「壬戌」同治元年，公五十二岁
正月，公在安庆。
初一日，内阁奉上谕：“曾国藩着以两江总督协办大学士。钦此。”又奉上谕：“曾国藩节制四省，昨又简授协力大学士，其敷乃腹心，弼予郅治，朕实有厚望焉。钦此。”
初十日，奏遵旨保皖抚大员一折。又奏再陈下情，力辞节制浙江军务一折。奏称：图浙之道。必以广信为运粮之路，以严州为近兵之路。现在惟左宗棠一军，不能遽达于严州，必俟蒋益沣之军到衢州后，两路并进，取势渐紧。所以规复浙江者在此，所以保全江西、皖南者亦在此。至臣所以再三渎陈不愿节制四省者，非因浙事既已决裂，有诿过之意。实因权位太重，恐开斯世争权竞势之风，兼防他日外重内轻之渐。机括甚微，关系甚大。又奏：遵旨保举李朝斌、喻俊明、任星元、丁泗滨等四员堪胜水师总兵之任。附片奏：前浙江巡抚罗遵殿殉难杭州，已奉旨赐恤，旋经御史高廷祜奏请撤销恤典。苛刻之论，殊欠公允。仍请从优赐恤，并将随同殉难之家属等一并旌恤，以彰忠节。王有龄以粮尽援绝，见危授命。其在任时，迭被参劾，难保无身后之訾议，请并从优议恤，以为以死勤事者劝！又片奏参安徽巡抚翁同书酿成苗逆之祸，两次失守，不能殉节。请旨革职议罪，不敢因其门第鼎盛，稍为迁就。又片奏报徽郡解围及各路军情大概。
是日，奉到谕旨，李续宜调安微巡抚，严树森调湖北巡抚。钦颁令箭、令旗、王命旗牌到营。
十一日，批饬江西藩司停止州县官吏摊捐之案。公谓地方亲民之官，必须令其旷然无累，然后可责之以民事，不至苛取民财也。
十七日，公奉到协办大学士之旨。公弟国荃授浙江臬司，蒋益沣授浙江藩司，陈士杰授江苏臬司。鲍超补浙江提督，并赏穿黄马褂。从公奏也。
二十日，左公宗棠击贼于开化县，破之。
二十一日，新购外洋火轮船一号到安庆。公出阅视，派委员弁管带，配以兵勇，于江面试行之。
二十二日，拜折恭谢天恩。附片奏称：自去秋以来，臣一门之内迭荷殊恩，感激之余，继以悚惧！垦求于金陵未克以前，不再加恩于臣家，庶可以保全功名，永承圣眷。前此迭奉保荐督抚大员之旨。封疆将帅，乃朝廷举措之大权，岂敢干预？疆臣既有征伐之权，不当更分黜陟之柄，不特臣一人为然。凡为督抚者，辨之不可不早，所以预防外重内轻之渐，兼杜植私树党之端。庶几纪纲弥肃，朝廷愈尊矣。
贼窜吴淞口，上海告急。镇江府城屡被贼攻扑。又分股渡江，扑江浦、浦口官军营盘。赵公景贤坚守湖州府城一年民余，粮援俱断，文报亦梗阻不得达。大学士翁公心存奏苏中士民结团抗贼，望曾国藩如慈父母，请饬该大臣派一素能办贼之员，驰往援剿。侍郎宋公晋条陈恢复江南大略。是时公屡奉筹画全局，派援江浙之旨。于是日具奏浙江之事，必俟左宗棠进攻严州，蒋益沣进驻衢州，鲍超进抵宁国，乃有下手之处。江苏之事，必先清江北，次及江南。现催李鸿章募练淮勇，酌拨湘军数营，驶赴下游，察看情形，再行驰奏。江浙贼势浩大，尽占富庶之区，财力与人数皆数倍于官军，不敢过求速效，以至偾事。又奏徽州官军胜仗郡城解围一折，随折奏保张运桂、朱品隆、唐义训、刘松山等十三员，阵亡参将黄和鸣等四十六员名，开单请恤。附片奏：鲍超一军在青阳大获胜仗，阵亡弁勇唐泗和第十一名请恤。又片奏：江苏绅士议借洋兵剿贼之事，上海本通商之地，借洋兵以保守人财则可，若令攻剿苏州、金陵，代复中国之疆土则不可。盖以现在攻城，而无助剿之师，将来克城，又无防守之师，专恃洋兵，洋人或见德而生怨望，不可不虑。维时上海已设立公局，会同洋人防守。公咨商巡抚薛焕，言苏州、金陵非可以幸袭而得，目前权宜之计，只可借兵防守沪城，尤当坦然以至诚相与，不可稍涉猜疑，致碍大局。其函致苏州绅士，言之尤详。
二十四日，奉到上谕：“贼氛日炽，而该大臣等章奏寥寥，南服惓怀，殊深廑念。其如何通筹全局，缓急兼权，着将一切机宜，随时驰奏，以纾悬系。钦此。”
李公鸿章募淮勇到安庆，公为定营伍之法。器械之用、薪粮之数，悉仿湘勇章程，亦用楚军营规以训练之，拨湘勇数营以助之。两省将卒，若出于一家，然公所教也。
二十六日，咨濒江各省督抚商定长江通商章程。饬善后局查办保甲，公自核定门牌团册之式。
是月，李世忠收复江浦、浦口二城。贼纠捻匪围攻颍州府，胜保公督师援之。彭公玉麟补授兵部右侍郎。
二月初二日，公拜折奏称：忝列戎行，奏报甚少，其所以硁硁自守者，盖亦有故：一则不轻奏谣传之言，一则不轻奏未定之事，一则不轻奏预计之说。因此三者，遂蹈迟延之咎。臣忝非常之遇，倚任弥重，延访更殷！嗣后拟十日奏事一次，有急则加班具奏。所有谕旨垂询之件，谨分条详复：其一，计曾国荃、杨载福、张运兰回营之期；其一，李鸿章募练淮勇，二月可以成军，拟由陆路驰至镇江；其一，攻捣金陵必先清后路，脚跟已稳，面后可进；其一，李续宜筹派兵勇，援颍州之路；其一，左宗棠援剿浙江，必从衢、严之间下手；其一，上海筹措洋兵，以助防守之法。凡六条。
