熹宗天启元年九月，四川永宁宣抚使奢崇明叛。奢氏，倮猡种也。洪武中归附，命为宣抚司，世守其土。数传至奢崇周，无子，奢崇明以族人得立。崇明性阴鸷，佯为恭顺，凡有征调，罔不应命，人渐狎之。子奢寅，有逆志，负韰惈，招纳亡命。时以边事急，征四方兵，崇明遂上疏请提兵三万赴援，遣其将樊龙、樊虎以兵至重庆。四川巡抚徐可求点核，汰其老弱发饷，饷复弗继，龙等遂鼓众反。龙走马舞槊，直刺可求，可求死，遂一拥而上，道臣孙好古、骆日升、李继周，知府章文炳，同知王世科、熊嗣先，推官王三宅，知县段高选，总兵黄守魁、王守忠，参将万金、王登爵等皆死之。原任巩昌同知董尽伦闻变，帅众入城杀贼，遇伏死。募兵科臣明时举、台臣李达、通判王天运俱负伤踰墙遁。时土兵数千，列江岸，城内炮震，城外应之。贼遂据重庆，分兵一扼夔州水口，一踞綦江、遵义，一踞泸州，一截川西栈道，全蜀震动。
奢崇明陷遵义。时遵义道臣李仙品、参将万金督兵援辽，俱赴重庆，城中守备空虚。奢崇明同其子寅帅众奄至遵义，署府通判袁任先期委城遁。贼乘势焚劫，纳溪、泸州、江安等城，兴文、永川、长宁、荣昌、隆昌、壁山皆空。贼攻合州、江津，知州翁登彦、知县周礼嘉悉力捍御，破走之。陷兴文，知县张振德不屈，率妻子赴火死。
石砫宣抚司掌印女官秦良玉勤王。秦氏世为宣抚司，良玉兄秦邦屏、邦翰援辽力战死。弟秦民屏重伤突围出，得归。时蔺贼厚遗秦氏求其助，良玉斩使留银，率所部精兵万余，同弟民屏、侄秦翼明等卷甲疾趋，潜度重庆，营于南坪关，扼贼归路。遣兵夜袭两河，烧其船以阻贼，泛舟东下。自率大兵沿江而上，水陆并进。又留兵一千，多张旗帜，护守忠州等地方，以为犄角之势。移文夔州，设兵防瞿塘，为上下声援。
十月，贼逼成都，时泸、叙诸郡邑瓦解，柙木、龙泉诸隘口俱失，贼乘势向成都，指挥冉世洪、雷安世、瞿英、周邦泰、张恺帅众拒之。邦泰先至资阳，遇贼不战，降。冉世洪等至九泉，贼驻兵山上，据高临下，众寡不敌，我兵陷阵，世洪、安世、英俱死之，张恺走免。贼兵进薄城下，悬旌僭号，四面夹攻。城内仅有镇远营七百人，调到松潘、茂州、龙安兵一千五百余人。御史薛敷政、左布政使朱燮元登陴而守。初，燮元方以辑瑞就道，蜀王出国门，与百姓遮留之。燮元慷慨自誓，贼薄城，燮元使土司坤汝常乘贼，指挥常恭等火炮助之，贼稍却，斩贼先锋一人。次日，贼数千人，障革裹竹牌进，矢石不得近，燮元命架七星炮，火箭火砖冲击之，杀数百人。至暮，贼拥钩梯数千，攀城欲上，燮元戒士卒第放炮礌石，亡哗。迟明，贼积尸陵城下。时冬，濠水涸，贼帅降民，持篾束薪，载濠土垒如山，上架蓬荜，形类行屋，以避铳石。伏弩仰射，城中垂帘蔽矢石。燮元夜缒壮士，持刍涂膏，杀守者纵火。火举山ㄨ，贼大阻。燮元又遣人决都江堰水至濠，濠满，贼乃治桥，得少息。因缉获城中与贼通者二百人，悬其首陴上。贼又于城四面立望楼，高与城等。燮元曰：“贼设瞭望，必四出剽掠，其中虚。”遂命死士五百人，突出击之。贼果无备，斩其三将，烧楼而还。当是时，诸道援兵相继至，十二月二十四日复安岳县，二十八日复乐至县，与贼战于倒流镇、石桥、永清铺，俱有斩获。各路兵或转战得至城下，或溃败去。秦良玉兵三千亦至。然贼兵亦日益增，无退意。贼围城八十余日，岁且尽，城中人伏腊不祭，王正不贺。贼城外日发诸人冢墓，城上望见皆泣。会有俘民脱归者，言贼旦夕须旱船一决胜负。
