康熙十七年戊午（附稱永曆三十二年）正月二十二日，陸路提督段應舉接知「賊犯沿海」報，提師出巡。至日湖，遇賊將水師四鎮陳昇，揮騎與戰。沖突不數合，升大潰，死者不計。二十三日，應舉又督騎步至東石，攻敗賊將前虎衛林陞，方回軍泉州。
二十五日，劉國軒連接陳昇、林陞之報：為提督所敗。軒啟經曰：『前者兩次和議不成，必會師合攻。邇時東石、日湖二處連敗，豈可坐待？宜速進兵入漳，以觀其變』。經允請，調林陞、陳昇等回兵。以國軒為正總督，吳淑副之，令統兵進取。軒啟曰：『古為將者，出師在外，必有閫外之寄，君命有所不受。倘若如前掣肘，則軒亦不敢拜命矣』（軒此言，指錫范、繩武二人在內專權）。經遂表請上方劍與軒，得專征伐；自副將以下，聽其處決。軒拜受，擇日祭江出師。
時總督郎廷相、海澄公管水師提督黃芳世、副都統胡兔俱按兵駐漳，總兵黃藍駐海澄。星羅棋佈：防把玉洲、三叉河、福滸、陳洲、馬洲及彎腰樹、璧湖、石碼、石尾、江東橋等處。二月初九日未刻，國軒辭經登舟。初十日，與吳淑等督快哨、八槳，揚帆泊海澄之海門，金鼓喧天，砲聲不絕。黃藍聞報，意其將來犯城，加意巡防。是夜五鼓，軒乘潮，督船進攻玉洲。守將海澄左營遊擊劉宗邦，見兵勢強盛，不敢戰，遂降。十二日，軒令吳淑徇三叉河、福滸皆陷，分遣屯劄。十八日，軒又乘潮漲順風，揚帆進寇江東。至，即斷橋，親率登岸。守將呂韜、王重標等出敵，國軒揮戰，標等潰退五里許。忽副將朱志麟、總兵趙得壽同統兵至，標等又合兵轉戰。國軒抖擻精神，將士倍勇，首先沖殺。得壽等遁去，軒尾追至萬松關。關上姚儀望見，率騎兵數百飛馳下援（姚儀，啟聖子，有膂力，武藝嫻熟。從啟聖出征，屢著功。後以恩蔭，除山西太原知府。陛見，改為狼山總兵，轉擢鑾儀衛正堂），得壽、重標等又復合戰。軒遙見騎兵奔湧下關，即令『後軍急退，過坡埋伏，俟吾接戰佯敗，引彼過嶺後仲殺』。軒遂督眾向前迎敵。箭如雨點，軒且戰且退。儀以為真敗，揮騎馳趕。不期過嶺，一軍從左沖出、一軍從右沖出，喊殺合攻，儀倉皇大潰。軒追至關下，鳴金收軍，回踞江東；取討民夫，聲言欲搶關，進攻漳州。
關上偵知，飛報郎廷相。相添兵防守。二十三夜，軒乘潮將漲，率其眾下八槳。三更，至石碼。銜枚登岸，倚梯喊殺，緣城而上。守將海澄鎮右營遊擊劉筏與朱洛、楊朝宗等，不及衣甲，隨為所獲。天明，國軒豎柵開壕，以窺海澄；江東橋燒斷，漳、泉隔絕。副都統孟安從潮來援，國軒督兵出戰。未幾合，安揮騎沖突。軒虞其敗，發令曰：『當速前進！如退縮者，斬』！其領兵蘇爵遲延回顧，似欲退意。軒立斬爵，諸將股慄，賈勇殺進。安遂潰，奔入城。軒收軍回營，大賞將士。
提督段應舉聞報，立調馬步，自泉援漳。親王接郎廷相文，即令寧海將軍喇哈達率滿騎，從福州來。軒偵知，遂撤江東守將，讓喇哈達大隊入漳。又平南將軍賴塔接郎廷相移文，即領騎兵從潮州而來。軒計各處援兵咸至，隨整備八槳快哨，挑選健勇，乘潮揚帆，直入江東，攻打營寨。忽隨潮退，進取海澄；忽又以潮漲，突入鎮內，鼓噪往漳，似欲攻城狀；忽又跟潮落，旋泊鎮門之東，上岸欲去搶關。倏水倏陸，而滿漢官兵疲於應敵。
又白頭賊蔡寅亦乘間率其夥盧世英、紀朝佐、鄭不越、吳金龍、王鼎、歐九等，焚掠長泰、天保地方。海澄公黃芳世接總督咨，隨領本標步往天保，剿捕蔡寅。三月初一早，盧世英、鄭不越恃有妖術符驗，率眾前迎。芳世揮騎兵沖突，不越等遂敗；紀朝佐出援，又為步旅截擊，亦潰。寅見二處俱敗，踉蹌奔竄，死千餘人。芳世進至長泰界，方收兵。
初二日，國軒督諸將駕八槳乘潮，從赤嶺港登岸，列陣於赤嶺埔。哈達、耿精忠、賴塔、郎廷相、段應舉悉領滿漢騎步，雲集整隊相對。賊將前虎衛林陞，奮勇奪先沖出，與滿漢騎步鏖戰。自辰至午，未分勝負。國軒密約吳淑，從左右進兵合擊。騎兵咸潰，傷失甚多。軒遂屯營於東嶽。
郎廷相以赤嶺之役，國軒樹柵屯營於雙橋一帶地方，逼城僅數里，旗幟耀日，金鼓喧天，其勢強盛，心甚悒怏。隨接黃芳世天保殺土賊蔡寅捷報，即馳請芳世回師護城。世接文，隨即班師。會賴塔、喇哈達、廷相等商議戰守。廷相曰：『城池為重，公當督兵守防』。哈達曰：『不可，滿漢騎兵悉屯城內，恐賊勢猖獗，一旦為其所困，將奈何？公系閩人，地理諳熟、音語相通，宜在外屯劄。不但可作聲援，且可著人四處偵探，乘機破賊』。廷相是之。芳世將本標騎步出劄水頭山彎腰樹，禦堵石碼。芳世至，環營山頂。前標遊擊呂孝德曰：『豈可全師悉劄山上？宜分其半於山下作犄角，防賊沖突』。芳世曰：『臨高禦下，勢如摧枯』。執而不聽（孝德平和人）。廷相又遣一旅屯劄鎮門，設立砲臺，遏賊船之往來。國軒不知水頭山是何將領兵屯劄，即遣細作入漳打聽。次日，回報：『系海澄公』。國軒喜曰：『吾計成矣』！遂附吳淑耳與議，大笑而起。
十一日黎明，國軒發令，悉焚所有營寨，踉蹌撤兵，各下快哨、八槳。芳世於山頂望見，以軒為真遁也；頃之，潮漲有八、九分，國軒令齊揚帆，芳世以為將待潮而出也。瞬倏乘風直抵水頭山登岸，國軒揮軍，陟嶺逼戰。芳世初不以為意，而不預防。一見蜂擁鶩至，遂錯愕慌張。正欲督兵出禦，又報『賊將陳昌、陳福等駕八槳抄其後』。芳世首尾受敵，陣亂四潰，棄輜重營柵而遁。國軒尾後追趕，芳世馳忙，忽馬失足；幸左右扶，急換馬，奔入漳，幾乎遭擒。軒方收軍，踞水頭山；所獲輜重馬匹，分賞將士，大犒諸軍。何祐、林陞、江勝、陳昌、陳福等稱賀，並請問其燒燬營寨之故。國軒曰：『初虞安營者別將。及探報乃是海澄公，吾諒渠素不知兵，其可取也必矣。故與後提督計議：盡焚營柵者，安其心也，使彼歡喜而懈惰；直抵逼戰者，破其膽也，使彼不及於防備；令陳昌、陳福駕八槳抑其後者，亂其陣也，使彼兵心無鬪志。此兵法之所謂「不厭詐而聲東擊西」』也。諸將拜服。
十二日，國軒報捷。鄭經以國軒江東之役，一日三捷；赤嶺揮軍，連勝數陣；今又用驕兵計奪水頭山而捷彎腰樹，敵人破膽，屢有戰功。擢為中提督，仍總督諸軍，得專征伐。差禮官鄭斌齎印諭，入石碼與國軒。軒拜受，厚待斌。具啟稱謝，擇日開印。
段應舉因江東橋燒斷，賊勢猖獗，自泉州提師入援。恐海寇從中堵截，海澄糧糈為其所絕，與喇哈達、郎延相相議：親統軍列營於祖山頭，接應海澄來往。忽黃芳世水頭山被奪，應舉愈加提防。
十八日，國軒開中提督印，旗幟新鮮，照耀奪目；砲聲金鼓，轟鬨如雷。各將拜賀，絡繹不絕。軒視事畢，即令諸鎮營：『速回，整甲為備。吾將踱營地，誘敵出戰。各宜奮勇，不可疏忽』！諸將得令，急趨回。國軒號砲遂響，自率驍卒出，從祖山頭而進。應舉意其將來攻己，隨督兵下山迎戰。正遇賊將盧仁，應舉揮軍，箭如飛蝗。仁抵敵不住，沈誠、陳起明二鎮齊出援禦，又敗下。適何祐率眾至，接戰；未數合，亦稍卻退。應舉見連勝三陣，督騎兵追殺。不虞吳淑、江勝兩軍繞祖山之背，搶奪營盤。國軒遙見祖山頭應舉營盤被淑、勝所奪，即催眾合攻，飛馬追趕。應舉見賊兵上山劫營，亦即返救。江勝率所部眾從山上殺下，繞其後喊殺。故應舉三面受敵，軍亂，自相踐踏，死傷甚多。其漳路業被陳昌、陳福、林應等把踞，不得進，遂奔海澄。國軒揮眾，追至普賢柵。會日暮，鳴金收軍，回踞祖山頭，以逼海澄。
十九日，國軒大賞將土；責盧仁、陳起明、沈誠三將退縮不前，革職，戴罪立功。
應舉於是日入海澄，副都統穆黑林、孟安與希佛、馬虎、總兵黃藍等共議戰守。藍曰：『燈火寨乃海澄咽喉，宜出兵踞寨，不但可作犄角之勢，且可接應漳州援師。倘為賊奪佔，則海澄危困矣』。應舉曰：『守城為要，何必出據燈火寨』？藍曰：『城小兵多，且無蓄積，況水路已斷；若一旦圍困，糧餉不足，將奈何』？應舉曰：『方今將軍、總督雲集漳郡，自當來援。內外夾攻，彼必走矣。何慮此輩一時之猖獗』？固執不聽。
劉國軒欲逼海澄，恐滿、漢合師救援。令昴宿鎮張雄同牛宿鎮曾偉，帶所部入攻平和。又令副將黃瑞鏖統眾攻漳平，以分其勢。雄、偉至平和，守將與知縣聞報，棄城遁。雄踞其城，分偉出小溪。其黃瑞鏖亦攻陷漳平。
