东晋天竺三藏法师帛尸梨密多罗奉诏译
闽越金身太平寺沙门若愚述
重重叠叠玉楼台，楼阁门前叹善财。
八万四千关捩子，全凭这个钥匙开。
伏望海众殷勤，齐举压座令。
皈命敬礼琉璃光佛 南无药师光王佛大慈悲药师佛 琉璃光王佛
我佛大慈悲 琉璃光王佛 皈命敬礼琉璃光王佛 药师琉璃光王佛 满月世界
人天同听梵音声 (和)梵音声菩萨
白马驮来一部经，一回拈起一回新。
蒙师指示经题目，便是如来大藏经。
伏闻龙宫奥典，海藏灵文，摩腾远迈於西天，竺法流传於东土。出三坛之烈焰，破万种之迷津。慈风开优鉢之花，法雨洒贝多之叶。所谓道：一句云何於此经，究竟众生到彼岸。面位仁师，云何请举。
云何於此经 (四句)
梵音首唱自渔山，开道群迷咫尺间。
幽显耳闻能荐取，证无为理透玄关。
上来梵音雅唱，出生正因。不廻二乘，不向三有。廻因向果，廻事向理，廻向无上佛果菩提。伏愿群生，悉望众圣垂慈。内兴则妙用长新，外护则灵明巩固。天地正观，日月照辉。民歌太古之风，化起不善之道。三宝常住，万圣流通。常居觉照之乡，尽攀樊笼之境。四恩普报，三有均资。法界含情，同圆种智。
(普念)摩诃般若波罗密
《佛说药师灌顶经》 (和)药师琉璃光王佛
坛前教诫仪当演
梵音传自五天来，无限幽冥叹善财。
愿仗佛慈宣轨范，见闻随喜信心开。
弟子众等，稽首和南，谨白清净大众：今此修设药师延寿道场，《灌顶经》标，先伸教诫奉行科事，然後行持科事。掌坛法师，一一布露。 (入仪 浩浩难思 （至）解脱)
药师胜会启坛场，密咒清泉甘露浆。安息飞烟云雾卷，兰膏发焰日星光。
缁流济济皆精洁，贤圣巍巍尽赞扬。法雨满空甘露洒，道场何处不清凉？
甘露王菩萨
(加持安息香真言 （至）《大明神咒经》)
(加持咒油灯真言至咒水真言 诸部因缘)
(加持直字梵语心经陀罗尼)
愿凭咒力普津济 (二声)
咒水赞
一鉢寒泉，蠲除热恼，功勳莫可称量。注想曹溪水，别来几度春光。凝然湛寂，灌清净醍醐甘露琼浆。霏法雨，杨枝洒处，遍满於坛场。愿沾需，含识普蒙饶益，俱脱苦乡。饿殍焦面，悟自性真常。我今祛秽诵咒，仗密语伽陀赞扬。周沙界，无人无我，尽净获清凉。
南无甘露王菩萨摩诃萨
廻向无上佛菩提
惟愿三途苦轮息 (四句)
无边烦恼断 (四句)
药师海会佛菩萨 (云云)
酬盟会启，集福筵开。领众登坛，参礼三宝。 ([跍*月]跪诵三宝咒)
佛是三界大师，法是群生眼目，僧是六和具足，并乃真净福田。背之则凡，顺之则圣。我今皈命，建立道场。愿圣慈悲，密垂加护。
灵山教主 (入仪)
大众志诚心，同叹佛宝偈。
龙宫海藏 (入仪)
大众志诚心，同叹法宝偈。
天台方广 (入仪)
大众志诚心，同叹僧宝偈。
(加持赞叹三宝灭罪真言)
开坛门部陀罗尼 (二声)
清净三业
切以道场冰洁，众圣葵忱。金炉焚戒香、定香、慧香、解脱之真香，密语洒佛水、法水、僧水、摩诃之演水。花簇三春之锦，灯燃一汉之星。玉磬鸣时，振洪音而戛戛；金鼓响处，等梵语之锵锵。慈悲开优鉢之花，德雨润苾蒭之草。六尘内净而性识圆明，五浊外蠲而法身清净。愿鉴一诚之恳祷，当持三业之真言。先当焚香、洒净、净坛、结界、敬花，以为佛事。三业论文，谨当布露。 (入仪)