二年春正月，贼数千自林中大噪而出，视之有物如舟，高丈许，长五百尺，楼数重，簟笰左右，板如平地。一人披发仗剑，上载羽旗，中数百人，各挟机弩毒矢，牛数百头运石毂行，旁翼两云楼如左右广，俯视城中，老幼妇女皆哭。燮元曰：“此吕公交车也。破之非驳石不可。”驳石者，巨木为杆柱，置轴柱间，转索运杆，千钧之石飞击如弹丸，贼舟不得近。燮元复募敢死士，以大炮击牛，中其当轭者，牛骇返走，乘势纵击败之，然城中亦力竭矣。裨将刘养鲲言有诸生范祖文、邹尉陷贼中，遣孔之谭来约。贼将罗干象欲自拔效用，燮元即遣之谭复往，至则与干象俱来。燮元方卧戍楼，呼与饮，干象衷甲佩刀，燮元不之疑，就榻呼同卧，酣寝达旦。干象感激，誓以死报，许之，缒而出，后贼营举动，纤悉无不知者，干象之力也。踰数日，又使牙将周斯盛诈降，质其来，设伏待之。崇明果自至。甫悬一人上，松潘守兵不知，大噪。崇明走，伏起，获其从骑数人。崇明跳身免，乃谋远遁。燮元侦知，造水牌数百面，投锦江顺流而下，令有司沉舟斩筏，断桥梁，严兵以待。贼夜半果逸，干象等内变，贼营四面火起。崇明父子拔营走，干象等皆来归。成都围凡百有二日而解。贼渡泸归重庆。事闻，以燮元为巡抚。
三月，罗干象复江安。
四月，官兵复新都。初，奢贼据新都，缮城积粟为守计，因克安岳，攻保宁，声言直取潼关，人心震动，安绵副使刘芬谦、湖广监军杨述程合兵攻之。兵至牛头镇，贼以骑数千、步万人来援。秦良玉、谭大孝等夹击败之，遂复新都。贼退入兰州，复遵义府。时有湄潭叛民王伦引贼焚掠。湄潭为川、贵险要。都司陈一龙追至水西境，降之。诸军进驻遵义。时惟重庆尚为贼巢。
五月，诸军进逼重庆。初，奢崇明父子据泸、汭，倚樊龙为声援，龙盘踞重庆，已九阅月。重庆，古渝州地也，三面临江，春水泛涨，一望弥漫不可渡。其出入必经之要道，惟佛图关至二郎关一路。贼自通远门城濠至二郎关，连营十有七，宿精兵数万。监军副使丘志充、杨述程，总兵杜文焕帅兵进攻之，再战，几入其垒。翌日，文焕帅参将杨克顺等直抵贼营，石砫宣抚官秦民屏率部兵绕出其后，贼惊败，遂连复佛图、二郎二关，杀贼三千余人，积尸深沟，两岸俱平，乘胜进逼重庆。二十七日，以计擒贼首樊龙、张彤、何若海等三十一人，遂克之。
六月，川师复泸州。
七月，遵义复陷。
贵州水西土目安邦彦叛。邦彦，安尧臣别枝也。安尧臣冒陇姓，并陇地，受抚，得袭兄强臣世职。尧臣死，妻奢社辉、子安位幼，邦彦挟之反。时四十八马头与头目安邦俊、鲁连、安若山、陈其愚、陈万典等，蠭起和之。都司杨明廷以三千人败没于毕节。参将尹启易等自乌撒奔回沾益，炎方、松林皆不守，平夷卫亦为贼党李贤所破。贼围普安、安南。云南都司李天常帅兵四千救之。贼将罗应奎伪降，诱至迭水铺，伏发，全军皆没。于是交水、曲靖、武定、寻甸、嵩明之间，骚然苦兵矣。贼分遣王伦、石胜俸下瓮安，袭偏、沅以断我军。伦等，杨应龙余孽也。洪边土司宋万化纠苗仲九股，据龙里，邦彦自统蜀贼苗仲数万，进围贵州。自二月初九日薄城下，造云梯，制滚厢，筑墩台，百计攻城。抚臣李橒、按臣史永安悉力御之。贼沿山札营，四面伏路把截，以断城中出入，尽掘环城坟墓，杀掠甚惨。置木栅垒户墙，鸟雀不能飞渡。镇将张彦芳将兵二万赴援，隔龙里不得进。