因而各縣羽毛告急，廷相調撥，應接不暇。但海澄城小而堅，半山半水，為漳州門戶。原設水師提督鎮守；迨因施琅同周全斌攻澎湖遇風打回，召琅、全斌入京，裁易總兵，燒燬船隻。丁已秋，黃芳世保黃藍補其缺。前國軒犯江東橋，郎廷相恐其來攻海澄，遣其中軍副將朱應麟同馬虎帶兵協防。至國軒破石碼、踞水頭山，愈恐海澄有失，再撥副都統穆黑林、孟安、希佛等往守。及段應舉祖山頭戰北奔入，共計滿漢兵督提三標暨諸鎮營騎步，計有四萬餘眾。應舉令知縣祝文郁造冊，報城內居民。郁計點百姓胥役，僅有八十三家。應舉欲將此八十三家逐出土城；祝文郁曰：『設城、設兵，原以衛民。苟無百姓，欲城何用？提督若欲逐此數夥百姓出居土城，須給牌照付郁為執』。舉聞言方止（土城，縣城之東，另築一城，名曰土城，原設水師提督衙門在此）。應舉又慮兵眾糧少，令文郁挨查有蓄積米慄者，報出以充兵食。郁曰：『當此擾攘之際，數夥殘黎，自食無力！安有餘粟』？郁慮兵丁暮夜強搜民家，署內立高臺，望夜間何處喊叫，即率役馳衛，百姓得安。國軒以海澄城堅，急猝難攻，度其人眾糧少，必能沖出。雖圍半月，尚虛西門一道通塹山、龍井，聽其自遁。後見應舉築砲臺、修壕柵，是欲待援而無去意，方遣林陞守三叉河，林應、江勝守水頭山、鎮門。其餘諸鎮連營扼守圍困。
親王以海澄屢戰不利，令郎廷相單騎入京，以署福建布政使司姚啟聖為總督（啟聖，號憂庵，浙江紹興府人。中北直隸解元，除廣東香山知縣。緣事革職，永不敘用。甲寅，三藩倡亂，康親王奉命平閩。啟聖投親王軍前，願捐資募兵，同其子儀從征。親王加以「隨征道銜」。屢獻奇謀於浙之溫、處，親王甚器重之。至入閩，親王以糧餉為軍需要務，非賢能籌畫者任之不可，故委啟聖署布政司事。迨往潮州說劉進忠投誠，親王愈愛重之。知有方略，任以總督）；又令巡撫楊熙致仕，以署按察司吳興祚為巡撫。飛題，俱奉旨依議（興祚亦紹興府人。降任江南無錫知縣。捐資募兵，從征恢復。親王軍前，事無大小，咸委託焉。入閩，任以刑名。適海氛肆虐，故以祚為巡撫）。親王以段應舉被圍日久、黃芳世嚇傷未痊，乏人料理軍務；因查江南提督楊捷，原在閩省曾任漳浦總兵，歷著戰功，題調入閩平寇。啟聖在漳，催趲糧餉，應濟軍需；忽接親王令諭，委署總督，隨擇日上任。即廣張告示，以海逆蔓延，歷有年所，漳泉何地何族，無與之為黨者？豈可以一人而株連無辜？亟行禁除，以後不許挾怨，指稱與海上鎮營族戚以及瓜葛陷害。又搜羅人材，凡技勇邁眾、並前從逆者，能棄邪歸正，悉委以參、遊、都、守，任管內標統兵；或就地禦侮，或隨行征剿。推心置腹，不似郎廷相之懷疑閩人而不敢用焉。是以政令寬宏，百姓賴安。又計兵馬繁多，誠恐糧餉一時未至，兵食維艱；題請設鑪鑄錢，裕餉便民。
四月，國軒見應舉不肯棄城遁去，遂督其眾重鎮複壘，結營扼險，斷其出入。屢率眾攻城，悉被東北八角樓上大砲所擊。二十八夜，軒密遣健將林龍潛入城內，將八角樓大砲二門名「八面威風」者打壞。次早，報應舉。舉斬放砲五人，搜擒奸細，四門戒嚴。
五月初五日未時，軒率諸將用火攻，攻奪溶洲碼花園柵。應舉於土城上督黃藍、馬虎等兵救援；禦至三更，被軒所砍。初六日，軒將儒山、合浦、通亙新渡塹山四旁浚渠，與海潮通，故應舉、黃藍等欲逼戰破圍，不能展其技勇。而喇哈達、啟聖屢欲進援，無路可通。滿、漢騎兵步卒，惟齊集於筆架山上，連幕洪礁、鱉浦、北峙數十里，相守而已。
初八日，國軒傳集諸將會議曰：『敵兵屯於筆架山上，山南有小寨，懸崖如掛燈，俗名為「燈火寨」。寨下大溪，順流可達海澄。若不守據，恐為彼所鎮，即可援也。但此咫尺敵師營壘，誰敢前去踞守』？諸將默然。副總督吳淑奮然而應曰：『淑願提兵往據』。軒起謝曰：『當此沖要重險，公肯親履，吾何慮焉』？淑於是夜令軍士各攜一鐵鋤，銜枚進寨。平明，柵壘溝壕完備。賴塔、韓大任、曾養性、江元勳等，望見駭然。初十日酉時，塔令養性率連環砲於山上垂下，絕力攻打，以為無遺類；豈知淑令眾各穴地藏身，無一傷者。十一黎明，韓大任等領騎兵下山，合擊奪寨；淑率穴中眾出柵禦戰。大任方訝其眾尚存，戰未幾合，即抽兵回。
淑見大任退師，亦不追趕，仍收其眾入寨嚴守。立差心腹李宏基飛報劉國軒曰：『終夜攻打，砲聲不絕，今旦黎明即督兵搶寨；此是虛張疑計，恐其意不在燈火寨。本督宜迅飭各營堡防備』！軒是之，隨遣人轉傳各鎮營。既而賴塔、韓大任、曾養性、江元勳等，率滿漢騎兵數萬，飛馳齊攻岳廟、祖山頭。賊將張鳳率眾接戰十餘合。鳳被大任所殺，眾潰，大任乘勢奪其營壘。塔再進兵，林彪接戰，亦退，並棄寨柵。大任等復合塔師，齊攻林陞營盤。陞不出戰，據營死拒。國軒遙見連失二營，林陞被困，親率驍勇，飛馬來戰，未分勝負。忽江勝領其眾繞道從中沖殺，將賴塔、韓大任截為兩斷。林陞方開柵，合軒、勝攻擊。塔遂失利，傷捐甚多。自是海澄不可救矣。
段應舉屢聞戰聲，欲提兵出救夾攻，其奈溝渠重重，馬陷環埔而中止。後闐然不見外援，城內乏糧，人心皇皇。且劉國軒以是日大勝，勢愈熾，而圍愈緊。二十一日，遣張應時齎白米一斗、西瓜二個、生煙四包、酒一罈，入海澄說應舉。舉於西門樓見之，問應時『欲何為』？應時曰：『時奉主命，以將軍之孤城重圍，援師屢敗，兵多糧少，豈能久守？況我藩主仁愛，凡北將如馬信、郝文興等歸順者，悉推心置腹而重用。故特來勸降，毋自苦焉』！應舉笑曰：『汝覆汝主：食君祿、守君土，分所宜然。是頭可斷，而心不可易也』。收生煙四包，餘物卻還，揮應時出。舉謂穆黑林等曰：『此非餽遺，是來探糧餉之有無也』。守益堅（東旭曰：任爾儀、秦再世，難說巡遠真心；不讓前賢往哲，獨占盛世於今。將軍此頭可斷，赤心許國無移。寧甘煮皮掘鼠，豈肯剪辮降旗）。應時出，覆曰：『提督惟有死而已，無降意』。國軒曰：『城內兵民糧食如何』？應時曰：『在西門樓上見提督，未曾入城，兵民不知；但觀左右皆菜色』。軒曰：『滿、漢兵馬許多，諒食亦將盡矣』。即令應時特奉令箭並諭，到各營傳示：『不許透漏糧食暨一應蔬菜！如有犯者，察出，該營一體同罪』！加意巡防，而城愈困。
二十四日，署海澄鎮左營遊擊汪明請其鎮主文相公、汪定公密議獻城。定公佯許之；歸語黃藍，藍即轉告應舉。舉收汪明並其弟辰、子集，斬首示眾。與士卒同甘苦，竭力守禦。奈援師無期，糧米已匱，殺戰馬而羅雀掘鼠，繼浸皮煮紙。強者食弱，餓莩遍戶。
六月初十日，軒率眾環城攻擊。眾力不支，軒排闥從菜港而入。計受困八十三日，提督段應舉知勢莫敵，與副都統伯穆黑林謀自縊。行至關帝廟前，舉曰：『廟裏去』。黑林曰：『帝君在上，不便』。遂同上西門樓。舉曰：『守此城，死此城，宜矣』！與黑林相向而縊。希佛聞城陷，發火自焚。海澄總兵黃藍，不知所之；有傳其死於亂軍者，有傳其溺於水者。孟安、馬虎、魏赫、田香五、朱應麟、賴陞、楊壯猷、馮有魁咸投降；惟知縣祝文郁，稱病不出。軒報捷，並請示下（後人有詩贊應舉、黑林曰：『輕生節操自應難，疋練投樑萬古寒！愧殺事仇甘北面，瀟瀟夜雨冷江干』！又贊希佛詩曰：『火坑聊借藏吾身，豈似朝秦暮楚人？於此令名垂不朽，綱常萬古可維新』）！經得捷，令戶官楊英載米馳入海澄，煮粥賑饑。惟孟安、馬虎、田香五、魏赫、朱應麟等降，授銜給劄，並配眷口；其騎兵將士二千餘人，載過臺灣，分配屯田。並勒知縣祝文郁照舊供職；郁賂軒左右暨醫者，報病實重，方准其在家調養，尋而從官船逃回。國軒入城，安民畢，尋應舉、黑林屍於西門樓，著人解下，面不改容。軒嗟嘆異之，備棺厚殮；並希佛骸骨設位，豬羊儀禮祭奠。差人護送應舉靈柩至漳州，交喇哈達、姚啟聖。聖與哈達重賞其使，遣之歸。啟聖見海澄已破，會哈達將筆架山各處兵馬抽回，保守漳郡。
十六日，經令鑾儀陳慶抵海澄，監斬賴陞、楊壯猷、馮有魁三人示眾（陞與壯猷，系海澄公標。有魁，原漳浦鎮中營。今雖為提標左營；甲寅從海，曾為木武鎮。賴陞於丙辰年曾從海，為後衝鎮。經以此輩反覆，故殺之）。
黃芳世得病死。啟聖收其敕印。親王以海澄公原是鄭經仇人，今若承襲，不可令其駐漳。題請移駐汀州。後奉旨；依議。即以黃芳泰襲海澄公爵，削去五標，移其家於汀州居住。