饬安庆藩司核定厘金卡局支发军饷坐支章程。
初四日，阅视李公鸿章营勇及所部程学启、膝嗣林等营。
多隆阿公大破贼于庐州城外，尽平贼垒。
初五日，奉到上谕：“曾国藩奏沥陈下情，遵保皖抚各折片，具见该大臣虑远思深，实深嘉悦！己明白宣示，仍令该大臣节制四省矣！朝廷黜陟之权，原非封疆大吏所能侵越。第该大臣简任纶扉，督理江皖，膺股肱心膂之寄，朕畴咨岳牧，延访甚殷，该大臣图济时艰，不当稍有避嫌之见，方合古大臣知无不言之义。嗣后如有所知，不妨密封呈进，以备采择。钦此。”同日奉上谕：“曾国藩晓畅戎机，公忠体国，中外咸知。当此江浙军务吃紧，生民茶炭，若非曾国藩之悃忱真挚，岂能轻假事权？所有江南、安微、江西、浙江四省巡抚提镇以下，仍归曾国藩节制。该大臣务当以军务为重，力图攻剿，以拯生于水火之中，毋许再行固辞。钦此。”时又因三载考绩之典，奉上谕：“大学士湖广总督官文，久任封圻，虚怀延揽，于吏治戎行，均能整饬，着交部从优议叙。协办大学士两江总督曾国藩，督军办贼，勤劳罔懈，于江皖地方，叠复名城，战功卓著。甄拔所部将士，坚能称职，前经简授协办大学士，仍着交部从优议叙。四川总督骆秉章，前在湖南巡抚任内，剿办贼匪，不分畛域，其所荐举人才，尤为有裨实用，自升任川督，办理丹稜股匪及整顿地方，均能妥速，着赏加太子少保衔，用示嘉奖。钦此。”
初六日，专弁入都，赍奏登极贺表。
初八日，张公运兰假满还抵皖。
初九日，李公续宜抵任来见。公派提督成大吉等进军固始，以援颍州。左公宗棠击贼于遂安县，大破之，克复县城。
初十日，拜发万寿贺折，专弁入都。又代弟国荃奏谢天恩一折。
十二日，驰折奏安徽省城仍宜设于安庆。前此改建庐州，系一时权宜之计。安庆处滨江适中之地，足资控制。至大江水师战船千余号，炮位三千余尊，逐年积累，成此巨观。事定之后，江防仍不宜撤。请专设长江水师提督一员，添设将弁额缺若干，均候吏、兵二部详核议奏。附片奏：江海虽同一水面，而风涛气候各殊。楚军水勇战船，但可用之江面，未可以出重洋。臣料粤逆所掠江楚之民，必无遽能纵横海上之事。又附片奏：浙江衢河浅窄，不宜水军，江西刘于浔水师专防本省汛地，不能赴浙援剿。又奏采访忠义第六案，附片奏：委员王敬恩请恤。
十五日，公弟国荃至安庆，所募湘勇以次集于皖境。是日，奉到上谕：“江苏布政使着曾国荃补授，即赴新任，毋庸来京请训。该员系两江总督曾国藩之弟，例应回避，惟该省军务紧要，需员办理，着毋庸回避，以资得力。钦此。”又以李元度补授浙江臬司。
二十二日，拜折代弟国荃奏谢天恩。附片奏参新授臬司李元度请革职，交左宗棠差遣。又具折分条奏报军情：其一，曾国荃募勇已经抵皖，饬今进剿巢县、含山一带；其一，李鸿章带勇拟会同曾国荃，攻剿江边一路，冲过贼中，以期速达镇江；其一，多隆阿进攻庐郡大捷，伤亡亦多，需稍事休息，再图进攻；其一，李续宜派兵援颍情形，由李绩宜具奏；其一，左宗棠剿贼大捷，克遂安城，由左宗棠详报；其一，援浙之军必须蒋益沣到后，乃能合力兜剿；其一，湖州孤悬贼中，无路赴援，惟闻城中粮米足支数月，或可保全；其一，徽州解围后，改令朱品隆接防郡城，派张运兰老湘营为游击之师；其一，上海有高桥、萧塘之捷，当可保全。冯子材仍守镇江。凡九条。公出城巡阅新到之湘勇七营。
二十四日，公弟国荃启行，督军沿江岸进剿。
李公鸿章成军八千人，拟濒江而下，傍贼垒冲过，以援镇江，计未决。二十八日，上海官绅钱公鼎铭等筹银十八万两，雇洋人轮船七号，驶赴安庆，以迎李公鸿章之师。定以三次载赴上海。
是月，上海官绅借洋兵连破贼于浦东，贼少却。胜保公督兵援颍州解围。
三月初一日，扎调张运兰扼婺源白沙关，以防贼窜江西之路。
初七日，鲍公超击援贼于青阳城外，破之。
初八日，李鸿章领所部勇第一起三千人，由安庆附轮舟启行赴沪。公拜折奏谢京察从优议叙恩。又驰报李鸿章一军改由轮船赴沪启程日期一折。又驰折奏称：东南寇氛蔓延日久，生灵之涂炭深矣！臣受命两年，无一兵达于苏境，无一旅进攻宁国。左宗棠苦战衢、严，独任其难，不克分兵往助。赵景贤困守湖州，坚贞盖世，不克设法往援。徙有兼辖之名，并无统筹之实。倘蒙圣恩收回成命，俾臣稍释神魂之震惧，尤感圣慈之曲尽矣！又查广东一省，财力殷富，为东南之冠，请特派大员，驰赴广东办理厘金，专供苏、浙、皖三省之饷。附片奏：浙江殉难提督饶廷选，请于广信府建立专祠。又附片奏报各路军情。又片奏新授河南归德总兵萧孚泗，现在曾国荃军营，随同进剿；记名总兵陈由立，经河南抚臣奏调，现在鲍超军营，围剿青阳。该二员仍留原营，均未便饬赴河南。
