朱元璋吩咐徐达，改大都为北平府，留三万人成立六个“卫”，拱卫这个北平府，交给孙兴祖与华云龙二人指挥，徐达本人统率大军西征。

西征的最大对象，是王保保。其次，是李思齐。又其次，是张思道及其弟张良臣、孔兴、脱烈伯。

王保保这时候在太原，已于大都易手之前，被元顺帝赦免一切罪名，开复重要官爵（河南王，太傅，中书左丞相）。

徐达由今天的平汉铁路路线南下，进入山西，在洪武元年十月取了泽州（晋城）、潞州（长治）。王保保却也正在找徐达打，由太原北去，向着大都的目标走。徐达接到消息，决定不回师救大都，而贯彻原来的计划：打太原。

王保保在十二月间走到了保安州（涿鹿），听说太原丢了，慌忙选了几万骑兵回来，在太原城下扎营，当天夜间被明军偷袭，大败，溜去大同。其后，由大同移军（甘肃）定西，在洪武二年冬天围攻明军韩温部于兰州，围了几个月，徐达带了主力来到。洪武三年四月，两军在定西之北的沈儿峪对垒，一日数战。结果，王保保又吃了一个极大的败仗，被俘了八万四千五百多将校士兵，自己仅能与妻儿几个人逃走，在宁夏住了一些时，最后去到和林（库伦西南），保元顺帝的继承者、太子爱猷识理达腊的驾。

李思齐本在潼关，被明军冯宗异部吓走，退守凤翔。洪武二年三月，又从凤翔溜走，退守甘肃西南部的临洮。一个月以后，冯宗异追到临洮，李思齐投降，被送到应天（南京）。朱元璋赏他一个毋庸到任的官：江西行省左丞。

张思道本在鹿台，保卫奉元（西安）。明军一到，他溜去甘肃，扎在庆阳。其后，留下弟弟张良臣守庆阳，自己去宁夏投奔老仇人王保保，被王保保禁闭。张良臣在洪武二年五月降明，降了又叛，在八月间战败，被杀。

孔兴与脱列伯本来也是扎在鹿台的，其后于洪武二年八月攻明军某部于大同，李文忠来救，脱列伯战败被俘，押到应天，朱元璋赐他一套衣冠。孔兴溜走，被自己的部下杀了。于是在洪武三年四月沈儿峪之战以后，山西、陕西、甘肃、宁夏、绥远，都成了大明的领土。