贵州总兵杨愈懋、推官郭象仪与贼战于江门白杵营，死之。
安邦彦破乌撒卫，指挥管良相死之。先是，水西未叛，良相与李橒曰：“奢氏反，安必继之。黔中无兵饷，猝然有变，计将安出？宜招兵万人，积二年谷，用许成名将之，以观其变。”橒以力不能，止。后良相以祖母病乞假去，泣而曰：“乌撒孤城，且与安效良相仇，水西有难，祸必首及。良相只身无子，愿以死报国。乞图长策，保此一方。”橒亦泣。良相去，甫一月而难起。乌撒首被贼破，良相自缢死。
巡抚都御史王三善进兵平越。时平越所陈兵止万余人，副总兵徐时逢、参将范仲仁不相能。仲仁先进，遇贼于瓮城河，战不利，时逢拥兵不救，遂大败，诸将马一龙、白自强等歼焉。各处声援俱绝，贵阳围益困。城东隅有山冈，与城齐，贼踞其上，作厢楼，官兵设计烧之，火三昼夜不绝。城中粮久乏，将士病不能战。巡按史永安上疏诋王三善，大声疾呼。
十一月，三善大会将士议曰：“省城不能待矣！外援不至，吾辈死法、死敌，等死耳，尚何俟耶！”命道臣何天麟督兵七千从清水江进，为右部；道臣杨世赏督兵万人，从都匀进，为左部；三善自将二万，与道臣向日升从中路进，当贼锋。
十二月抵新添，衔枚疾走，
二日，进母猪洞。
三日，次新安。是夜，贼报至，营中惊扰，议退兵。三善曰：“退即齑粉，以死捍之！”按兵不动，卒无贼。
四日，命刘超为前部，抵龙头营。三善以身尾之，相去不二里，闻铳声，众股栗欲止。三善曰：“前驱当贼，必无退者，吾当为后劲。”遂策马而前，未一里，刘超捷音至。超兵遇先却，超下马斩二人，持刀断贼一标。贼首阿成骁勇善战，超与部兵张良俊直前斩其首，贼遂披靡。适大兵至，大呼齐进，夺龙里。贼众复大集，大战却之。
五日，住龙里城，众议去省会不远，贼必重兵堵截，宜少休息。三善曰：“我兵猝至，贼无备，不能持久，急击之勿失！”
六日，遂策马先进，众随之。贼觇者，亦知新抚自将，意有数十万兵至，相顾骇愕。安邦彦绐其众曰：“吾当增兵来助！”遂遁去。贼相率退屯龙洞，我师夺高寨、七里冲，乘胜进兵毕节铺。贼步骑如云，孙元谟将所制木发贡七门齐发，贼死无算。杨明楷率乌罗兵，如墙而进，贼大败。其渠安邦俊被铳死，弃辎重器械山积，遂乘胜抵会城。抚臣李橒、按臣史永安、学臣刘玄锡死守者几十月，旦夕城且陷，忽见贼兵奔溃如蚁，喊声雷震。俄顷五骑冲锋至城下，云：“新抚至矣！”军民大悦，庆更生。是时，三善同将卒披毡单骑冒矢石，以二万人破贼十万，橒等迎入城。三善曰：“贼兵不远，军心未定，我大帅也，不可即安。”遂营于南门外坡上。大雪。次日，移营宅溪。贼闻，远遁陆广河外。三善遣使谕奢社辉母子缚安邦彦降，不报。越数日，左右两部兵至，又十日而楚、粤、蜀之兵亦至。三善怒其后期，且忧乏食，欲谢遣之。将校皆曰：“数千里赴援，不可却也。”三善念众多，仓储空虚，欲因粮于敌。又诸军视贼过易，十二月三十日前锋杨明楷率兵渡河，札营三十里外。一军屯陆广向大方奢社辉，一屯鸭池向安邦彦巢穴。
