少阳胆为风木之府，疟家寒热之邪，必归少阳，是以疟脉多弦。少阳居半表半里之间，其气从阳则热，从阴则寒也。疟者金火交诊，故其病寒热并作也。
气分受邪，发于六阳时；血分受邪，发于六阴时。浅者每日一发，深者间日一发，极深者三日发也。浅者属阳，阳性易动，故日行之气，触着便发。深者属阴，阴性常静，故日行之气，屡触而始发也。
疟发时，虽大热大渴，必以淡生姜汤适寒温饮之。若恣饮冷水瓜果，脾胃转伤，邪气不达，绵延难愈。
凡疟疾多热，久而不解者，其人必本阴虚，法当益阴除热，非当归、鳖甲、制首乌、牛膝之属，不能除也。多寒而久不解者，其人必本阳虚，法当甘温散邪，非干姜、附子、桂枝、人参之属，不能已也。
疟邪在阳者，其证多汗，感而即发，邪不能留。其留藏不去者，惟阴邪耳，阴邪不能作汗，虽以汗药发之亦不得，惟甘润和阴，如当归、牛膝之属，多服久服，自能出汗而解也。
伤寒往来寒热，劳瘵寒热如疟，伤食劳役，脚气疝气，肿毒初起，俱有寒热。阴虚证，每日午后发热恶寒，至晚亦得微汗而解。脉弦而数，但不大弦为辨耳，俱不可误认为疟也。凡病寒热，有期者疟也，无期者诸病也。
凡疟病自阴而渐阳，自迟而渐早者，由重而轻也。自早而渐迟，自阳而渐阴者，由轻而重也。凡感邪极深，发愈晏而作愈迟者，必使渐早渐近，方是佳兆。故治此疾者，春夏为易，秋冬为难。
疟邪必从汗出，邪在阴者，必汗出至足乃佳，然非麻、葛辈可发，但开郁通经，其邪热即散，而为汗矣。其虚者，非参、 、归、地，则终不能得汗也。
古称风寒暑湿，皆能成疟，然必客于营卫之舍，然后成疟，不尔不成疟也。夫营之有舍，犹行人之有传舍也。营卫之气，日行一周，历五脏六腑、十二经络之界分，必其舍有邪，与日行之卫气相遇则病作；离则病休，故发作有时，与伤寒大异也。
俗有伤寒变疟、疟变伤寒之说，愚谓伤寒变疟者，本是疟邪，因其气特甚，故一发而不止，迨汗出气衰，乃复返于舍而后日作，非伤寒能变疟也。疟变伤寒者，本是伤寒，因邪气先中少阳，故寒热如疟，其邪递引递出，遍满三阳之界，因而发热不止，设不解，则又转而之三阴，非疟邪能变伤寒也。是以始先似疟之证，热虽退，身表尚有余热，不似疟之热退即凉也。始先似伤寒者，汗常浃体而热不退，过一二日，忽振寒而发热，或热退一日而复作寒热，非如伤寒之汗出即热退而邪解也。学人智识既具，自当独断，岂可习焉不察，自同众人也。
久疟不退，邪气陷入阴分，亏损营血，有热无寒，口燥唇干，有似伤寒，人皆谓之变伤寒，不知其为传劳瘵也，脉将散大，或细数，而死期至矣。
风疟
风疟者，脉浮、多汗、恶风，多于春时得之。经云：以春病者，恶风是也。亦有发于秋者，经云：夏暑汗不出者，秋成风疟是也。杨仁斋云：风疟是感风而得，恶风自汗，烦躁头疼。
风，阳气也，故先热后寒，可与解散风邪。
温疟
瘟疟者，先热而后寒，与风疟大略则同，其但热而不寒者，经所谓得之冬中于风，寒气藏于骨髓之中，至春夏阳气大发，邪气与汗皆出。此病藏于肾，其气先从内出之于外也。《外台》云：病疟六七日，但见热者，温疟也。与夏伤暑而秋病疟者不同。又有先伤风而后伤寒者，亦先热而后寒，名曰温疟，与此亦不同。
桂枝白虎汤
知母（六两） 甘草（炙，二两） 石膏（一斤，碎） 桂枝（三两） 粳米（六合）
上锉，每服五钱，水一盏半，煎至八分，去滓温服，汗出即愈。
延年疗温疟，壮热不能食，知母鳖甲汤
知母 鳖甲（炙） 骨皮（各三两） 常山（二两） 竹叶（一升） 石膏（四两）
水煎，分三服。
湿疟
湿疟者，寒热身重，肢节烦疼，胀满，善呕，自汗。陈无择云：因汗出复浴，湿舍皮肤，及冒雨湿所致。当从太阴论治，除湿汤主之。寒多者必兼温，行阳气也。
除湿汤
半夏 浓朴 苍术（米泔制，各二两） 白术（生） 藿香 橘红 白茯苓（各一两） 甘草（炙，七钱）
