二月初一日（甲午），福康安、海蘭察、鄂輝同奏言：賊首逃入內山，經臣等分派官兵堵截要隘，令各番社生番在內山一體截拏。茲據社丁杜敷報稱：『林爽文帶領匪眾六、七千人，在埔並社至埔尾沿溪山溝內逃走；因東南一帶變鑾等社生番堵截嚴密，不敢竄往南路，現已向北逃去』等語。臣親往各處隘口沿山搜查，並催調糧餉僱夫背運入山，以為追賊官兵之用。一面飛飭通事王松帶領獅子頭社番，於要路迎頭堵截；一面商令海蘭察、鄂輝帶同舒亮、普爾普、恆瑞、普吉保、袁國璜、穆剋登阿、許世亨及巴圖魯侍衛等，由歸仔頭內木柵各隘口分路進山，連夜追趕；臣往來各路督催官兵，何處緊要即於何處帶兵策應。於二十五日，至麻著社一帶，聞林爽文於二十四日夜間，在東勢角地方，被生番截殺四百餘人，餘眾沿山北去。查看賊人蹤跡，係兩路逃走，隨將官兵分為兩路：海蘭察、舒亮、恆瑞、穆剋登阿、許世亨、袁國璜由東勢角前進；鄂輝、普爾普、普吉保由樸仔離東山前進。山徑險窄，穿林越箐，不能乘馬，均屬徒步登陟。官兵等沿山搜捕，殺死賊匪二千餘名，拏獲活賊四十餘名，奪獲大小砲位、鎗桿、刀矛七百餘件。二十七日行至獅子頭社，見山溝內賊屍縱橫遍地，數里不絕，而河內淹斃之賊亦多。據王松及生番等稟稱：『林爽文於二十五日到獅子頭地方。賊匪等因日夜行走，腿腳俱已發腫，過河淹斃一千餘名；社內生番堵截去路，又殺死賊匪二千餘名，止剩賊一、二百人過山逃去。大約從貓並社逃往三貂地方。生番等不認得林爽文，不知可曾殺死』等語。隨將各生番所獻首級並拏獲活賊逐一認識，俱非林爽文。仍即分路帶兵馳往追捕。臣查台灣以東，皆係大山，越過大山數十重，東面仍屬瀕海。三貂社在淡水極北，轉東逼近海岸，與蛤仔欄社相近；本係番界，間有貧民前往租地耕墾。今林爽文在內山逃往三貂；必由蛤仔欄經過；前經臣檄調副將徐鼎士、同知徐夢麟帶領生熟番眾，至蛤仔欄邀截。徐夢麟已於本月二十五日同都司徐機，至八堵地方屯劄。查八堵距蛤仔欄不過二百餘里，層巒疊嶂，山徑陡峭，步行前進約有三、四日程途。且該處均係生番居住，必須熟悉情形之人，方能前往；前已訪明居住三貂之吳沙、許天送及生番通事張光彩等，最為熟悉，復示以重賞，令其遍諭該處生番擒獻逆匪，並即帶領官兵入山堵截。查逆首竄逸內山，隨行賊匪尚有數千，官兵追趕及生番邀截，業已誅戮殆盡，沿途餓斃者又有千餘名。現在四路圍逼，逆首已無存身竄跡之地，一經追及，即可成擒。惟獅子頭社所殺賊匪，首級俱被生番割去，其中不無有名頭目，自應逐加識認。而生番性嗜殺人，所得首級皆攜回巢內，以誇武勇，不肯全行獻出，驗過者不過數百顆。茲已將出力生番按名給賞，諭令將首級呈驗，認非賊目，再行給還；庶知賊目何人被殺，何人逸逃，按名緝獲，以期盡絕根株，不留遺孽。又在正月初一日至各社一帶內山，殺死奔逃賊匪二百餘名，拏獲假扮林爽文之賴達一名、活賊四十餘名。訊據賴達供稱：『林爽文自獅子頭社痛剿之後，隨行賊夥又被沿途官兵生番殺散，所剩無多。林爽文原欲向北逃竄，見山內官兵圍截嚴密；又聞三貂等處亦有兵番截拏，不敢前往；在打鐵寮一帶山溝橋林內藏匿，尚無一定去向』等語。官兵等遂至打鐵寮追捕，由蝦骨社、合歡社、直至炭窯地方，又搜獲零星賊匪百餘名。查炭窯與南港仔山口相通，出山不遠，即係海岸；惟恐林爽文被山內官兵追急，潛行出山向海口逃逸，復派各營官兵由後壠至中港；又自竹塹至桃仔園，沿山密佈。臣福康安、海蘭察、鄂輝、舒亮、普爾普、恆瑞、許世亨、普吉保、袁國璜、穆剋登阿、特勒登徹、六十七、春寧及巴圖魯侍衛將弁人等，各分隘口，四路圍截。該處草深樹密，溝磡甚多，大隊官兵恐難於隱僻地方逐處查到，致有遺漏；兼恐逆首見官兵追至，驚懼自戕，不能生獲；因揀派巴圖魯侍衛二十員、貴州、廣東屯練兵丁數百名，改裝易服，扮作民人，同淡水義民、差役及社丁、通事等，分投搜緝。於初四日，在老衢崎地方將逆首林爽文、賊目何有志一同擒獲。現在搜查逃竄餘匪，又拏獲林琴、陳傳、吳萬宗、賴其瓏等四名，均係有名頭目。一俟搜查淨盡，並令入山各兵休息數日，即行統率大兵肅清南路。至南路賊匪情形，現猶屯聚大武壠、赤山保、大穆降、水底寮等處；聞官兵蕩平北路，心懷畏懼，黨羽漸離；特恐義民截殺，不敢相率投誠。而被脅村民亦以賊未解散，不敢遽行倡義。經臣分遣熟悉南路賊情之舉人郭廷機、廩生王維清等，賫示撫諭村民，離間賊黨。並以大武壠等處與諸羅接壤，行知柴大紀及參將李隆、張萬魁、知縣陳良翼，將投出之人妥為安輯。茲據柴大紀等報，有賊目何北海一名，賊匪魏振元等十六名，自行投出。內有蕭盛、賴育二名，拏獲賊匪林靴、林旺贖罪。陳良翼報，有賊匪吳云、林壓等四十八名，均已自行投出。又舉人郭廷機帶出南路投誠賊目許參、陳送期、陳吾春、顏院、林快士、黃充來營。並據賊目郭照、高為遣郭敬同來稟稱，林爽文三弟林勇，帶同賊夥在大武壠潛匿，情願設法擒獻，再行投出。臣俱已免究前罪，令其拏賊自效。看來南路賊匪，黨羽漸已解散，大兵一到，無難剋日殲除。其賊目李七，早有歸誠之信，前經拏獲該犯家屬，伊兄李水情願入山找尋，至今並未投到；茲已在內山拏獲。該犯係賊中著名頭目，不思早行投出，仍隨林爽文逃入內山，未便因其原有投誠之心，稍為輕縱。茲已嚴行看守，同拏獲賊目等另行派員解京審訊。又，官兵攻剋大里杙後，有被賊拘禁之原署南投縣丞洪智，投赴軍營。據供：『賊匪到南投搶劫，因該處並無城池，汛兵九十餘名，又分在各處汛地，不能抵禦，即時被賊攻陷。隨帶兩子到民人王生家，欲尋自盡。王生救住，送到豹尾莊廖全家居住。林爽文聞知，拏到大里杙，叫何從龍勸降。不從。就帶到觀音亭交林繞看守。又叫劉懷清威逼幫辦事件。自刎兩次，都被劉懷清將刀奪去，手上現有奪刀傷痕可據』等語。訊之何從龍、劉懷清，供亦相符。昨拏獲賊目林繞一名，即係在大里杙看守洪智之人，亦稱洪智屢被林爽文迫脅，實未從賊。復傳到王生等隔別研訊，均非虛捏。但洪智身係職官，被賊人拘禁日久，兩次自刎未死，仍復靦顏視息，究屬偷生無恥；未便因該犯員未經從賊，稍為寬貸，應請即行正法。奏入。