六月，吳淑以海澄既得，勸國軒曰：『宜乘破竹之勢，迎刃而下漳城』。軒曰：『漳城滿、漢騎步計有數萬；況城又堅固，未可急圍。當先剪其手足，則腹心自潰也』。淑曰：『漳城眾雖多，然其氣已奪、膽已破，急攻之，正如摧枯拉朽耳』。議未定。十三日，偵者報：『浙江援兵已到同安縣』。軒遂與淑分其眾；十五日，軒率何祐等勁旅往同安迎敵，淑領一軍入攻長泰。親王以海澄之圍未解，星馳召浙江副都統雅長里，提師入閩救援。長里至同安，接總督主堂筆帖式剛舒報『海澄已陷』；方駐師，俄而飛報『賊兵大隊即至』。長里會守將馮昭京、知縣齊宗孔、懸丞錢鈺、典史金榮，以同安四面受敵，不可守；十八夜，咸遁入泉州。
軒入同安城，飛調水陸齊進，合攻泉州。水師五鎮林日慧接國軒諭，即整舟師，從泉州港入泊御殿頭。提標中營馬勝聞報，督一旅出南門，又分一旅出塗門。互相攻擊，不分勝負。日暮，日慧收其眾，退灣鷓鴣頭；馬勝亦斂兵入城。二十一日，國軒大隊至石頭街，留石頭屯劄。二十二早，攻南門橋。將軍楊鳳翔令同安副將馮昭京，督眾禦之，至未刻方退。二十三日，軒分兵屯桃花山，連營東嶽廟，直亙至清源山。二十六日，攻奪洛陽橋，於是泉州震動。
親王接剛舒失海澄之報，繼聞雅長里退師泉州，隨飛調浙江提督石調聲同副都統吉爾他布帶兵入閩，業於二十四日至惠安。二十五日，報洛陽為賊所據，不敢前。
二十八日，軒令王一繼駕船從塗嶺截斷興化援師。又令江勝攻南安。守南安把總張應虎同知縣宋煜，率兵民守禦。勝乘虛攻東北，密遣驍將整旅從西南角倚梯，喊殺緣城。應虎與煜巷戰，力竭被殺，南安陷（煜遼東人）。
七月初二月，軒令何祐督黃球、林萬侯、高奎、方祁、陳晏、江鎮、鄭士弘等，分寇諸屬邑。永春知縣黃寶善、典史焦文寶聞賊雲至，不敢守，同千總李德棄城走仙遊。德化知縣王之紀、安溪知縣李鈺同千總黃國棟棄城去。調聲與吉爾他布於是日午刻接報：『賊屯盤龍鋪，西楓亭一帶悉系賊艘』。聲隨傳知縣胡雲龍：『速收拾庫藏，即行』！雲龍曰：『安可棄城？罪在不赦』！聲曰：『地平城低，決不可守。如問罪，本軍門與都統擔當』。龍方隨大隊於二更退守興化。國軒日夜遣將攻打，城壞百餘丈。屢欲緣城，悉被火桶、火罐、矢石所擊，死填溝濠，乃退。
姚啟聖初聞『十四日，長泰縣被土人戴蘇（一名符）獻城，降於吳淑』；繼聞『二十八夜，漳平知縣高登聯奔龍巖縣，城遂陷。而寧洋亦被圍。二十九早，守寧把總吳應賓設伏擊退』。慮其進攻漳郡，加意提防。後聞『軒提師往同安，復統水陸攻泉州』乃喜曰：『賊計絀矣』！以漳之兵多而泉之兵少故也；舍近圖遠、棄瑕攻堅，豈能勝乎？迨至永春、德化、安溪、南安諸邑俱陷，啟聖愈喜曰：『徐當用計破之』。哈達問曰：『賊熾盜盛，公喜愈甚！且言破之易，何也？願聞其說』。啟聖曰：『賊兵不過三萬，慮其聚而勢雄。今既得諸邑，必當分眾把守。眾分，則勢弱；勢弱，則破之易也。此兵法所謂「兵多貴分，兵少貴合」者』。哈達服其論。
國軒得泉屬諸邑，分其眾鎮守，勢稍弱。遂啟經，調鄉勇充伍，並移鄉勇之眷口過臺安插，庶無脫逃流弊，緩急可用，亦存寓兵於農之意。經允其請，一時安土重遷，百姓怨望。況泉州被圍日久，水陸齊集，公帑不足、軍需缺乏，因而重科民間。國軒、吳淑同啟時弊，略曰：『為請定畫一之規，以救民生，以甦民困事。軒等奉令進取，就地權宜措餉。凡大師之所至，則此地即有供應大師之費。豈宜重為催科？今府縣之外，設有督糧；督糧之外，設有餉司；餉司之外，設有宣慰內差；而又加之以衛、鎮、義將（衛者：侍衛、武衛等是也；鎮者：凡各鎮是也；義將者：凡招募之兵以應之）。噫！彈丸之地，有限之民，正供之外，又有大餉、大米、雜餉、月米、櫓槳、棕、麻油、鐵釘、灰、鵝毛、草束等項；最可慘者，又加之以水梢、毛丁、鄉勇。民力已竭，科斂無度！伏乞速為裁罷，以甦民困。……』之語，上陳。其宣慰使鄭省英，亦以『民夫煩苦，營房重難』上啟。泉州知府陳廷章，亦以百姓困苦已極，條陳時弊：一曰，畫一政令；二曰，停藉鄉兵；三曰，禁飭招募；四曰，請改餉司。經雖發六官察議，然終不能行。以國軒、吳淑等屢用命，有功，彙敘勳次，略曰：『仲春用兵進取，二月十一日克玉州、三叉河及福滸。十八日，奪斷江東而三捷。二十四日，入踞石碼。三月初二日，大勝赤嶺。十一日，計賺水頭山。十八日，追逐祖山頭。四月十六日，新渡南閘擊退援騎。五月初五日，取普賢木柵。十二日，扼守祖山，截筆架大隊援兵。六月初十日，破海澄。或戮力行間，鏖戰著績；或守禦扼要，凜遵師令。水陸諸將，咸有功次，皆正、副總督調度有方；至以少擊眾恢復海澄，使其兵將而無一遺者，厥功尤懋。其以中提督劉國軒表請晉封為平北將軍武平伯；後提督吳淑，表請晉封為平鹵將軍平鹵伯；左虎衛何祐為左武衛，前虎衛林陞為右武衛，左先鋒鎮江勝為左虎衛，共授左都督，仍統兵進取。特諭』！其餘諸將，各加陞有差。
但泉州被圍兩月，國軒雖百計攻打，而楊鳳翔、馬長里、馬勝與興泉道王育賢、知府張仲舉等文武協心，率兵民堅壘捍禦以待救，洪魏齎臘丸密書請兵。興祚同興化知府卞永譽同題請自捐資募兵，親抵興化府救援。親王又調江南楊捷、福寧總兵黃大來與參贊大臣副都統禪布等滿、漢騎步，於二十日起程，二十六日咸至興化府。
八月初二日，黃元出使吳三桂回，賫三桂偽稱帝函，有曰：『今春，遠近文武官吏軍民，擁戴勸進，至於再三。乃勉從所請，於二月一日已正位號。方擬遺使相聞，用布腹心；而貴使黃元齎函適至。接覽之際，實喜且快。殿下英年壯士，仗挾大義，嘗膽臥薪，天人共鑑！……』云云。經笑曰：『老而反愚，妄僣尊大；英雄失望，恐不能久也』。
喇哈達以泉州受困已久，危若累卵，謂啟聖曰：『乘此秋涼，提師間道出奇兵，破賊解圍。公當善保此城』！啟聖曰：『公欲從何路進兵』？達曰：『大路賊營運環周密，急難沖突。吾欲從漳平山道，私過永春、安溪地方以覷方便』。聖曰：『公大有勝算！須謹防伏兵』。初六日，達領大隊，從天保而進。十三日，次漳平縣。守漳城賊將黃瑞鑣即獻城降。達大喜，用鑣為前導。至安溪，有翰林李光地（同其叔日■〈火呈〉，練鄉勇自衛）出迎，合商援泉（光地，字厚菴，別號晉卿，庚戌進士。甲寅，耿藩反閩，光地居山，與其叔日■〈火呈〉練鄉勇，扼險不從逆。官至拜相。■〈火呈〉以軍功，官歷湖廣永州總兵）。
吳興祚在興化，見大兵咸集，自率一旅，同驛傳道王國泰、隨征總兵李懋珠、余明傑、副將武灝、柯俊、羅萬里等從仙遊白鴿寨出，永春黃大來率一旅從仙遊廣橋、何市出，南安禪布、楊捷、石調聲、吉爾他布等滿漢騎步由楓亭大路，進兵惠安。興祚又啟摺，令水師總兵林賢督黃鎬、何應元，聯絡陳子威、陳向翌等戰艦，由海壇水陸合攻（林賢，字尊一，泉之晉江人。水務諳熟，屢有戰功。以援剿左鎮平金廈各島，授海壇總兵。黃鎬，亦晉江人，以軍功授銅山總兵。陳子威，福州閩縣人。以平海軍功，歷任廣南韶道、莊涼道，又改調隕襄道。何應元，亦閩縣人。以軍功授果北口總兵）。
十八日，劉國軒接偵報：『各路進兵』，繼而報『何祐、黃良驥、王一鵬等戰北，棄永春、安溪、德化諸邑』。計欲分師，而兵勢單薄，遂傳令於二十三日撤圍，合吳淑師。二十五日，禪布、石調聲、吉爾他布、楊捷等大隊至洛陽，見有賊船扼斷橋，守橋之北。調聲令中營參將王英等，從陳三■〈土〈目上大下〉〉渡河，與賊戰。賊將陳昇揮眾死禦。英連砍數十人，陞方遁。追殺六百餘級，溺水者無數。方得渡橋，會師泉州。
其守定海樓船中鎮蕭琛，探知林賢等戰船將出閩安鎮，大會諸將，計議禦敵之策：欲將所有戰船，盡據上風上流牽制之。章元勳曰：『藩主令我等禦敵，今反散居上流？若林賢船隻，一朝順風直下，廈門震動，是誰之咎？且兵法有云：「先發者，制人；後發者，制於人」。今乘彼尚未出港，勳願領大隊前去，寄泊港口迎敵』。琛曰：『未可與戰。彼會水陸，欲解泉州圍，勢甚雄壯，當避之！俟其出港，船隻飄颺，然後從上風沖下，一鼓可收全績』。元勳雖從眾議，終以蕭琛怯敵而計左。回船，密將所轄船隻整頓，乘五鼓潮起，揚帆直從閩安港進發。將至港口，忽然轉風，勳掀髯自如曰：『蕭琛無能！此風是天助吾成功也』！林賢知港口已有賊船，分為三■〈舟宗〉，乘潮落沖出。元勳揮船與戰，全軍覆沒。蕭琛聞元勳不遵議出船，嘆曰：『豎子恃勇，必誤乃公』！即整船往援，已無及矣。退泊海山。報經以『元勳不遵約束，擅自出兵』。錫范議琛「坐視不救，故致喪師」。啟經召琛回廈，斬之。令援剿左鎮陳諒、援剿後鎮陳啟隆，將朱天貴、蕭武、吳兆綱、郭有先等守海山禦敵。
