「樹杞林志」抄本，系國立臺灣大學圖書館之藏書。光緒二十四年（日本佔領臺灣第四年）三月，前清附生林百川、訓導林學源應樹杞林辦務署長木戶氏之託，編修是志。同年四月，全稿告成。

本書「告成」之速及其「告成」之背景，均與「苑裏志」相同（文獻叢刊第四八種）。因為修志時間較「苑裏志」落後一年，故其章節編排亦完全參照「苑裏志」之手法。現在把部份內容失去國家民族之立場者，完全依照周憲文先生在「苑裏志」弁言上所說的整理之原則：『凡是事實，我們祗去其有礙於國家民族的字面，而仍予保留；凡屬議論，要是有害於國家民族的利益，一概剷除』。全書計被刪去四千餘字；內全文被刪去者，計有序（一署樹杞林辦務署長木戶有直，一署前郡庠生林帆海）跋（彭裕謙）及「樹杞林志凡例五則」。附圖刪去「樹杞林八景」八幅；亦因原圖過於草率，在「文獻」上無此需要。

至於「辦務署」這一機構的變遷經過，周憲文先生在嘉義管內采訪冊（文獻叢刊第五八種）的弁言上，已有詳細的記載，可以查考，不再錄敘。（林真）