上命軍機大臣傳諭福康安、海蘭察、鄂輝曰：福康安等統率大兵，分駐各隘口嚴密堵截搜拏，使首逆無從遠竄；復恐林爽文見官兵勢盛，驚懼自戕，隨派巴圖魯侍衛及貴州、廣東屯練兵丁，改裝易服，同差役、社丁、通事等分投搜緝，將逆首生獲。福康安等辦理妥協，可謂用心周到，甚屬可嘉！至林爽文逃匿後，固須多派兵民分頭搜捕，而當其搜獲之時，必有最為出力首先下手之人，其人應優加獎賞。著福康安將林爽文究係何人首先擒獲，查明數名據實具奏，候朕另降恩旨。至洪智身為職官，被賊拘禁，不能捐軀盡節，固屬罪有應得；但念該犯兩次自刎，為賊匪劉懷清將刀奪去，手有奪刀傷痕可據，與靦顏從賊偷生者有間，著加恩恕其一死；發往伊犁充當苦差。又前奏賊目陳泮投出後，將其家屬扣留，仍令伊入山勒限擒獻。林爽文係被官兵搜獲，而陳泮作何下落，未據奏及。該犯既不能將林爽文擒獻，自未便因其曾行投出，稍從末減。此外，尚有吳領等亦係有名頭目，均難寬縱。並著福康安迅速按名查拏，解京審辦，毋令遠揚漏網。