身三口四意贪瞋 (四句)
除盖障菩萨
(加持净三业真言)
三业六根悉清净
薰香供养
答报佛恩甚奇哉，本来心地豁然开。栴檀牛首无价宝，尽是能仁会里来。梵香论文，法师指开。 (入仪)
炉焚五分宝香清 (四句)
南无香供养菩萨
(加持焚香真言)
香云童子大菩萨
洒净洁涤
真渊巨海泊天高，香水浮沈湛一宽。愿证月光三昧印，大千沙界洗尘劳。广长舌相，请演波涛。 (入仪)
弥摩罗界秫提吽 (四句)
清净慧菩萨
(加持洒净真言)
坛场内外悉清净
清净香坛
一心清净万缘尘，柳陌花街功德林。能搅长河为酥酡，解教大地作黄金。玉坛蠲洁师爽襟。 (入仪)
聚沙成塔亘青天 (四句)
南无净坛场菩萨
(加持净坛真言)
雪山童子大菩萨
密语结界
大千摄化一毫端，拂手头边毛脑寒。高举金刚王正令，银山铁壁祖师关。结曼罗界，凡圣交参。 (入仪)
荆棘林中业火生 (四句)
南无金刚界菩萨
(加持结界真言)
尊胜幢菩萨
散花行道
拈花示众古机缘，特把宗门正眼传。迦叶头陀知此意，微微笑倒三千年。散曼殊胜，花雨新鲜。 (入仪)
此花初举在灵山 (四句)
南无花供养菩萨
(加持散花真言)
宝昙花菩萨
大众志诚心，同叹 (云云)
散花之设，古有常规。咒师先行点净，檀越後随捧炉。知会举起散花，大众遶坛行道。
(加持行道真言)
大众志诚心，同叹赞佛偈。 (入仪)
夫开启药师道场者，廓琉璃之境界，映满月之宫城。内则俨尔粹容，外则集乎梵侣。赞咏紫金莲相，瞻仰白玉毫光。焚百和之氤氲，作△画之道场。今则燃灯方启，法事初行，想我佛不隔於他邦，谅慈尊不离於当处。敢凭清众，各运虔心，请动潮音，举扬妙偈。 (依仪)
愿此香花云 (云云)
仰告诸佛 (云云)
如来妙色身 (云云)
如来色无尽 (云云)
如来智慧灯 (云云)
信礼佛、法、僧三宝
叹德宣疏
巍巍功德，难尽赞扬。虔奏药师礼请疏文，对圣宣读。
(化坛依仪 化纳 廻向 回坛)
(加持诸佛请座真言 （至）一切如来欢喜真言)
伏请道场者 (入仪)
(加持召请一切如来云集真言)
我施主同药师之上愿 (依仪至)歌赞
教诫终
一时登坛开启
佛开八万四千门，天上人间我独尊。
莫道满天星耿耿，犹如孤月照乾坤。
药师会启，集福筵开。领众登坛，开阐一时科事。
大众志诚心，同叹延寿偈：
长以心田种善根 (在仪)
药师海会佛菩萨
叹德宣疏 (化纳回坛)
(加持警觉出定真言 （至）五供养)
惟愿慈悲常摄受
坛前开科仪当演
药师教主愿门开，救度众生万劫灾。菡萏香风薰宇宙，琉璃光里泻楼台。
一音妙教通三界，七级银缸遍九垓。是日信心酬愿後，祥光瑞气满门来。
南无灌顶界菩萨