十三日，公弟贞干破贼于荻港旧县、三峡等处，贼垒皆平。
十四日，李公鸿章所部勇第二起，由安庆启行。公派黄翼升附轮船赴上海，察看下游地势贼情。
李公续宜赴六安州督师，以规颍、寿。
十五日，公弟国荃破贼于望城岗。
十六日，鲍公超克复青阳县城。
十八日，公弟国荃破贼于铜城闸。
十九日，克雍家镇贼垒。
二十日，克巢县、含山二城。
二十一日，公弟贞干克复繁昌县城。
二十二日，公弟国荃克复和州城。鲍公超连克石埭、太平二县城。
左公宗棠剿贼于江山、常山之境，连战破之。
二十三日，公弟国荃攻克裕溪口。二十四日，攻克西梁山沿北岸贼垒，悉破平之。
公驰折奏报青阳克复，随折奏保娄云庆、冯标等二十七员，阵亡将弁罗春鹏、李遇春等十七员名，开单请恤。附片奏：水陆各军破贼于荻港、旧县、三山等处，一律肃清，阵亡将弁刘照志、王虞廷、刘华泗三名请恤。又片陈报皖浙各路军情。又具折复奏江浙绅士请借洋兵规复苏、常各属城邑，臣谬膺重寄，治军无状，致使苏省士民迫于水深火热之中，为此不择之呼吁。此皆臣之咎也！以目前之贼势，度臣处之兵力，纵使洋人转战内地，实无大枝劲旅与之会剿，尤为可愧！请饬下总理衙门照会洋人，定议于先，或不至责怨于后。又奏拟结晋承尧罪名一折。
二十七日，公弟贞干破贼于鲁港。
二十八日，鲍公超克复泾县。公札节鲍超派兵援湖州。
三十日，公弟贞干克复南陵县城，李公鸿章全军抵上海，奉旨署理江苏巡抚薛焕授通商大臣，专办中外交涉事件。诏以副都御史晏端书赴广东，办理厘金税务。
是月，金陵贼党渡江北窜，都兴阿等军击破之。
维时公统制各军，公弟国荃循江北岸，至于和州；公弟贞干循江南岸，至于南陵；彭公玉麟派水军中江而下，助剿两岸。是为直捣金陵之师。李公鸿章领湘、淮陆勇，佐以黄翼升淮折水军，突过贼境，是为援剿苏、沪之师。大江以北，多隆阿公为围攻庐州之师，李公续宜有派援颍州之师。大江以南，鲍公超为进攻宁国之师，张公运兰等为防剿徽州之师，左公宗棠为规复全浙之师。十道并出，皆受成于公。公建节于安庆，居中控驭，广轮数千里。此外，如袁公甲三及李世忠淮上之师，都兴阿公防江北之师，冯子材、魁玉守镇江之师，或不出自楚军，或不归公节制，均奉旨统筹兼顾。军书辐凑，英彦风驱，上而朝端倚畀之隆，下而薄海想望之切，洵千载一时矣！
四月初二日，张公运兰等军克旌德县城。
初四日，公驰折奏水陆各军克复北岸巢县、含山、和州三城，夺铜城闸，雍家镇、裕溪口、西梁山四要隘。随折奏保李成谋、李朝斌、刘连捷、张胜禄等二十四员。又折奏官员击败大股贼众于三山夹，乘胜攻古繁昌县城。随折奏保曾正明、黄润昌等七员。附片奏报南陵克复，统计沿江两岸克城池九座，关隘五处，并报庐州、宁国、湖州等处军情。又驰折奏鲍超一军连破贼垒，克复石埭、太平、泾县三城，阵亡将弁刘兰桂等二十四员名请恤。又奏遵查闽浙总督庆端事迹一折。
初五日，水师进攻金柱关。
初六日，公出阅湘勇操演。
初七日，巡视谷米局、火药局。
十五日，驰折奏水陆各军会克鲁港，陆师攻克南陵县城，彭玉麟驰赴下游铜陵、西梁山一带，察看进兵形势。又奏报徽州防军克复旌德县城一折。又奏江南乡试现难举行，仍请展缓酌办一折。附片请开复余述祖革职处分。
多隆阿公攻克庐州府城，贼溃走寿州。多公追击，大破之。贼酋陈玉成自投寿州，苗沛霖缚献胜保公军前斩之。
二十日，公弟国荃引军渡江南岸，会合水陆各军，克太平府城。二十一日，攻克金柱关、东梁山贼寨。二十二日，克复芜湖县城，水师进攻江岸贼垒，下抵大胜关。
公核定赈厂章程，给与饥民钱米，毋或不均。出示晓谕城厢内外居民，绥辑约束。
李公鸿章会洋兵收复青浦、奉贤二城。
三十日，奉到上渝：“该大臣调度有方，深堪嘉尚！曾国荃等宣力戎行，连克要隘，洵足以褫贼魄而快人心！若不量予恩施，将何以昭激劝？头品顶戴江苏布政使曾国荃着交部从优议叙。候选同知直隶州知州曾贞干，着赏给迅勇巴图鲁名号，以示鼓励！朝廷赏功罚罪，一秉大公，非独有厚于该大臣也！该大臣惟当督饬曾国荃等乘胜进攻，尽残丑类，同膺懋赏，毋再固辞。钦此。”
是月，都兴阿公军破贼于扬州，李世忠追击窜贼，破之。江北肃清。浙江官军收复台州府城，上海洋兵由海道收复宁波府城，浙东之贼少衰。皖北之贼由河南窜人陕西境，陕中乱作，回民交讧。诏多隆阿移军入秦。公与官文公商，留多公部将石清吉等十营，防守庐州。