上又命軍機大臣傳諭福康安、李侍堯、孫士毅曰：據台灣解到匪犯劉懷清、林茂等供：劉懷清在大里杙隨同林爽文之偽軍師董喜辦事，一切聽其調度，眾人稱為董仙。林茂係董喜糾同入夥。又擄供：賊人頭目林水素為林爽文信用，諸事皆其主謀，現封提督，將來欲封作宗人府。伊二人俱隨林爽文逃入內山等語。董喜為賊匪軍師；林水亦係林爽文信用，偽封提督；雖非莊大田之著名者可比，但皆係助惡為首之犯，未便任其潛逃漏網。現在首逆林爽文已經拏獲，董喜、林水二人，係隨同逃竄之人，如業經就獲，自已隨同解京；倘尚未拏獲，著福康安務將該二犯嚴密搜查務獲。若台灣查無綜跡，計該犯等非逃入福建內地潛匿，即由海道竄入粵省。並著李侍堯、孫士毅一體飭屬嚴拏，以期必獲，解京審辦，毋任其兔脫稽誅。再，此等黨惡要犯，如本日解到之蔣挺、劉懷清、林茂、何從龍四犯，及供出之董喜、林茂，俱係為賊主謀，並得受偽職，罪惡甚重；其家屬俱應緣坐，著福康安、李侍堯等即行遵照查明辦理。將來拏獲各犯，有似此情節重大者，俱著照此查辦。再，柴大紀、蔡攀龍二人，前據福康安於抵嘉義縣殺賊解圍後，即留柴大紀、蔡攀龍在縣城防守。伊二人俱受厚恩，如果思出力自效，自應懇求福康安隨同帶兵打仗。乃本日訊問押解匪犯到京之侍衛額爾登保，據稱柴大紀、蔡攀龍二人，並未懇求一同帶兵前往剿賊。似此靦顏安處，全不思奮勉出力，並懇求虛詞而無之。伊等畏懼懦怯，全無人心，已可概見。又蔡攀龍經福康安派令招致李七，乃蔡攀龍並未能設法招致，可見坐辦之事，尚不認真，安望其能隨營打仗，奮勇殺賊？著福康安即傳旨詢問蔡攀龍，令其自行據實明白回奏。至柴大紀於福康安自嘉義進兵時，並未懇請前往一節，亦著福康安一併嚴切訊問，據實覆奏。

