悉書隆武被執，送福州斬於市。但時有錦衣衛陸昆亨從行，眼見隆武帝后戎裝小帽，與姬嬪被難。昆亨脫出。百姓收群屍葬於羅漢嶺，豎其碑曰『隆武並其母光華太妃諱英忠烈徐娘娘之墓』。後昆亨歸鄭，繼而為僧，年八十有奇，為口述云。故特表出）。搜龍槓，書萬餘卷而已。書內夾有馬士英、阮大鋮、方國安、方逢年連名「請駕出關，欲為內應」疏，按其月日，在已降後。馳送貝勒，擒士英、國安父子與逢年，皆斬。大鋮時方遊山，聞信，自投崖下死；亦戮屍。李成棟平汀、邵等府，示令：『如有不遵制薙髮者，滅族』！傅冠寄泰寧門人江亨龍家。龍子養源見示嚴切，勸冠薙髮。冠不從。養源懼百口為冠累，遂將傅冠舁出。冠自如吟曰：『憤血已成空，往事空回首！國難與家仇，永訣一杯酒。幻影落紅塵，倏忽成今古。名義重如山，此身棄如土』。夜宿溪頭，冠私起欲投淵，為守者覺而止。又次石牛關，欲搶頭死，為送者攔護。過羅漢嶺，見新墳，問輿者。曰：『忠誠伯周之藩墓』。下拜之，泣曰：『聞道延津簇羽騎，翠花飛越五雲迷。汀州草色空迎輦，誰覆周郎裹革屍』？至汀，見李成棟。棟親解其繫，延之上坐。勸曰：『公大臣也，若遵制薙髮，棟當保公攀麟』。冠詫曰：『自冠裳以來，曾有禿頭宰相否』？棟曰：『公髮種種與禿何異？但稍加薙，以掩眾目，便可報文』。冠厲聲曰：『汝知千古有文文山乎？我鄉先進也。我頭可斷，而髮不可薙也』。棟自是不復言。然禮待甚厚，飲食與共。
廣西巡撫瞿式耜與兩廣總督丁魁楚、兵部尚書呂大器、李應茂等聞隆武受難報，設位以哭。並會議立君，承繼大統。式耜曰：『桂王相貌雄偉，舉動端嚴，賢而當立』。於冬十月十四日立桂王監國（王諱由榔，封永明王，尋晉封桂王）。以肇慶府為行宮，丁魁楚兼大學士、呂大器兼中樞大學士、瞿式耜吏部右侍郎兼內閣大學士掌銓事。正會議戰守，防設險要，忽太監王坤趨桂王暫還梧州（坤，崇禎十六年間曾督餉宣府，甚作威福。北京陷，依弘光，欲督餉閩粵，改名肇基。不果行，而弘光遁。坤入閩，隆武不用。奔粵，依桂王，奉迎趨媚，王信惑之。後為定閩王劉錫胤所逐）。時有隆武舊相何吾騶、蘇觀生遁至粵東，亦聞桂王賢而貌奇，欲到粵西以元老共立。舟次三水縣，聞為式耜所立，恥不預其議，即返棹羊城。適輔明侯林察載唐、鄧諸王航海至廣，觀生與吾騶、黃士俊會布政使司顧元鏡等共議，迎立隆武之弟諱聿■〈金粵〉入城即位，改元紹武，頒詔布告。桂王亦遣兵科給事中彭燿至廣宣諭。觀生惡之，遂潛殺耀，令陳際泰率兵攻肇慶。