五月初三日，公驰折奏水陆各军克复太平府城、无湖县城、金柱关、东梁山要隘，开单奏保王明山、李成谋、李朝斌等二十七员。附片奏保道员黄冕、李瀚章、赵焕联等九员，前往广东随同晏端书办理分卡、抽收厘金。又附片复奏奉旨，筹议江苏巡抚宜驻镇江，居适中之地。扼形胜之区，责成新任巡抚李鸿章办理。又片奏结莫祥芝参案，留营差委。是日，又具密折复陈胜保、袁甲三办理军务优劣情形，请责成李绩宜专办安徽军务。其时曾奉密谕，饬公筹议也。
湖州失守，赵忠节公景贤被执不屈，其后死于苏州。
公弟国荃攻克大胜关、秣陵关、三汊河贼垒，会合水师攻克头关、江心洲、蒲包洲贼垒，遂进军金陵城外，驻营雨花台。
初四日，鲍公超击贼于寒亭、管家桥等处，大破之。
初五日，核减江西丁漕规费，永定章程。
初十日，核定皖南茶引捐厘章程，出示晓谕茶商，期归划一。
十三日，课试在皖委员。
公弟国荃破贼于六郎桥。
十五日，鲍公超破贼于抱龙岗，越敬亭山，进攻宁国府。
十七日，驰折奏官军水陆并进，迭复秣陵关、江心洲等要隘六处，官军驻金陵之雨花台。附片奏报浙江、徽、宁等处军情，并称曾国荃一军进逼金陵，屯札南面一隅，洪逆见惯不惊，无恇惧之意。此时宜以全力会办江南，先复财赋之区，则各省可以次剿办矣。又奏特参私行远扬之将领以肃军纪一折。鲍超所部营官陈由立、余大胜、郑阳和均保至总镇，任意远扬，请将该员等革职。并请敕下湖南抚臣，派员押回皖南原营，通谕各路军营，不准辄留投效将弁。以惩扈跋之风，杜效尤之渐。附片密陈军营积习，设法惩究，并请将分统霆营宋国永授以总兵实缺。又片奏查复冯子材所部兵勇滋事情形。
十九日，驰折奏鲍超一军进攻宁郡，破贼于寒亭、管家桥等处，逆垒悉平，阵亡将弁郑永福等十八员名请恤。附片奏淮扬镇总兵黄翼升统带水师战船，于本月十二日驶过金陵、前赴镇江、上海一带，请令其接署江南水师提督员缺，节制松、沪各军。又片奏参江西河口厘务委员向绍先弊混巧取，请即革职。又奏遵查克复沿江两岸城隘出力员弁六案，并保开单请奖一折。
二十日，出示晓谕江西通省军民，札饬各府州县，永定征收丁漕画一章程。
二十三日，杨公载福假满回营，至安庆见公，寻出视水师于金陵。
李世忠降众凡数万人，不领官饷，专两淮盐利，委员至安庆请饷。公筹拨军火银米以给之，世忠感悦。
二十八日，拜发万寿贺折，又专奏代弟国荃、贞干恭谢天恩一折。
是月，李公鸿章收复南汇县、川沙厅，贼大股犯青浦、嘉定，洋兵败退，上海戒严。李公鸿章击贼于虹桥，大破之，松江围解，沪防亦解严。李公屡奉移驻镇江之旨，至是以上海军务吃紧，遂奏请直攻苏州，不复移军矣。
六月初三日，公与彭公玉膦修元臣余忠宣公墓。工毕，诣墓前致祭。
时皖省印委各务，悬缺以待人，乏员差委。公定以每日接见州县佐杂三人，与之久谈，而训之以吏治。
西洋兵既为贼所败，遂有调印度兵来沪大举会剿之说，公接总理衙门咨文，深恐江浙士民大遭蹂躏，慨然忧之。
初六日，具折复奏：请勿裁撤南洋通商大臣之缺，改为长江通商大臣，专办濒江四省中外交涉事件。所有广东、闽、浙三省，即由监督道员经理。又奏拣员署理安徽各府州县之缺，开单呈览。附片奏称：安徽地方渐次克复，急须讲求吏治，请敕下吏部，于本年新进士、拔贡两班掣签分发之时，皖省多分十数员，庶几正途较盛，气象一新。又片奏：上海贼氛四逼，李鸿章不能移驻镇江，多隆阿统军入陕，不克会剿金陵。并附陈鲍超、曾国荃两军大概情形。又片奏新授甘肃臬司刘于浔在江西本省防务紧要，暂难赴任。又奏报江西绅商捐饷开单请奖一折。
公弟国荃击援贼，却之。
初十日，金陵大营营官张壮勇公胜禄击贼陈亡。
十五日，鲍公超攻克宁国府城。贼目洪容海以宁国县城归顺，鲍公抚纳之，因其众收复广德州城。公饬鲍超选留降众二千人，其余设法遣散。
十六日，金陵贼大股扑营，公弟国荃击退之。
公咨复总理衙门，力陈借印度兵助剿之为害，宜设辞以谢之。
二十二日，具折奏称：洋人有另调印度兵来秋间大举之说，臣以此事函商左宗棠、李鸿章二人，皆称洋人未必果有其事。然既有所闻，宜由总理衙门与在京公使查询确实，然后申大义以谢之，陈利害以劝之。如其不见听，则须申明前议，进攻无助剿之师，克城无防守之卒。吾方以全力与粤匪相持，不宜再树大敌，惟当以谦退，忠信相与，不事猜疑，免生枝节，庶有忍有济也。附片奏报宁国克复及各路军情。又片奏浙江失守，降贼之员林福祥、刘齐昂、米兴朝请由左宗棠讯明正法。又片奏提督江长贵请假回籍葬亲，所部各营暂令唐义训兼辖，酌量遣撤，以节饷需。又奏采访忠义第七案一折。附片奏阳湖、休宁等县绅士杨锡嘉、汪念祖、胡泽顺等殉难情形，汇入第七案，分别请赐旌恤。
是月，公次子纪鸿以县试案首人学。