上又諭內閣曰：福康安等自鹿仔港進兵後，督率將弁奮勇攻剿，連次剋捷。前於嘉義縣破賊解圍，業經降旨將福康安、海蘭察晉封公爵，賞給紅寶石頂、四團龍褂，以示優獎。今逆首林爽文經福康安等設法生擒，辦理周妥，實屬可嘉；特親解御用佩囊二個，分賜福康安、海蘭察，用昭恩眷。所有在事出力之將弁等，並著福康安查明咨部議敘。其隨征兵丁，並著福康安分別獎賞。至辦理此事，朕先事運籌，決機發策。自逆匪滋事以來，大學士阿桂留京辦事，續又差往河工及江南勘河，本未承辦書諭。大學士和珅始終承旨書諭，於一切滿漢事件，鉅細無遺，懋著勤勞，自應特加優賞。和珅本係一等男爵，著照從前大學士張廷玉之例，晉封為三等伯。大學士阿桂、王傑、尚書福長安、董誥，夙興夜寐，一體宣勤，俱著交部議敘。其滿漢軍機章京，並著軍機大臣查明實在出力者，交部分別議敘。至此次辦理軍務，孫士毅以鄰當總督，一聞逆匪滋事之信，即親赴潮州駐劄，節次派調兵丁、撥運軍餉、火藥、鉛丸等項，源源接濟，迅速周妥，甚為出力。孫士毅業經賜予宮銜，並賞戴雙眼花翎，仍著照從前大學士蔣廷錫之例，賞給輕車都尉世職，以示嘉獎。李侍堯自調任浙閩總督後，於照料過兵及運送糧餉等事，亦尚妥速，本欲俟蕆功之日，將伊原襲伯爵給還。但李侍堯前抵閩省已及一年，於柴大紀在總兵任內骫法營私、廢弛營伍種種貪劣款跡，自已早有見聞，乃竟緘默不言，並不及早據實參奏；經朕節次降旨詢問，李侍堯始行具摺陳奏。明係有心徇隱，豈可再膺懋賞；且伊業經賞戴雙眼花翎，晉加宮銜，毋庸復行給還伯爵；仍著交部照例議敘。至柴大紀，前因其固守嘉義不肯出城一節，念其勤苦出力，是以特封為義勇伯。今據福康安、李侍堯等先後遵旨查奏，柴大紀在總兵任內貪劣各款，俱已確實；並守城亦非其功；其前奏忍饑固守之處，竟係義民等不肯放出，伊轉捏詞欺飾，已明降諭旨革職拏問，交福康安逐款審明治罪矣。至兵部承辦軍報之員外郎盛保，在良鄉縣駐守迎候馳遞，尚為奮勉，本日擒渠捷報，即係該員親自賫遞，著加恩賞戴花翎；並在京捷報處各員，俱著交部議敘。又，此次軍報往來，直隸、山東、江蘇、浙江、福建沿途各驛站，馳遞並無貽誤；所有沿途督撫辦理一切軍需，均屬出力；及驛站遞送文報之文武員弁，並著查明交部分別議敘。其驛站兵丁，亦著酌量給賞。

初二日（己未），上諭內閣曰：黃仕簡、任承恩上年朝審勾到，並經格外加恩，免其一死。現在大功已屆蕆事，所有黃仕簡、任承恩二犯，俱著加恩釋放。但伊二人身獲重愆，經朕曲加矜宥，全其軀命；若仍靦顏安居輦轂之地，有何面目對人？俱著勒回原籍，閉戶靜居思過。

臣等謹案，黃仕簡、任承恩專閫受寄，恇怯逡巡，實干軍律。我皇上曲貸餘生，俾得圜扉偷息，已屬施恩格外；及台灣大功告竣，復蒙矜宥釋還。此非聖恩之獨厚於黃仕簡、任承兩人也，祗以黃仕簡乃黃芳度之孫，任承恩乃任舉之子。方康熙十三年逆匪鄭錦之亂，芳度闔門殉節；而任舉實效命於金川之役，兩人者之祖、父皆以忠節著聞；是故一線可原，特從曠典。為臣工者，益欽服聖主之權衡，刑賞不假秋毫，惟當激發藎誠，咸知法鑑。萬一重愆自蹈，苟非如黃仕簡、任承恩之猶有可原，必不能倖邀肆赦。而效忠如黃芳度、任舉者，雖延賞已逾百年或數十年，尚足以庇其獲咎之子孫，一罪一功，昭然不爽。載諸簡冊，洵足以永垂激勸云爾。