桂王亦遣兵部右侍郎林佳鼎督師出禦，相遇於三水縣，戰而佳鼎失利。是晚韶州兵至，合廣兵復攻佳鼎。鼎平地未有溝柵之固，惟與僉事道夏四敷分頭鏖戰，全軍覆沒（佳鼎，興化府人，甲戌進士）。報到，丁魁楚議不即位無以壓人心而號召天下，乃自梧州迎桂王，於十二月十八日即位肇慶府署，改元永曆。以晏清為吏部尚書（辛未進士，黃州府人），瞿式耜為吏部尚書兼內閣大學士掌銓事，何三省為戶部尚書（癸未進士），黃奇遇為禮部尚書（戊辰進士，潮州府人），曹燁為兵部尚書（進士，河南人），黃日晟為刑部尚書（辛未進士，同安），井濟為工部尚書（辛未進士，河南人），郭之奇為詹事府正詹加巡撫御史（戊辰進士，尋亦擢為大學士。後永曆奔貴州安隆，奇不及同行，削髮為僧，死於繡花針，即今花縣也），王澄化為兵部右侍郎，督師至三水，連營守峽口，以拒廣兵。何騰蛟為總督，鎮衡州。呂胤錫為巡撫，治長沙。焦璉、陳邦傳各督兵，分守粵西。孫可望鎮守雲南。李定國鎮守貴州。太監王坤為司秉筆。
當芝龍暗撤兩關守兵，永勝伯鄭彩遁踞廈門。迨聞隆武亡，隨率舟師會閣部熊汝霖迎原監國魯王於舟山。王封彩建威侯、弟聯定遠伯。進取福寧諸縣，並陷興化府。王進彩為建國公，聯為定遠侯，季弟斌鎮南伯。建寧鄉紳密通接駕，踞城起義。原吏部主事林垐（字子野，號恥菴，福清人，癸未進士）潛匿山中，散家資募兵，奪據福清縣。貝勒遣副將滿進忠領兵征討。垐率眾迎敵，戰敗奔入城。追兵緊，門不及閉，回身復戰。中箭數十死，立不仆。進忠見而奇之，拜乃仆。平和縣人曾慶等，與詔安人合議起兵，立德化王朱慈燁據將軍寨，陷大田、順昌、將樂三縣。鄭聯陷漳浦縣，知縣洪有禎不屈死。貝勒督舟師出攻海壇，鄭彩率眾迎敵。戰北，遂奉魯王退居廈門。徐而復上舟山。閣部熊汝霖死，疑為彩害。
賜姓成功潛師浯洲，聞隆武帝后凶信，設位令軍民掛孝望北祭。繼又突報其父被貝勒挾而北上，從浯洲回安平，會閣部路振飛、曾櫻、萬年英等，擇日起兵誓師，有『本藩乃明朝之臣子，縞素應然。實中興之將佐，披肝無地！冀諸英傑，共伸大義』之句。用「招討大將軍印」，稱「罪臣國姓成功勤王」，出家帑犒師。以洪政、陳煇為左右先鋒鎮，楊才、張進為親丁鎮，郭泰、余寬為左右護衛鎮，林習山為樓船鎮，柯宸樞、楊朝為參軍，兼統領圍隨征；杜煇為總協理（振飛字太平，北直人。乙丑進士。原為閩撫。依成功。後從永曆死於粵東之陳村。年英字靜齋，湖廣黃州府人，原臺州通判。隆武詔至臺州，浙右張國維方輔魯王監國，各官遲疑，而詔不開。英挺身曰：『此吾君也，豈有不開之理』。遂開讀。隆武聞其事，擢英為兵部職方司主事。迨隆武亡，依成功為參軍。宸樞，福建泉州府晉江縣人，隆武曾授以參軍。督軍出關，屢有奇謀。杜煇字功參，泉之同安馬鑾人。後投誠，授粵東水師總兵。甲寅之變，又從吳三桂為湖廣水師左將軍。謀再投誠不密，被三桂姪應奇所覺，夜馳兵至，圍擒絞死）。但時金門乃叔父定國公鴻逵所據，廈門為建國公鄭彩同弟定遠侯鄭聯所據；其上海壇、南日、南北二茭、舟山等島，悉系魯王遣萬安侯周瑞、平彝侯周鶴芝、定西侯張名振、阮美等分守；其下諸島如銅山系南昌伯朱壽所踞，南澳系忠勇侯陳霸所踞。惟安平塊土，莫能展其所為，徒訓練士卒，整飭船隻，飄遊於鼓浪嶼，或入海澄、或出鎮海衛，以觀其變。