國軒以滿、漢騎步三路齊至，方撤泉圍。次日，至同安縣，令軍士墜其城垣。仍劄營果堂、歐溪、江東橋、郭坑、長泰地方，扼漳泉往來。喇哈達、吳興祚、楊捷師會泉州，撫殘綏黎。飭造同安縣城。
二十二日，鄭經接偵「吳三桂死於衡州，諸將立其孫嗣位。改偽元「洪化」。經向錫范、繩武嘆曰：『老宿若死，權臣悻悻，定不相服。稚子安能成大事』？
九月，報『啟聖發令，欲攻長泰』。軒令吳淑督何祐、江勝等一十二鎮，屯浦南。國軒督林陞、林應、吳潛、陳昌、黃良驥等十七鎮，列陣溪西，直逼至漳之北門外「渴馬飲泉」處交鋒。自辰至未刻，我師稍怯，軒等搖旗揚威。耿精忠揮江元勳督連環炮同金槍手從中攻擊，又分騎兵左右出。啟聖率其中營副將王英、建協右營遊擊藍理同龍山營守備韓進忠、貫口營守備黃富等夾攻，箭如雨下。軒四面受敵，陣遂潰。奔至雲英渡，無舟可過，溺死者萬餘人；旗幟盔甲，布幔輜重，棄滿山野。耿精忠等追至浯浦。啟聖立令海防吳延貴造搭浮橋，克復長泰，乘勝奪江東橋。撥詹六奇劄橋之西山上；督標前營把總林朝、後營把總李近，帶兵劄橋之東山上。遂造橋，以通漳、泉往來。又列營於萬松關頂（王英因解泉圍，啟聖召其從漳平路來漳浦中營。藍理，字義甫，漳浦人。後平台澎功，官宣府總兵。歷舟山、天津，升福建陸路提督。六奇，漳浦人。以平台功，官至贛州總兵。李近，亦漳浦人。以平十九寨功，官浙江黃巖總兵）。
國軒於是日奔回石碼，收拾敗軍。仍扼據澳頭、三叉河、玉洲、鎮門、象鼻、獅山、石尾一帶，與韓大任、賴塔、江元勳、楊捷，曾養性營壘上下相對，不時以大砲互相攻擊。啟聖又以江東重要，令王英、蔣懋勳、詹六奇交相換守。啟聖以漳、泉諸屬邑俱下，獨海澄一縣及石碼、鎮門，國軒深溝高壘，首尾連環，難以猝攻。乃與賴塔、吳興祚、楊捷商議，遣漳之進士張雄齎公書出廈門招撫。其書曰：『昔令先王當國家開創之初，蓬蒿未盡，攘臂奮呼，震動天南！然終識順逆之勢，亦嘗慕義嚮風；祗緣群識搖奪，終不忍父老嗟怨，靜處臺灣。今貴藩能體會先志，念井里瘡痍，翻然解甲解兵，縱數千萬子弟，盡還耕漁之樂；身享茅土之封，歲時祭器陳於寢廟。天和人順，永垂世世，豈非千百年鞏固之業哉？客歲使還，往宣朝廷德意，已識貴藩仁明。獨不能詳達彼此衷曲，致數月以來，徒苦士卒，塗炭生靈，亦何益於貴藩哉？在貴藩既不惜此方之民命；則國家亦安得不調兵集馬、勞師動眾為耶？亦思沿邊之島嶼財用民力，能與寰宇之生眾較長短哉？即從貴藩下遊者，恐今昔人心不同，事勢難測。誰無父母？誰無墳墓？與其涉波濤、爭尺寸，曷若歸鄉閭、受朝爵乎？貴藩寧不顧慮及此哉？近即林達還郡，傳述貴藩大有惻隱桑梓之心。故修章布悃，惟願傾心畢論；並遣蘧使，偕臨漳府』！經禮待雄，而與馮錫范、陳繩武等商議，必以「海澄為廈門門戶，不肯讓還」為辭，送雄歸。復啟聖書曰：『頃承明教，拳拳以生民為念。不佞軫念民瘼，甚於麾下。正以生靈塗炭，不忍坐視，故修矛整甲，相與周旋。誠欲拯民水火之中，愈不得不爾。夫宴安江沱，外視民瘼，古人恥之。有大不得已於其中者，億萬生靈亦所共諒也。天心厭亂，殺運終回，苟可休息，罔不如命。客歲張、卞二使來議，曾以肝膽相告。茲張中書至，前言俱在，即與詳達，必能代布左右也。林達奔走末弁，踉蹌逃去，作何模糊，無事深求。禮應遣員奉教；但貴使之纜未解，而諸將之戈已揮，彼此差池，故未奉命。伏冀鑑原』！啟聖覽畢，笑曰：『真乃無識之夫，不足較議。夫退守疆土，永享藩封，豈不全美？何執拗若是』？十月，復遣泉紳黃志美齎公書，再往廈門勸諭招撫，其略曰：『捧復音，知貴藩惓惓以桑梓為念。息兵安民，實出於惻隱，敢不委婉承命？在仁人君子，披肝露膽，毋事繁文，永締於好』！經仍執前辭，送志美歸，復書略曰：『事欲圖其可久，言當慎於厥初。所述臺意，責人以難行之事，非安民之實心也。惟裁其可行也，而再教之』！
啟聖以招撫不就，查甲辰前例：遷徙人民於內地，仍築「界牆」守望，與親王、吳興祚合疏題請。十二月，奉旨依議。惟廣東平南親王尚之信力爭「不必遷移」，因而粵東無恙。
康熙十八年己未（附稱永曆三十三年）正月，福建上自福寧、下至詔安，趕逐百姓，重入內地。或十里、或二十里，凡近水險要，添設砲臺，星碁羅布，稽查防範。
啟聖雖一時遷徙人民入內地，終以海澄未復為隱憂。坐臥思維，未得良策。忽有海上投誠道黃性震上書平海，內有曰：『鄭經不過木偶，皆由左右之緋彩；國軒雖然桀黠，全賴羽翼以縱橫。總恃阻隔波濤，故歷二世；即有儀、秦，莫可鼓其唇舌。倘能高位厚祿，買散人心，不用干戈，立可收其績效。……』等語。啟聖讀而奇之，與衷相合，切中時弊。隨以漳州衛改為「修來館」，用黃性震董理，招海上文武兵民（性震，字元起，漳浦人。以投誠功，歷官湖南布政司）。文官投誠，即以原銜題請，准照職推補。武官投誠，一面題請換劄，一面保題現任。兵民如果頭髮全長者，每人賞銀五十兩；如頭髮短者，每人賞銀二十兩；願入伍者，立撥在營，給以戰餉；願歸農者，立送回籍，飭府縣安插，不許豪強欺凌，宿怨報仇。且有以先長頭髮投誠領賞者，嫖賭已完，逃出，復以短頭髮投誠領賞者；且有一種屢以短髮投誠者騙賞。給賞者識之，白啟聖。聖曰：『非誑爾銀。他肯來就好。若責一人，則堅彼逃回之心也』。賞而不問。以此，投誠者絡繹相繼。又以江東橋為漳、泉要道，且逼近三叉河而通北溪漳平、寧洋等縣，使無專守，恐防範不及，為賊所踞，遂題設副將一員專鎮，以詹六奇任之。
劉國軒自溪西敗績，退守觀音山，扼把各要處。迨聞江東專設重兵，謂吳淑曰：『姚啟聖足智多謀，今既添設重兵扼守江東，是有欲從北路而進兵。果堂逼近，須為預防。倘果堂有失，則三叉河、石尾等處非我們所有』。淑曰：『公之料敵，審而且詳；自當留意』。軒曰：『不出五日，啟聖必從此進兵』。隨密授方略與鎮將，伏眾守候。啟聖果以相對何日得平，與賴塔、韓大任到萬松關頂觀敵，並巡視各處要口。啟聖向塔曰：『賊營處處相連，一時未可驟破。但觀果堂一寨，逼近江東橋，實為東邊之要口。若得此寨，便可乘勢破石尾諸營』。塔曰：『公算極當。可馳諭與詹六奇，令其駕八槳合攻，並奪三叉河』。聖曰：『如此水陸齊進，可以破賊』。乃調集騎步聽令。
二月十一日黎明，塔與大任率騎兵攻果堂。楊捷、黃大來率步旅應之，而國軒、吳淑於初十夜環伏其眾於壕底，虛掩寨中旗幟，塔等以其無備，將次寨邊，寨上方發砲擂鼓，旗幟森列，四面伏起。軒左出、淑石出，祐、勝從中而出，林陞、陳昌二軍從旁沖出，似欲去奪關、搶橋。大任、大來雖分兵禦戰，終難取勝。又疑搶關，遂退，傷失甚多。詹六奇正督船欲出三叉河合攻，忽聞隨征守備鄧茂公飛馬從岸上急止之曰：『陸師已退，不可遠離，恐賊乘勢奪橋』！六奇是之，遂斂其軍守伏。陳昌等遠望江東旗幟，知有備，不敢前。（茂公，字鼎卿，詔安人，武弟子員，佐六奇，屢有機謀。後從施琅平台澎功，官廣東香山副將）。
二月間，鄭經接偵報水師林賢欲督諸船出，隨委援剿左鎮陳諒為帥，督陳起明、朱天貴等禦敵。諒用心分布，殫力提防。二十九日，見南風大盛，天色晴明，諒令起明領大趕繒一十五只，駛上南日，以作回援之師。又令朱天貴領鳥船一十五只，颺駛圍頭、湄州，以作後援。諒自率大隊熕船，進五虎門。快哨飛報林賢，賢隨督戰艦並陳子威等聯絡哨船，共一百餘號，一齊沖出。互相攻擊，煙燄蔽江，轟聲震天，未分勝敗。徐而南風盛發，陳諒乘風潮，沖入■〈舟宗〉內，左右橫打。賢船回身，自相撞衝。忽朱天貴順風而來，發砲助威。陳起明亦從北逆颺，亦至合打。賢等失船十餘只，又被天貴併一只，陳諒擲火罐燒一只。賢乘潮起，仍收入港內，陳起明見賢船盡退，急於追趕，不防礁淺，觸舵而壞。諒望見，令快哨往救。隨鳴金收軍，回泊海山。報捷，經差鄭斌齎銀幣到海山犒賞。加諒為北路統領，餘各升擢有差。