三年春正月，贼复纠蔺贼与云南安效良等，帅众数万，并力攻陆广。杨明楷奋勇接战，蒙兵先溃，众遂乱，溺水死者数千。明楷陷贼中，贼乘胜赴鸭池，我兵退屯威清。三善收兵入城，土司苗仲见我军不利，复肆劫掠，自龙里至瓮城，尸横四十余里。
夏四月，川师复遵义。时贼首尤朝柄、杨维新、郑应显据遵义，副将秦衍祚、侯良柱督兵二千攻之，诱战于九接滩，以铳毙其渠采赛，复追败贼于南城外罗钢渡，遂克之。
贼安銮帅妻子部众降。安銮为奢寅右臂，监军道赵邦清密遣贼党了相、喻文富招之，銮心动，顾以妾石氏、子安在嵩在符国祯营，未敢发。十四日，官兵抵罗付大河口，击奢寅，败之。銮见寅败，乃密约副总兵侯良柱助兵挟取妻子。良柱分遣罗安良进陶公滩以牵贼，自帅亲兵七百人，同銮部兵夜经三寨抵贼巢，铳炮震天。贼仓卒不知我兵多少，符国祯先走，銮率妻子及部兵数千，自拔来归。
川师复永宁。先是，川抚朱燮元会众议曰：“我之久不得志于贼者，我以分，贼以合也。”于是列营纳溪，阳为进取，而阴令大兵会长宁。首攻麻唐坎、观音庵、青山厓、天蓬洞等处，乘雾夺险而入，与石砫兵会，进攻永宁。遇贼于土地坎，奢寅亲率兵搏战，我兵奋勇击败之。追至老君营凉伞铺，尽烧贼营。寅身被二枪，樊虎亦创死。复败贼于横山、八甲、青岗坪等处，直抵城下，一鼓拔之。生擒周邦泰等，降贼二万，踰城溺水死者无算。奢崇明父子列营江岸上，官兵隔水而垒，降者日至，贼复遁。
安邦彦知我兵溃，扇诱苗仲，纠合逆党宋万化等，复欲犯贵州，使其党何中尉据龙里，李阿二督四十八庄兵围青岩，断我粮道。宋万化督洪边兵苗仲为左翼，吴楚汉结八姑荡、平八庄苗仲为右翼，自统水西兵约共犯会城。王三善遣游击祁继祖统卢吉兆、左世选兵下龙里，一鼓破莲花堡，连烧上中下三牌贼寨百五十处。何中尉败逃深箐，龙里路通。遣参将王建中、刘志敏、宋迪、屈朝先等救青岩，斩首三百余级。王元佐等兵继进，焚贼寨四十八庄。李阿二中神枪，逃归水西，定番路通。谍报贼方纠八姑荡、洪边二路兵进犯会城。三善夜遣王建中、祁继祖等兵一万五千，进剿八姑荡，焚生寨二百余处，斩首五百级。穷追渡河，溺死者无算。焚其积聚数万，贼粮绝，谋遂寝。宋万化遣人诈降，觇动静。三善佯许之，而调监军杨世赏督刘志敏、祁继祖等卷甲赴之。贼仓皇出战，遂被擒，并其妻子及伪军师刘洪祖等。万化骁勇善战，邦彦倚之。至是夺气，四路既通，秦民屏兵至平越，复还守龙里，诸苗叛者相继降。三善给黄旗，使各竖寨中。邦彦望见之，不敢复出，但于鸭池、陆广诸要路，掘坑堑，修补水西，屯兵为自守计。
五月，川兵发永宁，进追奢崇明，连克红崖、天台二寨，贼数千人迎降，遂安抚红潦四十八砦。时总兵卢世卿禽伪御史汪泽远、伪参谋文道南，副将秦翼明禽伪监军夏奇云、伪给事中孔闻过等，并伪印十余，铠仗如山。又获安兵田进忠，云：“奢贼计穷，将美女黄金降水西借兵。”安邦彦遣兵十六七营，已过河到狮子山。目把曾仲英领兵六营，尚驻赤水河，谋分兵，一由镇雄兵三营乘永宁之后；一由普安入新寨，攻永宁之前。
十三日，罗干象督兵破蔺州，焚其九凤楼，扫其巢，奢贼狼狈走。
云南六佐县营长安应龙合沾益贼首补鲊为乱，围罗平。巡抚闵洪学攻罗平克之，移兵覆其巢，俘其妻子。应龙逃普安，复入乌撒。已，安效良乞降，责其缚补鲊、应龙以诱之，效良缚应龙以献。