七月初二日，驰折奏金陵陆军屡却悍贼，阵亡总兵张胜禄，请从优议恤，将弁刘永祥、鄢兰亭二员请恤。又奏鲍超一军围攻宁国，克复府城详细情形，出力员弁，开单请奖。阵亡将弁马胜奎、楚训武等十一员名请恤。附片奏贼目洪容海投诚，酌筹招纳。又具折奏查明江西被害州县，蠲免钱粮分数。附片奏请恩旨豁免江西各州县历年摊捐之款，俾州县无赔累之虞，而民间无科勒之苦，吏治可臻上理。又附奏奉谕旨择保西北各省藩臬人员一片。又请暂缓江南、江西三省军政一片。
初四日，查阅轮船机器。
初六日，李公续宜闻讣丁忧，公兼署安徽巡抚印务。李公以所部成大吉、萧庆衍、蒋凝学、毛有铭等军，归公调度。
初十日，公驰折奏安徽抚臣李续宜闻讣丁忧，请按照胡林翼丁忧之例，赏假数月，仍令回皖署理抚篆。附片奏报近日军情梗概。又奏采访忠义第八案。又奏请暂缓江南武围乡试。又片奏杨载福更名岳斌。
夏秋之间，暑雨失时，疾疫大作，各路军营多染疾病。皖南诸军为最甚，死亡甚多，浙江大营次之，金陵大营亦染疫病。皆暂事休息，未遑攻剿也。
十七日，左公宗棠击贼于油埠，破之。
袁公甲三告病卸任。奉旨授李续宜为钦差大臣，督办安徽全省军务。二十一日，公具折代李续宜奏陈请假回籍治丧，仍请仿胡林冀之例。又请袁甲三暂缓交卸督师之任，附片奏接奉寄谕，饬查军情，奏报袁甲三、李续宜驻札之处，路近而较速；臣奏报往返，取道湖北、河南，道梗而较迟。兹开呈前三次拜发折片，以备查核，有无疏失之处，并陈明各路军营疾病过多，未能近剿情形。
袁公甲三委员押解已革盐运使金安清等至安庆，归公讯办。其李世忠全军，归公节制调遣。
李公续宜奏报丁忧之疏未入，接奉督师之旨，李公病已逾月矣。是月奉上谕：“该抚现丁毋忧，着即在军营穿孝，改为署理巡抚，毋庸赏假回藉。钦此。”又奉上谕：“钦差大臣科尔沁博多勒噶台亲王僧格林沁着统辖山东、河南全省军务，并调度直隶、山西两省防兵。所有剿匪事宜，即着会商钦差大臣李续宜妥为筹办等因。钦此。”又奉上谕：“胜保着以钦差大臣，督办陕西军务。钦此。”于是多隆阿公一军，有旨令公酌量调度江北裹下河一带，镇江冯子材一军，皆有旨令公统筹兼顾矣。
李公鸿章克青浦城，分军会洋兵渡海入浙江境，收复余姚县。蒋公益沣领湘勇五千人，由长沙启行，取道江西以赴浙。
八月初二日，出示谕乡民捕蝗。
初三日，李公续宜至安庆。苗沛霖退出寿州城及正阳关，李公续宜派蒋凝学引军入守寿州。萧庆衍守霍邱县。成大吉、毛有铭两军分守三河尖及固始县。总兵王戴驷留守六安州城，而自扶病回省城，见公商奏，力请回籍。捻匪犯颖州境，各军连击，破之。
十二日，驰奏迭奉谕旨分条复陈一折：其一，多隆阿一军援秦之局，中变回鄂，当驻扎南阳一带，鄂、豫、秦三省交汇之处，为游击之师。其一，里下河之防，请责成都兴阿严密防堵。现商令杨岳斌亲赴下游察看布置，又拟赶造太湖水师战船，防剿苏、松，腾出黄翼升水军，专防淮扬，以符原议。其一，李世忠军众五六万人，据有城池，自为风气，擅淮盐厘金之厚利，势难绳以法律。且其击退贼股，功未可没，拟姑循其旧，不设机心，不禁遏其利，不拒绝其求，但不甚资其力，亦不轻调其兵，暗销其予智自雄之气，将来或不至于决裂。其一，李鸿章不能离沪，移驻镇江，应责成冯子材耐苦坚守，不作出剿之计。凡四条。附片奏：曾国荃、鲍超、左宗棠各营，皆因患病者多，未能攻剿。李续宜患病未痊。继以哀毁，肌肉全瘦，苦不令离营回籍，恐难速痊。是以该抚自奏陈情，未便劝阻。又奏筹办广德州受降事宜一折。洪容海降众数万，但令选留三千人，编立五营，余皆资遣回籍，请给洪容海游击虚衔，其部下头目等，请分别给予顶戴。附片奏豫省派员招募湘勇一节，请停止以节糜费。又片请旨饬江西循照前案，按月拨解漕折银四万两，协济徽、宁饷需。又奏采访忠义第九案。附奏烈妇焦王氏等汇案请旌一片。
李公续宜陈情疏入，奉旨赏假百日回籍，假满仍出督师，以唐训方署理安徽巡抚，袁公甲三仍留督防临淮。
广德州降众叛乱，洪容海率其党一万人自拔奔回宁国。
二十九日，公驰奏遵旨查复湖北抚臣严树森被参各款一折，附奏遵旨查复江苏巡抚薛焕被参各款一片。又因何桂清逮讯时，呈出司道公禀，请退守苏州一节。奉旨饬将薛焕、查文经等查明参办。公具折奏称督抚权重，由来已久，司道以下，承迎风旨，不敢违拒，若此类者，无庸深究。疆吏以城守为大节，不当以僚属一言为进止；大臣以心迹定罪状，不必以公禀有无为权衡。附片奏广德州降众复叛，现筹办理情形，贼之大股，将并窜皖南，而鲍超、张运兰、朱品隆等军疾疫大作，张运桂已病故，左宗棠军病者过半，曾国荃金陵营中染病者亦逾万数，深恐羸卒不足以当强寇。皆由臣以菲材，妄窃高位，上干鬼神之谴，莫救厄运之灾，中夜以思，不胜焦灼！
公每日以吏事、军事、饷事、文事分条分时，以次清理，定为日课。
是月，贼犯上海，李鸿章力战，破贼于七宝街。洋兵克慈溪县。浙江官军收复处州府。左公宗棠击贼于龙游县，大破之。