時水陸浩繁，地方窄狹，糧餉不足。經令思明知州李景，議派殷戶助餉。有孀婦樊門辛氏捐銀三百兩，經嘉獎之。其餘照上、中、下均派不等。廈門因丁巳歲二月初十日，經在漳奔出，踉蹌不敢喘息，即欲登舟東歸。全島百姓遮道留之，曰：『且昔先藩在日，未有臺灣，惟金、廈各島，尚與抗衡。今藩主何去之速，而棄我民也』？經曰：『欲守兩島，恐乏糧餉』。百姓齊應曰：『藩主若肯駐劄，護衛百姓；我們每戶每月願輸米一斗，以佐軍食』。因此經方停駐。豈料日久，百姓各尋勢蔭免。按月徵米無幾。遂令副鑾儀陳慶，挨門逐戶清查，一概不許影藉名色蔭免。且於是日起，每戶每月要徵米二斗。百姓一時怨望，道路側目。國軒見軍糈不足，又屢屢加徵百姓，隨自辭俸祿。並請捐資月養轄兵，啟曰：『軒謬荷俸祿，固出中興隆典；第軍糈繁費，何敢再縻金錢？請辭月俸，願竭微資自給轄兵三月，稍寬百姓萬一』。經允從之。於是吳淑、何祐、江勝、林陞等俱上啟，循國軒例。援剿前鎮施明良捐銀一千兩助餉。水師五鎮蔡仲彫分守惠安沿邊，以其老耄不能約束，經令虛宿鎮王傑統其眾，調仲彫回廈。仲彫駕小船入泉州投誠。巡撫吳興祚用之。各鎮營欲請餉給兵，又不敢；欲捐資養兵，又無力，是以懷疑觀望。折衝左鎮呂韜率眾投誠。（呂韜，原漳州城守營守備。出守江東橋，戰北，陰通國軒。事露，啟聖參拏解省審問。軒偵知，遣英義鎮林彪帶眾伏於同安界牌，截搶歸海），木武鎮陳士愷挈眷入漳州投誠；牛宿鎮鄭奇烈同紀朝佐請入山招募措餉，經允之，亦率眾投誠。啟聖俱委以隨征營將。尋而題請陳士愷為延平副將。鄭經亦以各鎮營分汛橫征，百姓重困，遂通行飭禁；略曰：『水陸鎮營，分疆固圉，就地措餉，實出權宜。近察爾等暴索橫征，苦累生靈；或藉端抗餉，焚掠無遺，殊可痛恨！相應嚴飭，務遵法紀，以副勤恤至意。敢有仍前害民，定以軍法從事。毋違！特諭』。又仍設監紀一員，上自浙江舟山、下至廣東達濠，監察核查各鎮營地方，大小措餉辦船按季造報，不許重為科斂。
鄭經自甲寅歲接耿精忠書，統眾西渡，將臺灣地方委總制使陳永華留守。華胸藏韜略，持己廉正，法嚴約束，夜不閉門，百姓樂業。後見經諸弟微有恃勢，佔奪民田，華雖屢遏止，似若艱於破面執法。遂以『元子年登十六，聰明特達，宜循「君行則守」之典，請元子克■〈臧上土下〉監國』。經允其請。四月初六日，遣禮官鄭斌齎諭抵臺灣，同陳永華立克■〈臧上土下〉監國。■〈臧上土下〉，永華婿，每事悉受華教，明敏果斷。諸叔有欲奪佔，事聞，■〈臧上土下〉讓諸叔曰：『當以國為家，百姓足，則自足矣！何必自有為哉』？必執不可。諸叔不敢橫為，百姓喜有天日。
初十日，啟聖以沿邊地方接濟，皆由臺堡疏防，議欲設砲臺。離泉州六十里，有東石地方者，刻日興工，名曰「靈水寨」。百姓虞其界禁，悉出東石販鹽藏貯。一時鹽價高貴至一兩二、三錢之間。十八日，屯田道鄭時英在東石徵餉，見鹽價高貴，啟請兼理鹽政。經允之，仍設餉司二員，催督官買官賣，漏私者罪斬。又檄林陞：遣其轄下右協副將楊忠，往南北鹽埕掘鹽。將行，陞戒之曰：『鹽埕逼近竿嶺寨，乘潮而搫、乘潮而出，方保無虞。若停住其間，恐生意外，悔之無及』！二十二日，忠不遵升諭，船泊深滬，督掘二日。竿嶺寨防飛報泉州提標中營參將馬勝。二十六日，勝即督騎步千人，星夜往剿。平明而至，四面攻擊。忠奮勇與戰，身中數箭，且戰且退，衛其眾欲登舟遁去。奈馬勝逼之緊，忠計難脫，投海而死，諸賊盡沒。陞聞之，嘆曰：『惜乎！健將不聽吾言，宜其死也』！報經，經亦憐惜之。遂寢掘鹽事，調二餉司回，責時英多事。
五月，啟聖督造堡臺，嚴禁接濟。除國軒所據之處無可奈何，其餘地方加倍設禦防範。國軒亦以『石碼固壘，啟聖必艱於進兵；但同安潯尾與廈門高崎咫尺帶水，且前歲廈門癸卯之役，李率泰提師亦由此入島，宜築臺寨，重兵預防。此實未雨綢繆至計，勿使臨時慌張』，啟請，經從之。令李景抽民夫，並取討磚石、鍬鋤等類，馳諭國軒，到彼處擇築。國軒將石碼營盤交吳淑巡督，坐快哨至廈門見經，帶快哨與陳昌、黃良驥二旅往築「潯尾寨」。同安守將知潯尾欲築寨，率騎步千人，前來攻擊。軒已分布埋伏，騎兵一到，四面齊起，殺傷甚眾，遂退。軒亦收軍，督造石城一座、土城一座，命將守把。又巡至汀州，再築一座。
時有泉之同安人江機，綽號「■〈木咢〉子」；與楊一豹同糾眾，歸耿精忠。忠授機左軍都督，出寇江西。迨精忠歸正，機即統其所部，招集餘黨將萬人，寇閩、浙、江右交界之所。康親王及三省督、撫屢遣官招之，機不從。密令其中軍楊麟，伏行至廈門，納款於鄭經。經允其降，授機為征彝將軍。機率眾欲下海，途由建寧。守建寧副將劉起龍督兵截殺，不期機先分其半，欲去攻城。起龍恐城有失，隨領全師回援。機見龍兵抽回，乘勢掩殺。起龍兵大亂，身中流矢，無心戀戰。回至城中，是夜身亡。飛報親王、啟聖，聖馳令各處隘口，重兵把截。一面差官再招之。機見山路遙遠，而各處守禦又緊，計絀，隨率眾投誠。
康親王見劉國軒布置周密，一時不能即平；中書蘇礦以『邊海殘黎受困已久，欲申前議招撫，息兵安民』，啟請親王，親王許之，遂遣使致書於鄭經，有曰：『謀發盈庭，事歸獨斷。既感貴執事之萬鈞，更欲踐季布之一諾也。惟誠惟決，伏候確示』！經得書，與錫范、繩武議曰：『蘇中書欲申前約和議，以安邊黎，誠盛舉也』！復札略云：『「誠決」兩言，予實嘉納。惟以此致意貴親王：若肯降心相從，則何猶豫之有』？礦閱其書有可為之機，將回書繳呈親王；並請欲遣其胞姪埕往廈，以申所約。親王允請。埕從泉州之安海出廈門，見經。經集六官，埕致親王之命：『若貴藩以廬墓桑梓黎民塗炭為念，果能釋甲東歸，照依朝鮮事例，代為題請，永為世好，作屏藩重臣』。經曰：『當先王在日，亦只差「削髮」二字。今既親王能照朝鮮事例，不削髮；即當相從，息兵安民也』。錫范曰：『海澄實為廈門之戶，決不可棄。今既承親王之命，將海澄為往來公所』。埕曰：『欲照朝鮮事例，貴藩當退守臺灣。凡海島歸之朝廷，以澎湖為界，通商貿易。海澄乃版圖之內，豈可以為公所？此不但親王不敢題請，即埕亦不敢代為轉啟也』。錫范曰：『息兵安民，地方相守，豈有棄現成土地之理乎？當照先王所請，年納東西兩洋餉六萬兩』。埕曰：『既如此，又非埕之所得自專。必當再請於親王，看王如何施行。須得一人同往福省報命；苟有成說，亦免於僕僕往返也』。經是其言，令酌舉一人為使。陳繩武舉賓客司傅為霖有材干，堪為使者（為霖，乃洋商傅參宇之子。前投誠，任松江府通判。有機智巧令，繩武雅重之，薦為賓客司）。經令為霖同蘇埕從安海登岸，由泉州入省，先見蘇礦。礦將經書上親王，有曰：『此蘇中書兩啟，欲息兵安民，故專一介面商。今特遣賓客司傅為霖馳報，仰候明旨』！親王待為霖禮甚隆。議往來事宜，並海澄作為公所。為霖曰：『若千歲永鎮閩邦，則藩主並行往來；倘千歲奉命回京，各設官來往』。親王以地方重務，責任全在總督，未可輕為定議；令為霖順途抵漳見啟聖。聖曰：『寸土屬王，誰敢將版圖封疆輕議作公所？此前院清泰劉公之所謂「無此廟算也」』。遂阻其議，但見為霖應對便捷，加禮相待；且惜其才而不為世用，執手戀戀，餽贈甚隆。為霖感激，亦恨其不能執鞭隨鐙也。為霖回廈復命，兩寢其議。
啟聖以平海非老宿諳練水務者不可，今黃芳世已死，水師提督缺現空懸；苟非其人而任之，難以奏膚功。因查歷任志切平海者，惟有施琅，現在京為內大臣；當此任，非琅不可。遂具疏題請，保琅為福建水師提督平海。奉旨：調鎮江將軍伯王之鼎為福建水師提督，以其曾任漳浦總兵，諳熟閩地。之鼎不敢違旨，星馳入閩到任。後屢疏題請乞休，以未經水戰，海島不熟，恐誤封疆，有負朝廷至意。請調慣熟能員。奉旨：改調之鼎為四川提督，擢湖廣岳州總兵萬正色為福建水師提督。正色接報，遂出謝表，並題請隨帶左部千總署中營守備陳儒等將士共五百員入閩。奉旨：依議（正色，字中菴，泉之晉江人，能使大刀。海上投誠，改姓黃，移駐山東。甲寅之變，歷著戰功，任陝西雲安鎮左營遊擊。征朝天關，破賊千餘顆。困於盤龍山，屢劫其營。正色奮勇禦之，共二十七日。後窺賊勢稍倦，正色持大刀，首先沖殺。手刃十餘猛，眾咸以一當百，破圍而出。敵人聞其名，咸稱「黃大刀」。官山西平魯衛參將，方復姓萬。儒，字孝若，別號雅菴，泉之安溪人。亦海上投誠。有膽略。從正色征戰數十陣。當盤龍山之困，儒亦在焉，與正色首尾禦敵。迨擬沖圍，又令儒殿後。在岳州，曾獨駕八槳船，擊吳三桂巨■〈舟宗〉。殺賊焚舟，仍出毋恙，賊遂相戒云：『當避陳長子』！因其漢高大，故渾名之。後隨正色入閩，平海壇、金、廈等島。至施琅，方用儒中營守備，配坐大鳥船，克澎湖、撫臺灣，始復姓林。官歷貴州安龍總兵）。