水西蔺贼合兵窥遵、永。时蔺贼奢崇明、奢寅战屡败，穷蹙投水西，安邦彦复助兵合谋，一窥遵义，一窥永宁。官兵合长、纳两路，败之于芝麻塘，贼遁入青山。
六月，贵州总兵鲁钦等三路进兵，直入贼巢，擒土司何中尉等，进营红崖。红崖者，天台、水脚、娄石、牛酸草等七囤，素称天险，官兵未有至者。总兵张彦芳击贼于羊耳，亦败之。追至鸭池河，夺其战象，斩首二百七十余。
七月，大兵战胜，深入大埧洪红鸟冈。贼所借鸟芸等部苗，望风奔溃。三善按辔直入大方，降者千计，救出田景猷、刘志敏、杨明楷等。奢社辉、安位焚大方老巢，窜火灼堡。安邦彦逃入织金。
川兵入龙场，阵获奢崇明妻安氏及奢崇辉、蔡金贵、李廷、王承恩、张尚极等。安位母子遣汉把刘光祚赴镇远乞降，总督杨述中许之，授贼党袁绍等状，令擒奢寅父子自赎，遣之回巢。绍等至省，羁留未发，而抚按会议亦勒限安位母子，缚解安邦彦、奢寅，然后请旨治罪。大抵三善以元凶未穷，当用剿为抚，而述中一意主抚，议遂不合。三善驻大方日久，邦彦日夜聚兵自益，令其党陈其愚诈降。其愚者，目把中大猾也。三善轻信之，多与参赞军务，由是邦彦纤悉尽知。
四年春正月，王三善自大方还贵州，陈其愚相继随行。忽传其愚山后遇贼，三善勒马回视，其愚故纵辔冲三善堕地。三善知有变，将帅印付家人，嘱令护持先去，即抽袜中小刀自刎。颈皮已破，其愚下马夺其刀，猡鬼诸苗蜂拥而至。三善骂贼不屈，贼割其首去。副将秦民屏亦死之。秦佐明、祚明突围出，贼势复张。事闻，总督杨述中回籍听勘。既而监军御史传宗龙获陈其愚，诛之。其愚狡凶多计数，邦彦倚为耳目，至是伏诛。
秋七月，总理鲁钦、刘超克岩头寨，破平茶，乘胜深入，至织金败绩。
五年春，云南巡抚闵洪学复沾益。水西、蔺、乌沾三逆合兵数万，窥沾益，败走之。四川乌撒土目安效良，水西贼安邦彦肺腑之亲也，其顺逆惟水西是视。水、蔺相继叛，滇抚闵洪学以兵力不继羁縻之，令其擒贼自赎，效良亦佯为恭顺，擒安应龙以献。而所遗献功之人领文还，中途被劫。效良又见黔师出陆广，滇师入沾益，隐然有抚背扼吭之势，水、乌益成骑虎矣。至是，遂乘截黔之余焰，南向入滇，合蔺水、乌沾、安南诸部三十九营，直抵沾益。众十倍于我，副总兵袁善、宣抚使沙源等督率将士奋勇血战，对垒城下者五日夜，屡出奇兵破走之。
六年春，水西苗老虎、阿引等，杀贼酋奢寅来降。苗老虎随侍奢寅有年，着巴乃寅骑引马卒，李老松乃寅看茶卒，与寅同居聂舌埧上。寅妻在箐林山上，相去二三里。奢崇明居克仲埧，相距三百余里。寅子阿甫年七岁，一女嫁芒部。时水西约二月三路兴兵，一攻云南，一攻遵义，奢寅专攻永宁。寅素性凶淫，附过夷人妻女有姿色者强奸之，富于财者勒索其镪，不遂辄死，以此部下多往镇雄、芒部逃生。其麾下人阿引等故尝受抚臣朱燮元金钱，令图寅，与总兵利瓦伊新歃血，密谋举事。寅微觉，缚阿引拷掠之，以利刃穿其左足一昼夜，阿引至死不承，乃释之。阿引因勾合苗老虎、李明山等同谋。适奢寅与其下痛饮酣歌，登床而寝。老虎佯与寅盖絮，见寅睡方鼾，持刀砍其胸，寅大呼，李明山复助砍，身死肠出。明山刀折，伪总兵等阑入，苗老虎走，直往箐中擒寅妻，妻已闻变逃矣。贼党追苗老虎等甚急，至一碗水，遇官兵，乃降。