上又諭內閣曰：此次台灣逆匪滋事，劫縣戕官，肆行不法，至一年之久。福康安等帶兵渡洋，旬月之間，即將賊匪痛加殲戮，搗穴擒渠，各村莊得以安堵如舊。該處地隔重洋，五方雜處，風俗素稱刁悍；經此一番懲創，若不明示武威，恐民人等事過即忘，不足令其怵目儆心，常思安分畏法。將來事竣後，如福康安、海蘭察及鄂輝、普爾普、舒亮等之勇略最著者，應於台灣郡城及嘉義縣兩處，共建生祠，塑立像貌，俾該處民人望而生惕，日久不忘。

上又命軍機大臣傳諭福康安、李侍堯、徐嗣曾曰：前因黃仕簡帶兵渡洋，並不奮勇剿賊；惟安坐郡城，因循株守，以致逆匪蔓延日久。曾經諭令李侍堯等，將來事竣時，所有多延時日糜費軍需銀兩，應於黃仕簡名下責令分賠，以示懲儆。李侍堯何以尚未覆奏？現在逆首林爽文業已生擒，剿捕事務即日蕆功；黃仕簡釋放回籍，既邀格外寬宥，而台灣逆匪滋事年餘，一切軍餉費用不貲，皆黃仕簡因循貽誤所致。若復令坐擁豐饒，無以示懲。著李侍堯於黃仕簡名下罰令繳出銀二十萬兩，以備賠補軍需之用。至昨據福康安奏，訊據林爽文之父林勸供稱，伊祖父墳墓係在義塚地內埋葬，並無木牌，難以辨認等語。該犯祖墓埋葬義塚，自可查訪而知，著李侍堯於林爽文本籍漳州一帶，嚴密查訪，不可稍涉紛擾，致伊支族驚疑；更不可因匪犯捏飾，竟置之不辦，徒事顢頇也。

初四日（丁酉），上諭內閣曰：柴大紀既貪縱釀變於前，復狡詐欺罔於後。其前此接奉諭旨不肯出城一節，自係因郝壯猷前在鳳山棄城逃回，即於軍營正法，柴大紀心懷畏懼，恐罹重辟，是以不敢輕離該處。設非朕嚴申軍紀，於鳳山失事時，即將郝壯猷按律辦理，則柴大紀深染綠營習氣，怯懦畏葸，未必不為郝壯猷之績。今既查明種種劣跡，自應徹底嚴辦。昨已明降諭旨，將伊革職拏問，交福康安嚴行定擬具奏矣。朕於臣下功罪，惟視其人之自取，一秉大公聖正。而於用兵之際，有功即賞，有罪即罰，尤務嚴明，從不絲毫假借。至辦理軍務，宵旰焦勞，從前平定准部、回部、大小金川，無不炳燭幾先，預摻成算。此次林爽文等糾眾滋事，雖係麼■〈麻上骨下〉草竊，亦並不心存忽視，一本敬天凝命之念，孜孜勿懈。是以仰邀昊眷，剋期奏績，逆首生擒。即如恆瑞妄請添兵數萬一摺，設不斷以幹綱，如宋、明庸主遇事輒令廷臣聚議，眾論紛紛，迄無定見，征調紛煩，緩不濟急，寧不如金世宗所云：『南期集議既成，北兵已可渡河』之語。其何以握勝算，而奏鴻捷耶！著將前後辦理緣由，通諭中外知之。

臣等伏讀御製遲速論，曰：『兵事宜速，而要於敬天明理。不敬、不明，未有不致僨事者』。至哉皇言，誠足以揭萬幾之要，立千古之極矣。夫以林爽文之糾眾滋事，不過麼■〈麻上骨下〉草竊耳；而我皇上宵旰焦勞，悉本凝命之思，孜孜勿懈，即遲速論所云『敬天』也。以恆瑞恇怯之見，妄請添兵數萬，而斷以幹綱，斥其謬議，即遲速論所云『明理』也。是惟『敬天、明理』，無不炳燭幾先，預操成算，以迅奏膚功。蓋於兵事有明徵焉，而豈獨於兵事然哉？