七月，啟聖以原漳南道陳啟泰子汝器奉旨來漳搬運靈柩，途次泉州東石地方，被劫解廈門；屢遣說國軒放汝器。軒委之於主命，業送之臺灣，不敢擅請。挨延日久，而部文催汝器回京疊至。啟聖計絀，集文武捐銀一萬兩，贖汝器回。軒許之，啟經：『留汝器無益』。經方馳令到臺，放汝器，送之歸。
八月，啟聖見海賊猖獗，終年對壘，似非善策。一面密咨楊捷暨檄沿邊鎮將，善覷方便，疾速進剿；一面差楊榮出說國軒曰：『當夫三藩並倡，爾主有七府甲兵縱橫之盛，烏龍江一旦塗地。今何必又力爭片土，戕害人民，使豪傑寒心？不如勸爾主，全師退保臺灣，海外自鎮為上策。苟以區區為得計，恐一旦師旅雲集，樓船合攻，斯時欲求自容，且不可得。豈不令天下後世羞』？國軒不聽。
九月，鄭經以各鎮營或分南北水汛者、或應漳、泉守禦者，乏兵扼把要口，虞有不測。議調練廈門鄉勇自衛，得有二千人，以總監營康熊同原協理五軍都督吳桂分督操練。但前癸卯歲亦藉鄉兵，不久而敗；茲蹈故轍，時有識者，知其將亡也。已而果驗。
「東石寨」者，乃林陞地方。國軒調陞攻海澄，委其健將惠安人楊忠鎮禦之（忠，猛勇勤謹）。迨啟聖置「靈水寨」，忠恐啟聖乘勢來攻，啟請添兵，經仍令林陞回軍。及楊忠掘鹽死於深滬，升又奉調督兵石碼，委其部將施廷、陳申二人共守之。因申醉後，鞭撻其健卒楊虎、李萬金，金乘夜逃入泉州投誠。密稟提督楊捷：『東石悉系老弱，寨內空虛。願為前導立功』。捷即調騎步共千餘人，二十六日平明至東石，四面環攻，填平溝壕。自辰至未，施廷、陳申分頭率眾力禦。廷被刺，申為流矢所中，俱死，全軍皆沒。捷得其寨，隨擇地調民夫，再築三寨，分兵鎮守。外汛殘卒奔報林陞，陞欲反師來援；俄報寨已破矣，陞乃停其軍，報經。經令各處提防，恐楊捷繼至。
十月初二日，馬虎、李時春交結搖艍艍仔楊阿德，乘潮渡二人，私從星嶼登岸。原提標左營遊擊郭承隆於破海澄時降經。經又遣人密入泉州搬其妻子出廈，授承隆為監督。魏赫謀逃，被獲；經悉徙海澄降將於臺灣，僅留馬虎、孟安等。迨李時春又逃，承隆恐累及於己，亦棄其妻子，入漳投誠。啟聖用之。
劉國軒得東石寨已破之報，會集吳淑、何祐、林陞、江勝、林應等商議曰：『東石之破，是敵人窺侵之漸。但果堂實系扼要重地，一寨勢孤。萬一姚啟聖統兵雲集來攻，救應弗及；則各處搖動。當於果堂後坂尾地方，再築一寨。諸君以為何如』？淑曰『坂尾寨築，則果堂有靠；公之度勢料敵，真出萬全！若欲興工，必須提防，啟聖必率兵來爭』。軒曰：『煩公率眾督築，弟按兵以待』。淑曰：『謹遵令』。即與江勝領所部眾，悉帶鍬鋤。初六夜，至坂尾，開基址，搬運磚石築寨。初九早，工程將半，耿精忠、喇哈達、賴塔、姚啟聖、江元勳、曾養性等，率滿漢騎步萬餘人，沖突並爭，鋒銳極熾。吳淑、江勝將所部眾，分首尾鏖戰。自午至申，互相攻擊。國軒、何祐、林陞、林應見其鋒銳稍息，方從旁出攻。軒又戒令勿追，惟依寨拒之。耿精忠揮金槍手齊攻，軒令各鎮火攻營鹿銃對打。何祐又遠道統率一旅橫沖，合林陞共擊。忽章京石兔被砲傷死，達見勢難爭，始引師還。而日已西，國軒亦鳴金收軍；撥眾伏路，然後就營安歇。
初十日，軒又分布以待，兼督造。寨成，吳淑毅然領守，軒率何祐等仍回觀音山。啟聖知守坂尾寨者，吳淑也；密遣人說之。許其代為題請，赦其「獻漳」罪，即官以銅山總兵。淑曰：『極感制臺厚愛；但丈夫遺臭一次，豈可再為萬世罵名』？謝絕之。啟聖知淑志堅，非名利可動。惟遣將不時攻打，砲火如星。淑指揮接禦，無失。又逼寨數次，親臨禦敵，身中兩矢，令醫調治，晏然自若。會雨傾盆，連日淋漓。其寨新創苟就，牆垣不牢，隨處散崩塌壞。淑令軍士盡出帳房避之，獨自不移。十一月初八夜二更，墻倒壓下，淑與左右死者七人。其部將按兵秘喪，飛報鄭經、國軒。軒星馳抵寨，列陣伏防；抱屍號哭，三軍墮淚！遂厚殯殮，速回廈門；令江勝修築把守。經聞報，慟傷減食。迨淑柩到，親出海埏接之。撫棺痛哭曰：『天何奪吾輔之速也』！情甚哀。祭葬之。以其子天駟為建威右鎮，統其眾（田單之拒強燕，與吳淑之守坂尾，可謂並肩無二。奈天不祚明，使其早逝。則軒之無輔佐，不能恢復可知。惜夫）。
鄭經以武將不但辭俸而且捐資養兵，何文官無一慕義，樂輸協理？禮官楊賢即先上啟，欲捐資助餉。陳繩武聞而惡之，從中說經曰：『各鎮有地方之派米、派餉，繼派雜戶，故請自養其兵，是有所出也。文官束手辦公，勤勞從事；雖奉差有限，焉得餘資捐助』？經懦而無斷，遂寢其議。
啟聖屢分兵攻擊。國軒設伏，百計禦之。相持兩載，而海澄終不得平。因查癸卯歲前院李率泰攻破廈門，實有荷蘭為前導。與興祚合疏題請，欲照前年事例：『用荷蘭為先鋒，攻克兩島；然後合攻臺灣，還荷蘭』。奉旨：依議。啟聖加隨征知府江南人劉仔道銜（後官建寧知縣），同通事黃鏞、林奇逢配健卒百名，護送敕書，前往荷國封王，並說其『出夾板，前來會師，合擊各島，然後再攻臺灣而還』。王雖拜受詔書，而以前歲失約為辭。劉仔與鏞轉請曰：『當日之克兩島未曾合攻臺灣者，是揆一王自投請行，故前部院未敢擔當，須當請旨。迨奉旨欲共出師，而揆一王諸船已失於普陀港矣；致我師獨往，而未成功。豈有部院許而不行乎？今系部院題請，奉旨專差前來，欲與貴國合兵，克平諸島，攻還臺灣。又非昔日可比』。國王以揆一王已死，乏人統兵，堅執不出夾板。惟厚待劉仔等，送之歸。啟聖見荷蘭不允請，會喇哈達、賴塔、吳興祚商議：就福州造大戰船四百只，又往浙江調戰艦一百只，再令江東副將詹六奇到潮州造■〈舟古〉艚一百只，兼工督成，俟萬正色抵任，大舉舟師，水陸合攻。
但陳繩武雖說鄭經文官無力捐助而寢其事，然於心不安；隨轉囑協理戶官楊英啟請『生財之道，以資軍糈，均養鄉兵：殷戶助餉，並月米、毛丁以及渡載、豬牙、酒稅、鐵、炭、油灰諸類，雖孤寡亦不免』。又令思明知府李景附會其說，倍加派輸。百姓怨聲載道，欲逃無門。國軒見經每事昏憒，政出左右；近又惑於亢宿鎮施明良，終日馳射，酣飲達旦。令人密窺所行，刻為報知（明良，即施鳳也）。明良業與啟聖交通，許以公爵；欲擒經而獻諸島，故曲意奉媚繩武，婉諂錫范。二人咸喜之，屢薦其才，是以日見親幸，不離左右。明良又薦傅為霖『胸藏經略，有國士風。豈但堪為使者，不辱君命而已』；並王世澤為羽翼。世澤曾為女宿鎮，施琅養子也。因風傳施琅仍出為水師提督，故解兵權，以避嫌疑。迨丁巳七府俱敗，世澤叛海投誠，從段應舉隨征。舉受困海澄，城破，世澤復叛清歸經，經仍授為監提督。與明良二人合，密款於啟聖。聖以其能共擒鄭經而獻全島，自當保奏，封為公侯。故明良、世澤媚奉慇懃，不但鄭經墮其術中，即錫范、繩武亦不自覺也；獨武平伯劉國軒時刻窺防之）。
康熙十九年庚申（附稱永曆三十四年）正月初十日，國軒坐快哨到廈門見經，備陳『宿將已沒，禦敵乏人，時事可慮。兵力單薄，藩主當臥薪嘗膽而用全副精神；豈可荒嬉，以一切政事徒委他人？況施明良利嘴劍腹，宜遠之，不可親幸』！經曰：『明良不過一人而已，政事之暇，聊佐談論，餘無他預。且明良之忠肝義膽，種種可愛，君何不相容至此』？軒曰：『自古以來，大奸似忠。軒何不容？恐誤藩主大事耳』！經曰：『我自有主裁。君留心軍旅！廈門之事，勿多慮焉』！軒辭經，仍回觀音山。明良知國軒疑己，遂令心腹將士備八槳，在所鎮之地方高崎，欲賺經巡視海口，擒載渡海。十三日，經偶出，明良從行，乘烏驢，甚是雄壯，經戲之曰：『烏驢肉最佳』。明良歸，立將驢宰烹進上。經大悅，留明良共飲。飲間說『劉總督欲起民夫，填平潯尾港進兵』。良曰：『潯尾港水退雖狹，恐流急難填，藩主明早親到彼地巡勘，便知端的』。經許之。明良次早攜樽酒並所製烏驢肉脯，請經行。經起盥櫛，不通知諸將，即同明良去。適是夜國軒隨潮出，欲入見經。左右覆以『藩主同亢宿鎮去巡海』。國軒駭然曰：『藩主何輕許如是』！隨披貼身甲，持大刀，從者二十猛，飛馳追之。明良喜經墮術中，沿途指揮某處險，該設備；某處最險，該設砲臺；徐徐而行。將至高崎，喜經籠中物也。忽見一騎飛馳而來，英風凜凜。近視之，乃總督劉國軒也；明良失色。軒曰：『巡視邊土，非藩主所可輕身！宜速回駕，會議要事』！經同軒轉轡；而明良大失所望，無奈亦尾隨其後（蜀之安樂公惑於黃皓，雖有姜維之忠心，亦難於制禦。國軒力守兩島，不絕如縷，經當臥薪懸膽，以圖中興。何如此惛憒！但明季當斬，天數已定，何待言乎）。
