分为十六纲、六十类。在每一药名之下，详细分为正名、释名、集解、正误、修治、气味、主治、发明、附方等诸项，并逐一介绍。全书分类细致，条文清楚，切合实用。本书是在绝对忠实于金陵本《本草纲目》的基础之上，通过对金陵本《本草纲目》影印本的校注、勘误、标点、索引等古文献整理工作，并在必要时酌情参考其他刻本字句，尽力再现《本草纲目》原貌，以避免多种不同刻本之间以讹传讹、损《本草纲目》原义之弊端，确保我国中医药学术的精华内容不因某些因素而丧失或消亡。

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