闰八月初四日，定江西厘局章程。是时厘金收数渐减，公札饬各卡局委员比较每月收数，以增减为优劣。
十一日，葬桐城儒士方东树、戴钩衡、苏厚子等六人，皆因乱未葬者。并为立石，以表其墓。
十二日，驰折奏唐训方暂署皖抚，仍应驻扎临淮，接统袁甲三一军，使楚、皖官军联为一气。附片奏陈大江以南疾疫盛行，宁国境内最甚，金陵、徽州、衢州次之。水师及上海、芜湖各军，亦皆历疫繁兴，死亡相继。鲍超一军死者数千，其猛将如黄庆、伍华瀚等先后物故。鲍超、张运兰、杨岳斌皆染病甚重。皖南道姚体备、营务处甘晋，则一病不起。天降大戾，近世罕闻，恶耗频来，心胆俱碎！若被贼匪扑犯，战守俱无把握，甚至欲逃走以待再振而不可得。臣自度薄德菲材，不足以挽厄运，而支危局。请旨简派在京亲信大臣，驰赴江南，分重大之责任，挽艰难之气数，庶几补救于万一，臣断不敢稍存推诿，致误戎机。奉上谕：“朝廷信用楚军，以曾国藩忠勇发于至诚，推心置腹，倚以挽救东南全局，自诸军进逼金陵，逆匪老巢已成阱槛。惟以艰难时会，诚不易得，迭经寄谕，总以毋徙求效旦夕，惟当立足不败之地，以俟可乘之机，矧兹疾疫繁兴，各军将士疫病之余，讵忍重加督责！该大臣惟宜愈矢忠诚，拊循加意，使军心益固，沴气潜除！各营病疫将士，其各传旨，优加存问！本应明降谕旨慰劳，诚以事关军务，或恐人心疑惧，奸宄从而生心，贼人转益张其凶焰。我国家深仁厚泽二百余年，当此艰危时势，又益以疾疫流行。将士摧折，深虑堕士气而长寇氛！此无可如何之事，非该大臣一人之咎！意者朝廷政事，多所阙失。足以上干天和。惟当齐心默祷，以祈全消沴戾！我君臣当痛自刻责，实力实心，勉图禳救之方，为民请命，以冀天心转移，事机就顺。至天灾流行，必无偏及，各营将士既当其厄，贼中亦岂能独无传染？该大臣郁愤之余，未迫探询。刻下在京，固无可简派之人，环顾中外，才力气量如曾国藩者，一时亦实难其选。该大臣素尝学问，时势艰难，尤当任以毅力，矢以小心，仍不容一息稍懈也。钦此。”公接奉此旨，读之泣下！
十七日，专差奏皖南加广学额中额一折，请给徽州捐生一折，报销淮北课盐一折。
二十日，苏州贼大股援金陵，围扑官军营盘。贼结垒二百余座，日夜环攻。公弟国荃力战御之。
鲍公超军挫于新河庄。贼犯宁国府，鲍公入城拒守。二十三日，李公续宜启行回籍，唐公训方到任。
二十四日，拜发万寿贺折。
二十七日，驰折奏陈皖北一带楚军单薄，不能分拨。李绩宜所部将领五人，才位相埒，难相统驭。并陈明苗沛霖诡谲多端，不易言抚，惟赦其罪而不资其力，犹不失为中策。附片奏报金陵、宁国两处军营被贼大股扑犯，将领士卒皆为病所苦，防守尚无把握。总由微臣德薄位尊，莫挽厄运之故，忧惶无已。又片奏臣军前调黑龙江马队二百余员名，随同转战，屡有功绩，因水土不宜，抱病者多，应资遣回旗，以资休息。
是月，蒋公益沣军至浙江，克复寿昌县城。
九月初一日，安徽藩司马新贻奉旨暂统临淮官军。
初六日，宁国县城失守。
十二日，公驰奏汇报各路军情一折：雨花台营垒贼以大股百道环攻，此金陵之可虑也；宁国之贼，欲由间道上犯江西，此宁国之可虑也；小丹阳之贼，由东坝拖过战船，时图出江，冲断江中粮路，北水师之可虑也；河南捻匪窜扰鄂境，有取道皖北回援金陵之说，而皖北各城空虚，深恐逆踪阑入，此皖北之可虑也。现在调派各军，移缓就急，力围挽救。惟皖北地广兵单，现调提督成大吉一军，由三河尖驰赴英、霍，相机防剿。仍请敕下多隆阿迅速东还，驻军舒桐，兼顾皖、鄂则两省，大局幸甚！附片奏报宁国县城失守，徽州、旌德两城首当其冲。唐义训守徽州，朱品隆守旌德，两处兵力皆单，未知能坚守否。又片奏江西省厘务，数月以来，解数寥寥，藩司李桓总办粮台，兼管厘局，经理不善，已添委甘肃臬司刘于浔访察商情，署盐道孙长绂专司月报，整顿积弊。臣统军过多，欠饷太久，徒受揽江右利权之名，究无济苏皖饥军之实，不能不力图补数之法。又片奏查明巢湖水师营官黄国尧，于咸丰八年在庐郡阵亡情形，请从优议恤。
时贼船过东坝者，分布固城、南漪诸湖，欲冲出大江，杨公岳斌，力疾扼守金柱关。公派陆军数营，往助防守。
金陵之贼，环雨花台官军营盘，日夜猛攻，挟西洋开花炮，自空中击下，呼声动地。公弟国荃督军苦守不退，面受枪子伤，血流交颐，仍裹创巡营，以安众心。公弟贞干驻营江干，力战以通馈运。大营军火，赖以接济，与贼相持兼旬。初五日，击贼破之。十二日，击贼又破之。攻扑之势稍衰。都兴阿公派兵千八百人渡江助守。公念湘军疾疫之余，继以大股逼犯，恐局势决裂，日夕徬徨，寝不安席者数旬，而江西协饷多掣时，公益忧之。