二月，安邦彦率众数万渡江，与我兵大战数日。总理鲁钦力御之，抵暮，贼兵益众，而我兵因子月无饷，乘夜皆溃，鲁钦自刭死。贼烧劫麻姑孙官堡，苗仲复助逆，贵州三十里之外，樵苏不行，城中大震。巡抚王瑊、巡按傅宗龙先遣王国祯等攻河沙坝猡鬼，尽俘之，广顺、定番、青岩、白纳一带，苗蛮为之夺气。继遣张云鹏逆邦彦于赵官堡，小战二日，大战二日，所杀伤者甚众。水内、水外之贼，奔走溃归，道路复通。
总督朱燮元以父丧归。加偏沅巡抚闵梦得总督，从中调度，控制五省。夏，黔兵攻匀哈、长田一带诸苗。黔中四面苗仲，而最狡悍者，无如匀哈。安邦彦初叛，围龙里、新添，皆籍其众。至是，数出没
劫掠清平、新添地方，饷道为梗。平越知府会同都司张云鹏率兵攻摆沙大寨。摆沙居寨之中，距平越百余里，乘夜由间道掩袭破之。贼遁入箐，其中米积如山。次日，搜百里大山，移营牛场箐、保文鸾，攻瓮、岳等寨，复攻都匀城西南仲贼，八路会兵入箐，各有斩获。复攻江时、户西、高平、养古数十寨，斩首二千余级，扫荡二百余里。
七年春，参将杨明辉奉命宣谕安位，令擒献首恶，为安邦彦所杀。
怀宗崇祯元年秋九月，诏起朱燮元仍总督贵、湖、云、川、广五省军务。
二年夏六月初，大方东倚播，北倚蔺，相为犄角。后播、蔺既平，贼惟恃乌撒为援，而毕节为四裔交通处。先是，王三善由贵阳陆广入大方。陆广至大方，百七十里，皆猡鬼巢窟，前可冲我，后可包我，左右可冲击我，三善卒以失地利陷。天启间，燮元建议滇兵出沾益，遏安效良应援，而别布天生桥、寻甸等，以绝其走。蜀兵临毕节，扼其交通四裔之路，而别出龙场岩后，以夺其险。黔兵由普定渡思腊河，径趋彦巢，而陆广、鸭池捣其虚，粤西出泗城，分兵策应，然后帅大军由遵义鼓行而前。寻以忧去，未及用。总督闵梦得继之，亦以贵州抵大方路险，而贼惟恃毕节一路外通，用兵宜从永宁始。自永宁而普市，而摩泥，而赤水，百五十里皆坦途。赤水有城郭可凭而守，宜结营于此。渐进渐逼四十里为白岩，六十里为层台，又六十里为毕节。毕节至大方不及六十里，贼必并力来御，须以重兵扼之，断其四走之路。然后遵义、贵阳克期并进，亦不果用。至是，燮元再莅黔，乃激滇兵下乌撒，蜀兵出永宁、毕节，扼各路要害，而亲帅大军驻陆广，逼大方。
八月，奢崇明号大梁王，安邦彦号四裔大长老，歹费、小阿、乌继、阿鲜怯等各号元帅，悉力趋永宁，先犯赤水，谍知之。燮元授意守将许成名佯北，诱贼深入，度贼已抵永宁，分遣林兆鼎从三岔入，王国祯从陆广入，刘养鲲从遵义入，邦彦分兵四应，力不支，罗干象复以奇兵绕出其背，急击之，贼大惊溃。崇明、邦彦等皆被创，汉兵斩其首献，燮元不欲穷兵，乃移檄安位赦其罪，许其归附。而位竖子不能自决，其群下复谋合溃兵拒我。