時國軒衛經回，卻不明言。會議完，即回棹。細忖藩主深墮明良術中，非口舌所能爭；必當提其真情，方可。遂置心腹於廈門各要口盤詰，又密令偵者入內地打聽。倘有風聲，立刻飛報，以便剪除。明良被國軒識破追經回，心亦惶惶，即上啟辭退。經召明良入，慰之曰：『爾之肺腑，本藩深知。爾莫過慮，安心供職』！良叩頭流血，曰：『深蒙藩主眷顧，格外知遇。雖肝膽瀝地無以報高深』！經撫明良背曰：『爾莫過慮』！明良頓首而起。愈加迎媚，經愈親幸之。國軒得內地偵報，施明良果暗通總督，欲獻全島。軒即飛啟曰：『為內患不除，國之安危未定事。有施明良密通賣國；不但明良一人，黨羽甚多。……』云云。經接啟，示繩武曰：『明良不過一人在吾左右而已，何中提督之忌刻若是』？繩武曰：『明良之忠奸，總難逃藩主洞鑑。但既然如此，勢難兩全』。經曰：『不如暫令明良同王世澤過臺灣，以塞口舌』？繩武曰：『此乃藩主始終覆載之恩』！武出傳經意，即撥船載明良、世澤眷口過臺。軒接報，知經不拏明良鞫問，反縱之過臺，隨坐快哨到廈面經。傅為霖陡然見國軒到，疑為底裏盡知，恐累及已，隨出首明良、世澤通姚啟聖始未情由。軒曰：『不除此賊，終為國患』！經思明良、世澤必去投誠，差副鑾儀衛陳慶帶健將三十人，坐八槳船，追斬明良、世澤全家。慶得令，趕至大擔。良等因風信未順，暫泊大擔。守者報陳慶船到，明良嘆曰：『吾命休矣』！慶上船，出藩令，立斬明良、世澤並其子三首級，以歸報經與軒。經亦為之嘆息。國軒以明良之故，順潮出入。今喜內患已除，啟經『宥其同謀，重為整頓一番，設立防禦』。乃坐快哨，安心入觀音山。啟聖聞明良等事露被誅，嘆曰：『果「謀事在人，成事在天」也』！
萬正色舟師次定海，因接上諭：欲待荷蘭船到，然後進攻。色曰：荷蘭無期，即有期，亦在五、六月間，南風盛發，方得揚帆，豈可枕戈以待？不如乘勢取海壇，以挫其鋒』。
二月，萬正色在福州催造船隻已完。隨遣人於漳、泉，知會喇哈達、賴塔、姚啟聖、楊捷諸將：『率大隊舟師，出攻金廈。其陸師，亦各為齊進相應。劉國軒在觀音山，必分兵出敵。彼若分兵，則勢弱；勢弱，攻之必走。不但海壇可得，即海澄諸處，亦可復也。海澄復，賊心自虛，則廈門亦不敢守』。又對吳興祚曰：『弟今督舟師出，占其上風，賊必退崇武。公可督陸路諸將，沿海各港駐劄，施放砲火攻打，勿使賊船得以灣泊取水，則彼自亂』。興祚許之。
鄭經接偵報：『水師即日欲出福州港』！隨馳諭與國軒，調林陞、江勝出廈門。加陞為水師提督，督江勝、陳諒、朱天貴、蕭武等北上迎敵。萬正色督林賢、黃鎬、陳龍、楊嘉瑞等諸戰艦暨陳子威聯絡哨到海壇港口，與林陞相遇。各放大砲，互相攻擊，未分勝負。忽朱天貴沖入，左右橫攻，打沉大船二只，我師少怯。林賢遙望賊勢猖獗，率其本標巨艦三只，轉從上流，坐風沖下攻打。萬正色亦督諸船回頭，相應合擊。天貴等方遁出外洋，正色鳴金收船入港。林陞見正色悉入港內，全隊欲寄泊圍頭；奈沿邊海岸咸被吳興祚率陸路勁旅密佈屯劄，安砲守禦，無處灣泊。隨即寄椗，傳諸鎮會議。陞曰：『今者，邊海地方，砲臺密佈，營盤扼守，舟師不得灣泊，樵汲維艱。意欲全暫退守遼羅，諸公以為何如』？天貴曰：『退守遼羅，萬萬不可！今日之戰，雖未破敵，然敵人之膽亦少遜怯。豈可反避而自搖動乎？可將諸船進泊海壇，分一旅把守觀音澳，再令一旅寄泊石排洋一派地方。倘水師出港，可以互相牽制。不但便於相援，而且可以攻擊。然後密令小哨，窺其疏防之處，樵汲接應』。江勝、陳諒咸以『天貴之諭甚高，宜從之。若退遼羅，恐廈搖動，則陸師危矣』！陞執己為總督，當聽吾指畫，不從眾議。傳令：『全師退泊遼羅』！天貴辭去，仰天嘆曰：『藩主用此輩為帥，大事去矣』！遂諭本部船隻為備。二十三日，林陞率全■〈舟宗〉悉退遼羅灣泊。
劉國軒據守觀音山，馳令：『各營嚴謹把守！如有敵人侵境，立即飛報，以便提師救應。候水師信到日，再作計策』。鄭經亦以啟聖水陸並進，陸有國軒可當一面；未知林陞水師如何調遣。二十四早，忽快哨報：『林陞全軍溜退，俱泊遼羅』！經與錫范、繩武等大驚。繼而升亦差人齎啟至，報『大勝萬正色於海壇地方。茲因沿海營壘密佈，艱於樵汲，故暫退守遼羅……』等語。經疑升為戰北，借言塞責，以安人心。廈門一時震於樵汲，故暫退守遼羅……』等語。經疑升為戰北，借言塞責，以安人心。廈門一時震動，百姓皇皇。且諸六官正慮輸餉之苦，遂各張大其事：『必是戰敗。若戰勝，豈肯退守遼羅乎？當速為備，莫使臨時愴惶』！經是之。即遣人馳諭入觀音山與劉國軒，有曰：『邇海壇征帆業退遼羅，是思明將危，海澄何用？速當回師，以商進止……』云云。軒接諭，氣填胸臆，口不能言。半晌，方令人傳集諸鎮，將藩諭通示；仍相議退兵之策。各鎮曰：『謹聽本督之命』。軒曰：『既如此，不得不回師！爾諸鎮將當徐徐而退，勿得慌張』！各領命而去。獨陳昌一鎮守謝村、鼓浪嶼，知廈門信危，隨遣人密通啟聖；聖即會喇哈達，統滿漢騎步分道進兵。軒知啟聖分道齊來，一時軍士風鶴，無心戀戰，遂棄諸寨并海澄縣城，乘夜出廈門。見鄭經，經出林陞啟示國軒，軒頓足曰：『右武林陞戰勝，尚如此驚怖！倘若大敗，將奈何？亦當遣人細探果否，然後發諭。無故自生疑畏，一旦付之流水！諸君輔理贊畫者，悉如是乎』？錫范、繩武語塞，無以對，惟曰「天意」而已。
二十五日，喇哈達、賴塔、姚啟聖、楊捷統滿漢騎步進攻，賊將康騰龍獻■〈氵丙〉洲。二十六、二十七兩日，分道克陳洲、玉洲、彎腰樹、福河、下滸、三叉河、石碼、觀音山、展旗寨、曹門寨、澳頭、象鼻、虎頭山、馬洲、果堂、太平寨、觀音寨（在果堂寨左邊）水頭、獅子山一十九寨，並海澄縣城。出示安民，禁止擄掠。
鄭經於二十六日接報『康騰龍獻■〈氵丙〉洲，引姚啟聖各道師雲集海澄縣暨海滄地方。不日即會同水師合剿廈門』，百姓震動。軒出示禁止，並兼紅旗巡緝；如有造言煽惑者，斬！二十七日已刻，全島人民鼎沸，攜男挈女，各自逃竄，莫能禁遏。經見人心已變，即令典寶劉陶、鑾儀陳慶將演武亭花園所有輜重寶玩，悉運過臺。時，陳昌業通姚啟聖，偵知經已倉皇登舟，乘虛無備，遣健將楊一彪帶猛漢三百名，駕八槳五只，詐稱本鎮欲請藩令，抽兵同行；欲劫經獻功。適建威中鎮黃良驥侍經，遙見所來八槳，其勢兇猛可疑；急啟經曰：『陳昌請令，用一快哨足矣。何用八槳五只？其中有詐，宜止之，不可與之近船』！經發令開砲，鹿銃齊攻，沉二只於海，三只飛駕而去。昌知計不成，遂率眾投誠。而諸六官洪磊、楊英、謝賢等已揚帆出大擔門，隨經鷁首東向。馮錫范、陳繩武會劉國軒、何祐，懇其引軍為援，踉蹌挈眷口、嬖倖、玩好、輜重登舟。其百姓無船可渡者，遍滿海濱，號啕之聲，與淜湃相和焉！甚至慘遭擄掠，情極赴水者，難以指數。協理五軍都督吳桂同信武鎮黃瑞二人，見百姓狼狽難堪，按其所部，分頭傳諭：『爾等百姓，勿得驚惶，各自回家靜候！本鎮自當差人渡海，飛請將軍、部、院到廈門撫綏』。幸賴以安。
是夜三更，啟聖接吳桂、黃瑞遣人投誠，備陳鄭經、劉國軒已遁臺灣，請大師過廈門，安撫百姓。啟聖立遣陳昌駕八槳，先行接應。即與喇哈達配師在船，二十七日分道出廈門。出示安民，秋毫無犯，百姓樂業。啟聖又遣官分頭駕船，招撫餘黨。
二十八日，經到澎湖，無顏即歸，同錫范、繩武、國軒、何祐等住娘媽宮。監國克■〈臧上土下〉知其父回師澎湖，與留守東寧總制使兼管勇衛事陳永華率諸文武士庶，連啟接踵，請經回臺。經方領錫范、繩武、國軒等，全■〈舟宗〉而回。見其母董夫人，夫人責之曰：『七府連敗，兩島亦喪，皆由汝無權略果斷，不能任人，致左右竊權，各樹其黨耳』！經無以對。仍令侍衛全旅守安平鎮，其餘諸將各歸汛其部卒屯田。
喇哈達、姚啟聖咸集海澄，飛咨往泉州咨會吳興祚、萬正色：『當乘海賊虛危，速出師攻擊，克復諸島！不可稽遲，致死灰復燃，以為沿海生靈患』。
但林陞自退遼羅，諸將不服，各有竊議。迨接經諭，知國軒十九寨並海澄已去，人心虛危，廈門難守。當令各鎮收拾東歸，俟再後舉。陞秘之家，傳其所轄部將於二十八早，駕言『自統本部船隻，前往泉州港口巡哨』。遂遁澎湖。