十四日，公作《三字箴》，其清字箴曰：“名利两淡，寡欲清心。一介不苟，鬼伏神钦。”慎字箴曰：“战战兢兢，死而后已，行有不得，反求诸己。”勤字箴曰：“手眼俱到，心力交瘁。困知勉行，夜以继日。公言此十二语，当守以终身，遇大忧患大拂逆之时，庶以此免于尤悔耳。
十八日，水陆军合击贼于金桂关，大破之。二十一日，又击破之，毁贼船几尽。金陵之贼，开地道，用火药轰官军垒壁。公弟国荃力战，拒破之。令军士于营内掘隧以迎之，贼不得逞。李世忠攻贼于九洑洲，禀请分兵援金陵，公批札止之。
二十七日，驰奏汇报军情一折，金陵、宁国、芜湖、金柱关战守大概，并陈明调度各军，有与前奏不符者，视乎各路缓急之形。又奏采访忠义第十案。附片奏：宿州二郎山练总马维敏、乔元功等结寨御贼，为贼攻陷，殉难者二千余人。请照陈亡例，赐恤建祠，以褒忠节。又奏绩溪县孝烈妇胡程氏请旌一片。
是月，李公鸿章克嘉定县城。贼复犯青浦，李公大破贼于四江口，沪防肃清。贼攻镇江，冯子材破贼于汤岗。
多隆阿公督师入陕西。
十月初五日，公弟国荃击贼，大破之，俘斩数万。自闰月二十日以后，贼三十余万围扑营盘，百计攻轰，公弟国荃苦守四十六日，至是大捷，贼乃解围窜江北。
十一日，唐公训方启行，赴临淮关，袁公甲三回籍。
十二日，公驰折奏水陆官军，迭获胜仗，力保芜湖、金柱关要隘，贼舟存留无几，江西肃清，阵亡副将郭明骜请照提督例议恤。将弁洪得胜、王明元请恤。又折奏毛有铭一军，在颍州西路迭破捻圩，毁其老巢，仍回驻皖、豫边境。附片奏报金陵扑营之贼解退，芜湖等处，防守稳固。前奏可虑者四端，今三患稍舒，所虑专在宁国一路，若能支持一月，新募之勇渐集，或能力遏凶氛。是日，又具折奏保鲍超一军叠克青阳、石埭等四城，出力员弁开单请奖。又奏保曾国荃一军迭克太平、芜湖等各城隘出力员弁，开单请奖。附片奏称保案所开之员，有随后病故者。不及查核扣除，俾逝者得奖荣以饬终生者，亦观感而图报矣。鲍公超军在宁国府，贼扰湾沚，断其粮路。公派陆军由繁昌、南陵让陆运以接济之。
贼攻旌德县，公咨商左公宗棠，调所部王文瑞一军援旌德。
十七日，贼大股攻扑九洑洲李世忠之营，旋渡江北窜。
十八日，张公运兰离营至安庆见公。公令其买舟回籍养病，其所部老湘营以总兵易开俊、刘公山分领之。
朱品隆等军破贼于旌德。十九日，贼解围去。
湘军在寿州正阳防守者，时为苗练所杀害。僧王督师河南，奏请抚苗以剿捻。苗沛霖上书僧王，极诋楚军之失。公察苗沛霖有意挑衅，恐其沮坏大局也。又因皖北兵单，贼方北窜，调蒋凝学一军移营而南，毛有铭、萧庆衍等军皆移驻庐州之境，以避苗练，即以防皖境也。
二十七日，驰折奏缕陈金陵官军苦守四十六日，力战解围情形，道员刘连捷等七十三员开单请奖，阵亡副将倪桂等二百七员名开单请恤。附片奏：金陵援贼虽退，伤亡将卒太多。宁国、旌德两城同时吃紧。自金陵以至徽州，地段太长，贼股太众，皖北十余城，毫无准备。实恐遣败决裂，尽堕前功。仍请简派大臣会办诸务，稍分臣之责任。又片奏湘勇驻防寿州正阳关，与苗练逼处太近，挑衅抅怨，无有已时。刻下皖北正苦无调防之兵，拟撤出蒋凝学一军，并抽拨霍邱防兵，调防庐州、巢县一带，以遂苗练之私，以成僧格林沁急欲灭捻之志。是日，又具折奏保张运兰、朱品隆、唐义训战守徽州，军中出力员弁，开单请奖。附片奏：张运兰因病回籍，请旨将易开俊、刘松山二员授总兵实缺，以资钤束。又奏请暂缓三省查阅营伍之期一折。
贼之窜江北者，攻和州，陷含山县。二十八日，陷巢县。公乃札留新募淮勇之张树声、吴长庆等军暂缓赴沪，分守无为州及庐江县，调霍邱之湘军驻防舒城。公弟国荃派军回守西梁山，寻又派军扎东梁山。
广德州贼窜陷绩溪县。
是月，浙东官军会洋兵收复上虞、嵊县、新昌三城。
江忠浚补授安徽布政使。
十一月初一日，贼陷和州。
初二日，唐义训、王文瑞收复绩溪县。
初三日，旌德之贼窜扰太平、黟县之境，直趋祁门。
初四日，贼围泾县，易开俊引军入城守御，却之。
初七日，祁门县失守。
初八日，奉上谕：“江苏布政使曾国荃着赏给江绸黄马褂料一件、小卷江绸袍料一件、白玉喜字翎管一枝、白玉柄小刀一把。曾贞干着加恩以知府用。钦此。”
初十日，唐义训、王文瑞收复祁门县城。贼回窜石埭。
十二日，公驰奏汇报军情一折，江北含北、巢县、和州失守，调度防剿，并陈明宁国各军战守情形，绩溪、旌德、太平、黟县贼踪。奏称：秋冬以来，群盗如毛，南北环逼，前奏请多隆阿移师东剿，今则秦人方痛深水火，何敢渎请？惟请饬贵州提督江忠义，统率所部赴皖防剿，大局幸甚！附片奏报祁门失守。又片奏撤回蒋凝学一军，分防颖州、霍邱两处。调毛有铭、萧庆衍两军移驻舒城，以防贼上窜。是日，又具折奏保水师迭克沿江城隘出力员弁，开单请奖。又折奏浙江省城失守时溃走之副将陈步高等，讯明定拟。