燮元乃大会诸将曰：“水西多山险，丛箐篁，蛮烟棘雨，莫辨昼夜，深入难出，以此多败。当与诸君扼其要害，四面迭攻，渐次荡除，使贼乏粮，将自毙。”于是焚蒙翳，剔岩穴，截溪流，发劲卒，驰骋百余里，或斩樵牧，或焚积聚，暮还归屯。贼益不能测，凡百余日，所得首功万余级，生口数万。每得向导，辄发窖粟就食，而贼饥甚。刘养鲲遣其客入大方，烧其宫室，悬榜而出。安位大恐，乞降。与约四事：一贬爵，一削水外六目之地归朝廷，一献杀王巡抚者首，一开毕节等驿路。安位皆受命，遂率土目纳款。燮元为奏请，诏许之。乃条陈便宜九事：“不设郡县，置军卫，不易其俗，土汉相安。便一。地益垦辟，聚落日烦，经界既正，土目不得以民不耕地渐侵轶。便二。黔地瘠，仰给于外，今自食其土，省转输之劳。便三。国用方匮，出太府金币劳诸将不足，以爵酬之爵轻，不若以地，于国无损。便四。既许世其土，各自立家，经久远，永为折冲。便五。大小相维，轻重相制，无事易以安，有事易以定。便六。训农治兵，耀武河上，使贼日备我。便七。从兵民便，愿耕者给之，且耕且戍，卫所自实，无勾军之累。便八。军耕抵饷，民耕输粮，以屯课耕，不拘其籍；以耕聚人，不世其伍，使各乐其业。便九。”上可其奏。
九年，朱燮元遣兵诛摆金、两江、巴香、狼坝、火烘五洞叛苗，悉平之，水西势益孤。又通上下六卫，并清平、偏镇四卫道路，凡一千六百余里，设亭障，置游徼，以便往来。滇中沐氏土舍普名声乱，燮元奉命移兵讨平之，名声伏诛。
十年，水西安位死，无嗣，族属争立，朝议欲乘其弊郡县之。燮元上书谏，乃止。燮元遂传檄土目，谕以威德。诸部争纳土，献重器。燮元召将吏议，以为众建土司，使其势少力分，则易制。各欲保土地，传子孙，则不敢为逆。乃上奏曰：“臣按西南之境，皆荒服也。杨氏反播，奢氏反蔺，安氏反水西。而滇之定番，弹丸小州，为长官司者十有七，二三百年未闻有反者，非他司好逆而定番忠顺也。盖地大者跋扈之资，而势弱者保世之策也。今臣分水西之壤，授诸渠长及有功汉人，咸俾世守。凡其俗虐政苛敛，一切除之，使参用汉法，可为长久计。”制曰：“可。”西南遂底定焉。
谷应泰曰：
天启中，奢崇明以猓猡种据重庆，安邦彦以水西酋反贵州，盖苗俗叛服不常，乃其天性。而两家者，又倚为唇齿，时通姻娅，所谓同功一体之人也。乃谋乱之初，则奢先而安继；穷追之日，则奢败而安亡。覆辙相寻，合若符契，小丑坠宗，于人何尤焉。以予观奢崇明阴鸷有谋，其子寅招纳亡命，一举而全蜀震动，剽锐莫当，宜非邦彦所敢望也。然而邦彦之师，尚堪持久，而崇明之众，旋即挫衄。又往往降于水西，投于安部者，则以安之地大而力盛也。奢酋窃发，止蜀道一隅。而安酋转战，西通巴、棘，南压滇、黔，又合乌沾、安南诸部落，绵亘长驱，动摇数省，此之不戢，真江、楚之深忧也。以故恢荡之功，亦以平安为首，平奢次之。平奢者，秦良玉之夜袭两河，杜文焕之佛图夺垒，卢元卿之红崖积仗，其功不可泯也。平安者，王三善之奋斩十万，秦衍祚、侯良柱之夜拔三寨，张云鹏之八路进兵，许成名之三方深入，其功更不可泯也。乃崇明、邦彦同时阵歼，奢寅淫横，内自相图，既平五洞叛傜，又开清平四卫，新设亭障，增置游徼者，凡一千六百余里。虽汉之楼船十道，西通冉駹，其盛不能及也。然其时发踪指示，出奇无穷，多出于督臣朱燮元之方略。论者以固守成都，荡灭群妖，招降安位，为燮元功不世出。而不知善后抚绥，分裂其地，使南人不复反者，皆燮元之长算也。善乎燮元之疏曰：“今分水西之壤，授诸渠长，及有功汉臣，咸俾世守。盖地大者跋扈之资，而势弱者保世之策也。”昔主父偃令宗室得分王子弟，而藩服益削，则知众建土司而少其力者，其真驭远之良规欤！