切以金口所宣，群生仰化，无非法药，尽是醍醐。爰将白马驼经，鸿炉试过，实昭灵验，广布华夷，大开方便之门，普济幽明之类。即我药师教主，满月慈容，因中愿力弘深，果内庄严殊胜。千莲座下，百宝珠间，花雨蒙蒙，香风飒飒，雷音向振，天乐自鸣。众圣骈罗，龙天翕集。咸沾满月，尽听法音。圣虽显示於东方，圣力常化於此土。其有群生，请按彼科仪，高烛银灯，广邀圣德，虔心请祷，我佛遥临。心中有愿皆从，非横灾殃自息。今晨灯主△，夙陈志恳，预竭诚心，祈求福海寿山，永殄千灾万虑。大阐厅堂，精严佛事。檀烟霭馥，钹韵铿锵。今则时当定日，凡圣骈交，案上经文，是何面目？竚听经文，请为宣扬。 (入仪)
佛说药师灌顶章句拔除过罪生死得度妙经
东晋天竺三藏法师帛尸黎密多罗奉诏译
闽越金身太平寺沙门若愚述
吟偈
能向法门 (八句)
闻如是。一时佛游维耶离音乐树下，与八千比丘……如是无量最上音声，施与一切无量众生，是为十二微妙上愿。
二时入坛开科
各以一切音深海，普出无尽妙言词。
尽於未来一切劫，赞佛甚深功德海。
药师会启，集福筵开。领众登坛，举扬二时科事。
大众志诚心，同叹延寿偈：
长以皈依大法王，命童晨夕炷心香。富将经藏看千卷，贵列幡花簇两行。
金相慈悲抒我愿，玉毫宛转现威光。满门和乐芝兰瑞，堂上如来步彩霞。
药师海会佛菩萨(叹德宣疏)
多他阿伽度 (入仪 宣疏 化坛 赞偈)
称念大圆镜智 (云云)
(化贡回坛)
(加持奉事诸佛真言 （至）普供养真言)
惟愿慈悲常摄受
南无消灾延寿药 (云云) 《佛说药师灌顶经》
坛前开科仪当演
药师教主广无边，七字包含遍大千。
句句重宣诸佛意，言言笑答祖师传。
佛告文殊师利：此药师琉璃光王佛本愿功德如是……是故吾今劝诸四辈，造续命神幡，燃四十九灯，放诸生命，以此幡灯、放生功德，拔彼精神，令得度脱，今世後世，不遭厄难。 (止)
二时科终
三时开科解经
三千界内慈悲主，百亿刹中大法王。
能开慧目鉴凡情，众生有愿皆感应。
药师会启，集福筵开。领众登坛，开阐三时科事。
大众志诚心，同叹延寿偈：
长生一念焚清香，命信修斋建道场。富足前生修善得，贵非今世莫思量。
金银难买般若智，玉石成堆放祥光。满苑香花迎诸圣，堂前齐祝法中王。
药师海会佛菩萨 (叹德宣疏)
(化坛 纳财 回坛 加持启白真言 （至）普供养)
唯愿慈悲 (云云)
《佛说药师灌顶经》消灾延寿药师佛
坛前开科仪当演大乘 (云云)
圆音落落三时宣，梵语重重九会宣。
竚看龙宫亲捧出，从教四海五湖传。
切以一月丽天，影含容於众水；三身应世，声普遍於十方。或称号於药师，疗众生之病若；或彰名於阿閦，解尘世之冤愆。拯昏迷於菡萏国中，蠲热恼於琉琉界内。真可谓慈风广被，慧日遐舒。八大菩萨赐恩光，二六神王垂护佑。今则谨邀法侣，重爇檀烟，燃满树之银缸，演六时之梵呗。重吟宝偈，再举鸿名。真空垂天眼以遥观，玄造拥祥光而照鉴。向下经文，再为举扬。
金毗罗神王 和耆罗神王 弥佉罗神王 安陀罗神王 摩尼罗神王 宋林罗神王
因持罗神王 波耶罗神王 摩休罗神王 真陀罗神王 照头罗神王 毗伽罗神王
救脱菩萨语阿难言：此等鬼神……此经凡有三名，一名药师琉璃光佛本愿功德；二名灌顶章名十二神王解结神咒；三名救除过罪生死得度。佛说经竟，大众人世，作礼奉行。止
灌顶章句终