吳興祚、萬正色二十九日接啟聖咨移。三月初一日，興祚統師從陸路；初二日，渡五通抵廈。萬正色於初一日同林賢、陳龍、黃鎬、楊嘉瑞、陳子威等出港；初二日，到金門會集。朱天貴見林陞巡哨未回，遣人偵探，方知劉國軒已去十九寨並海澄，出廈門矣，即整備諸船觀望。其江勝見陞去，亦託出哨，統其所部船師，出颺遼羅外洋。
朱天貴接偵者來報：『經棄諸島。國軒、何祐等諸鎮，咸回臺灣。陳昌投誠。吳桂業請將軍部院過廈門』。喜曰：『國軒若去，餘者碌碌，不足慮也』。又報：『泉州水師數百號，連■〈舟宗〉出港』。天貴即將船駕上北，截劫東洋船。任眾剽掠沿海地方，纔統大隊舟師下銅山。守將左衝鎮馬興隆同昭義鎮楊德和、中衝鎮鄭添等，初聞國軒棄十九寨出廈，遂戒嚴守望，以虞不測。繼報本藩東回，即整備船隻以待。忽瞭望者報：『有巨艦數十號，悉系我們的旗幟，揚帆而來』。興隆立遣快哨，前去偵問是何船隻。一面金鼓旌旗，嚴肅隊伍，各起頭帆、浮椗備敵。快哨至半洋，『問來者何船』？回曰：『本督下來探哨』。復問曰：『系劉本督麼』？貴著人詭應曰：『是』。哨探轉櫓棹，飛報曰：『系劉本督船也』。興隆以國軒未從經去來此，率諸鎮列船往接。甫登舟見之，乃天貴也。興隆等相顧失色。天貴會諸將意，曰：『諸公以天貴有二心乎？貴無二心。茲因金、廈失守，藩主東歸，弟正撤師至此，欲會諸公覷方便，克復兩島。諸公若不信，吾只有一子，指水與諸公誓』！興隆曰：『本督之心可貫日月，勇略素聞不亞武平。隆等願聽指揮，豈有生疑之理？方纔錯愕者，以其報者之誤。幸是本督，苟他人將誰救解』？俄頃，江勝率本部船亦到，各相見敘時事，悉入銅山澳內灣泊。天貴託言船大，港路未諳，恐犯礁線，將所有熕船盡列一字，拋碇於港口，困諸船於內。江勝夜忖天貴舉動可疑，令諸將士勿棄甲，預備砲火。天微曙，差人坐杉板，至天貴船中請令，欲乘北潮往南澳、達濠，尋邱煇。貴素與勝善，又見其船隻堅牢，甲士猛勇，留之則勢敵，而艱於下手，不如賣個人情許之。勝得回報，隨即起椗飛帆而去。貴見勝船出港，隨傳令諸鎮將到中軍船議事。即將馬興隆、楊德擒下。興隆大罵曰：『天貴匹夫，負義叛賊！吾為厲鬼，亦不恕汝』。天貴又令人擒其子至。隆罵不絕口，天貴大怒，溺興隆父子於海，掠其家。禁楊德等於船，率眾劫諸船暨銅山子女玉帛。
姚啟聖以銅山尚有勁旅鎮守，又報朱天貴全師亦在銅山，征之費力，不如遣人撫之為善。知會喇哈達、吳興祚、萬正色差李榮春、吳英子應麟前往銅山招撫。天貴大喜，厚待應麟等；即遣林君寵同朱光祖入見啟聖，願獻銅山一島，全師投誠。啟聖謂君寵曰：『朱將軍若能如是，本部院自當保題現任總兵』。君寵回覆天貴，貴令另鑄「振遠將軍印」。五月十九日，進海澄港，薙髮投誠；請啟聖到銅山，安撫百姓。聖待天貴禮倍厚；尋而授天貴浙江平陽總兵。
時以諸島既平，議要照前例就界築壁，分兵守禦。啟聖曰：『諸島由來悉系版圖，魚鹽、田土，年計國賦數十萬。前日失策輕棄，致鄭經乘甲寅之變，猖獗橫行，蔓延數載，滋害生靈。令既藉朝廷之威福，一旦克復，得寸守寸，豈可復議輕棄以資賊乎』？吳興祚亦曰：『當留，不可棄！棄之，則賊不日復至矣』。會喇哈達、楊捷、萬正色合疏，題請「展界諸島」。奉旨：依議。自福寧至詔安，盡許百姓復業。以水師提督守廈門，分防沿海；裁內地新設如江東諸營者，設海壇、金門、銅山各總兵一員。
馮錫范同鄭經回臺，見永華把握重權，而諸事方正敢為；且又屢受微譏，心實忌之姑為陽好，陰與國軒謀。軒教錫范解辭兵權以許之。范喜其策善。一日，會永華於公所。
范曰：『自愧扈駕西征，寸功俱無。歸來仍居其位，殊覺赧顏！諸凡檢點明白，即當啟辭杜門優游，以終餘年』。永華信為實焉，歸來即先上啟乞休，經不允；華再加力陳，經意未決，范乘間啟曰：『伏甫勤勞數載，形神已焦！今欲乞休靜攝，情出於真。宜俯從之！但其所部將士，可交武平伯為是』。經依錫范議，允永華告辭，將所轄部旅交劉國軒。軒啟辭者再；經命至三，軒始統永華軍。而錫范仍任侍衛如故，華方悟為范所賣，悔無及也，心大悒怏。
永華退居無事，偶爾倦坐中堂。左右見永華起，揖讓進退，禮儀甚恭，似接客狀；賓主言語，唯唯應諾。徐而睡去。逮覺，即喚左右，將內署搬徙，讓客居。左右問其故，永華曰：『瘟使者欲借此屋，吾業許之』。左右曰：『瘟使者欲何為』？華曰：『到此延請諸當事者』。左右曰：『誰』？華曰：『刑官柯平、戶官楊英等，餘尚有不可言者』。嗟吁而已。數日，永華死，繼而柯平、楊英等亦死，悉如華言（閩頌云：『時有漁人於海底得篆碑文曰：「生女滅雞，十億相倚。庚小熙皞，太平八紀」。蓋指姚滅鄭於康熙時也。或曰：福州陳潤所造』）。
四月，臺灣彗星出，在寅申分野；一更盡，忽生四五腳。至夜半，一股白氣，墮下甚長；俄復收起。如此，一月乃滅。
五月，探報『啟聖修造戰艦，將有征剿意』。經與錫范、繩武、國軒等會議：令天興知州張日曜，按屯冊甲數，每十人抽其一充伍，訓練以備用，得兵三千有餘。其街市商民，十家共輸一丁，每名折價徵銀一百兩。貧富不均，民大怨望。
七月，臺灣彗星再見於西南庚酉分野。有白氣一道，狀如劍，甚長，沖指東方。至十一月，方消。
十月，探者報：『海壇總兵林賢，欲領舟師大隊從福州港飛渡，直過雞籠山，據為老營；漸次進兵，而攻臺灣』。錫范啟經曰：『雞籠山在臺灣之北，乃淡水上游；其澳堪泊船百餘艘。前呂宋用天主教巴禮建院，與土番貿易。因地生硫磺，不產五穀，運接維艱，放棄而去。迨先王得臺灣，縱紅毛歸國，紅毛聽通事楊宗九謀，將所有夾板駛到雞籠山，重修其院為城，意欲窺復臺灣。後系黃安督兵追攻紅毛，紅毛亦以水土不服之故而無外援，棄之。是此地最難居也。今林賢欲統師從此登岸進兵，若遣將固守，必當運糧接應。不但運糧艱難，且虞水土不服。不如遣一旅前去巡視，將雞籠山城墮為平地，棄而勿守。林賢若來，使無安身之處，徒然上山，水土不服。然後興師進攻，一鼓而破之』。經從其議。遣林陞帶兵北巡，兼墮雞籠山城。升奉令至雞籠，見其形勢奇秀、峰巒高聳；而且土地饒沃，溪澗深遠，是未闢荒蕪之膏腴，暫為鳥獸之藏窟。其土番種類繁多，無相統屬，性甚健勇。且山之頂黃金結纍，人欲取而無路可達；惟溪之內流下金沙可取。但金寒水冷，極雄壯之人，入水一、二次而已。況硫磺所產，最盛於夏秋，故五穀不生，難以聚眾。升督兵士，將雞籠山城悉毀為平地，而回復命。
但前江勝於是早令人卑辭說朱天貴，貴以夙好，縱之去。勝隨往達濠，依邱煇合■〈舟宗〉犯石井、潮陽、揭陽、澄海、饒平、惠來等縣沿邊。廣東提督侯襲爵與一等侯潮州總兵馬三奇率騎步沿海堵禦截殺，又差員駕船招撫得曾咸等，以散其黨羽。迨至天貴投誠，啟聖與正色大隊舟師悉在銅山，將欲進剿。邱煇向勝謀曰：『今者銅山、粵東雖無舟楫，而啟聖必移師南澳、達濠，孤軍恐難與敵。欲將埠頭居民悉移東都，何如』？勝曰：『此萬全之策』。煇、勝席捲而去，故達濠、南澳咸平。襲爵改潮鎮中營遊擊蔡植茂為達濠協，以林天貴為左營、蔡大茂為右營。裁潮陽協鎮為遊擊（後至二十三年平台，姚啟聖會兩廣總督吳興祚題建南澳城，設總兵一員，以楊嘉瑞任之）。時，邱煇、江勝至臺見經，經各分配屯地安插。
經以諸老宿如陳永華、柯平等相繼淪亡，不勝感嘆。遂於洲仔尾澤地，令李景監造園亭，種植花木。一日，景報竣。張日曜供設甚奢，請經遊。經同克■〈臧上土下〉、錫范、繩武、進功、國軒、洪磊、沈瑞、何祐、林陞、江勝、曾瑞、林應、陳諒、林順、鄭省英、邱煇、吳潛、楊德、黃良驥、鄭斌等文士武將，圍射酣樂，繼夜而散。經就洲仔尾園亭為居，移諸嬖倖於內，縱情花酒。下令長子克■〈臧上土下〉監國秉政，凡文武啟章一切事宜，悉聽克■〈臧上土下〉決斷。■〈臧上土下〉既承委任，撫緝兵民，剛斷果決，有乃祖遺風。經之親信權倖，莫不畏憚。
經又慮克■〈臧上土下〉年輕，未得其宜，令人默取其所決諸啟章斷事者閱之，條條有緒，心大喜悅。以其後事倚託有人，遂放縱於花酒，不預政事，而竟卜晝卜夜之歡。克■〈臧上土下〉既承父命委理政事，上至董國太、諸叔，下及鎮將兵民，繩以禮法，不肯阿容徇縱。故兵民感戴，權勢屏息。但李景、張日曜諸輩雖各斂跡，然終媚奉於經，而思甘心焉。