十八日，公弟靖毅公贞干卒于军。是日奉到以知府用之旨。
公出城巡视盐河，委弁勇修壕墙一百八十六丈，核定工程。
十九日，水师破贼于三汊河。
二十日，鲍超闻讣丁优。公以宁国军情紧急，批令在营穿孝。
二十一日，公出城巡视城壕。
二十二日，闻靖毅公之卒，公哭之恸，派弁赴金陵迎护其丧。
二十七日，驰奏钦奉谕旨分条复陈一折：其一，毛有铭、萧庆衍之军由舒城拔营，取道巢湖之南，进攻运漕镇。其一，李世忠军于九洑，此次贼窜北岸，该提督亦屡接战，有所斩擒，惟贼股太众，未能堵截。其一，曾贞干已于十八日病故。由臣德薄，殃及手足。其芜湖要地，留防兵力尚厚。其一，洋将白齐文奉调赴援金陵。该将迁延不进，且毫无纪律，应由李鸿章严行惩办。其一，查贼酋李秀成踪迹。其一，催李续宜销假回营。凡六条。又奏旌德、泾县解围，绩溪祁门克复一折。奏保王文瑞、王开琳等五员，阵亡总兵胡太旗、参将刘永胜、游击张仁兴请恤。附片奏：宁国一带军势渐稳，鲍超丁母忧，请毋庸开缺，改为署理。又折奏结金安清、汪耀奎参案。又奏采访忠义第十一案。附片奏：定远县练总陈鼎霈等殉难请恤。
贼自金陵解退后，其一股复由东坝拖过战船，以图出江。公所派水陆防军，破之于护驾墩，毁贼船二百余号。
鲍公超击贼于马头镇柳铺，大破之。
是月，左公宗棠克复严州府城，李公鸿章克复常熟县城，多隆阿公奉旨授钦差大臣，接受关防。胜保革职逮问。
十二月初五日，石埭贼陷窜青阳县，朱品隆弃旌德不守，移剿青阳。
初九日，靖毅公灵柩过安庆。公出迎，抚棺恸哭，入城受吊。
初十日，水师击三汊河贼垒，破之。萧庆衍等会水师克运漕镇。公调蒋凝学一军称驻舒城。
十二日，具折奏遵旨筹派水师将弁兵勇，演习轮船火器。奏保总兵蔡国祥堪以统辖，参将盛永清等七员堪以分领。又申明楚军水勇难以出洋，轮船配用楚勇，须坚守前议，但用之于江面。又折奏贼由九洑洲分股上犯李世忠一军，堵战获胜情形。请敕下山西巡抚，将应解月饷迅解该营，以资接济。阵亡副将程自有、汪德喜、知县胡学诗诸恤。附片奏报各路军情。又片奏调道员隋藏珠回营当差。
是日，又具折奏保李续宜所部成大吉、萧庆衍等军援剿颍州，霍邱出力员弁，开单请奖。又折奏夏秋以来，厉疫繁兴，将士官吏婴疾而殒命者，殆以万计。其中功绩卓著者九十六员名，汇案开单请恤。张运桂、黄庆、伍华瀚、沈宝成、周成南五员，功绩尤多，请从祀湖南昭忠祠。附片奏伍华瀚之父文生伍宏铿，于咸丰四年在宁乡阵亡请恤。
十三日，奉到上谕：“曾国藩一门忠义，不避艰险，兄弟均在行间，为国宣劳，深为嘉悦！不料曾贞干遽尔病故，览奏曷胜悼惜等因。钦此。”又奉上谕：“曾贞干自赴江南军营，屡著战功，朝廷早欲擢用，因曾国藩再三恳辞，拟俟江宁克复后从优奖励。兹以力疾督战，积劳病故，悼惜殊深！虽未经曾国藩奏请给恤，而曾贞干系效力疆场，战功卓著之员，着即追赠按察使，即照按察使军营立功后病故例议恤，以示优异。钦此。”
十六日，公作季弟墓志一篇。
二十日，靖毅公灵柩登舟回湘，公行遣奠礼。毛有铭一军近剿巢县芙营蓉岭，小挫。
宣城县属之金宝圩，为贼所攻陷，杀掠甚惨。其练众及难民之脱出者，公给银米以赈之，编立营伍，安置于芜湖县，凡数千人。
二十一日，公弟国荃击贼于谷里村六郎桥，破之。
二十二日，萧庆衍击贼于铜城闸，连破之。
二十三日，青阳之贼窜回石埭。
二十四日，具折代弟国荃，贞干奉谢天恩。
二十五日，朱品隆军收复青阳县城。
二十七日，复奏钦奉谕旨并案条陈一折：其一，寿州撤回湘军以后，苗练尚无据城以叛之迹，正宜推诚相待，无庸派兵戍守，使反侧者无以自安。其一，李世忠骄亢任性，目前无甚扞格，将来或须示以检制。其一，杨岳斌军守金柱关，以防东坝贼船，彭玉麟驻守裕溪口，以防巢湖贼股，战争方急，不能移扎下游江面。其一，洋人用兵，其长处在器械精坚，步武整齐，其短处在口粮太重。若使官军学习其法，恐未得其长，而先图增饷。其一，金陵贼势方强，未易言抚。至其自拔来归，当禁约军士，不得妄加杀戮，以导向化之路。凡五条。附片奏报水师攻三汊河，陆军克运漕镇，及金陵官军胜仗，皖南各路军情。又奏保湖南东征筹饷局出力官绅，开单请奖一折。附片奏保江西补用道黄冕、湖南署潘司恽世临主持东征饷事，尤为出力，请旨优奖。
是月，贼又由东坝拖过载船，以窥芜湖。于是贼船过东坝者，前后三起。
是岁，发逆捻匪纠合大股迭犯湖北之西北境，官文公调楚军击退，全楚肃清。
骆公秉章、刘公蓉调派湘军，大破贼酋石达开于叙州之境。
江公忠义剿匪于湖南、广西之境。毛公鸿宾檄调回湘，募楚勇万人以援皖。
都统富明阿帮办江北军务，吴公棠署漕运总督。