上 咀，每服四钱，姜七片，枣一枚，水煎食前温服。本方去白术，加人参、草果、水姜、乌梅煎，即《和剂》人参养胃汤。脉无力，寒多，加姜、附；脉有力，热多，加芩、连、柴胡。朴、苍、藿、姜，发散也；半、果、茯、橘，劫痰也，人参惟虚人最宜。
瘅疟
瘅，单也，言独热而无寒也。经云：阴气孤绝，阳气独发，则热而少气烦冤，手足热而欲呕，名曰瘅疟。此以阳脏而病阳证，与诸疟证亦不同，其治之之法有三：一者热气内蓄，而表有客寒，则当散以辛凉。一者客邪已解，而蕴热独盛，则当清以苦寒或甘寒。一者邪火虽盛，而气血已衰，真阴已耗急，急宜壮水固原也。
《备急》竹叶常山汤 治瘅疟及温疟。
常山（三两） 淡竹叶（一握） 小麦（一升）
水五升，煮一宿，明旦煮取二升，分温三服。
牡疟
疟多寒者，名曰牡疟，《金匮》云然也。然牡当作牝，传写之误耳。卫州书云：疟多寒者，痰多也，痰为水类，能遏绝其阳气于里，使不得外达，故寒多不热，虽热亦不甚也。用蜀漆散者，吐去其痰，阳气一伸，其疾自愈。夫牡属阳，牝属阴，寒多为阴，故宜曰牝。
牡蛎汤
牡蛎 麻黄（各四两） 蜀漆（三两） 甘草（二两）
上先取蜀漆三过去腥，水八斗煮蜀漆、麻黄等得六升，去沫内余药，煮取二升，吐勿复饮之。
痰疟
痰疟由夏月乘凉饮冷，及卧湿地、饥饱失时、脾胃不和、痰积中脘所致。其脉弦滑，其证胸痞呕吐，或时眩晕者是也。微则消之，甚而实者，蜀漆、常山之类，攻而去之。虚者四兽饮之属，补而逐之。
常山散
常山一两锉碎，以好酒浸一宿，瓦器煮干为末，每服二钱，水一盏，煎半盏，去滓停冷，五更服之，不吐不泻效。
四兽饮
半夏 茯苓 人参 草果 陈皮 甘草（减半） 乌梅肉 白术（各等分）
上 咀，同姜、枣等分，以盐少许淹服食顷，浓皮纸煨令香熟，焙干，每服半两，水煎，未发前并进三服。
食疟
食疟，一名胃疟。饮食无节，伤胃而成。其证腹痛，中满不能食，食则呕逆，嗳腐吞酸，其脉气口独盛。戴复庵法：平胃散加草果、砂仁，吞红丸子。（方见饮食门。）
《先醒斋笔记》，梁溪王兴甫偶食牛肉，觉不快，后遂发疟，饮食渐减，至食不下咽，已而水饮亦不下，白汤过喉间，呕出作碧色。药不受，小便一滴如赤茶，大便秘。医皆束手。仲淳忽至，视之，令仰卧，以指按至心下偏右，大叫，因询得其由。用丸药一服，至喉辄不呕，水道渐通。次日下黑物数块如铁，其病如失。丸药用矾红和平胃散作末，枣肉丸，白汤下三钱。
虚疟
虚疟者，或体虚而病疟，或因疟则致虚，六脉微弱，神气倦怠，是以补养正气为主。经云：
疟脉缓大虚，便用药，不宜用针。盖病疟而脉虚，气先馁矣，故不宜用针而宜用药。所谓阴阳形气俱不足者，勿刺以针，而调以甘药也。
补中益气汤 小建中汤
二方俱补虚散邪之剂。杨仁斋云：有中年人，脏腑久虚，大便常滑，忽得疟疾，呕吐异常，惟专用人参为能止呕，其他疟药并不可施，遂以二陈汤加人参、缩砂，倍用白豆蔻一二服，病患因自觉气脉顿平，于是寒热不作。盖白豆蔻能消能磨，流行三焦，营卫一转，寒热自平也。
（新定）人参乌梅散 治虚疟、久疟，少气不食。亦治劳疟，劳疟者，遇劳即发，经年不差者是。
人参（三钱） 乌梅（一枚） 黄 当归 茯苓 陈皮（各一钱） 鳖甲 制首乌白术（各二钱）
上都作一服，加姜煎。
疟
疟者，老疟也。三日一发，其气深固，卒不得出。有累年不愈者，亦曰三阴疟。大抵疟病在三阳者，宜汗宜和；在三阴者，宜温宜利，甚者非吐下不能拔其病根也。其胁下有块者，名曰疟母，以鳖甲丸主之。
《千金》常山丸
常山（三两） 鳖甲（二两，炙） 知母（一两） 甘草（五钱）
蜜丸梧子大，未发前酒服十丸，临发一服，正发又一服。
鳖甲丸
鳖甲 香附（各二两） 三棱 蓬术（各一两） 常山（一两） 阿魏（二钱）
上并用醋浸神曲糊丸，白汤下梧子大五十丸，积消及半即止。
仁斋云：疟之经久而不歇，其故何耶？有根在也。曰饮、曰水、曰败血是耳。疟家多蓄痰涎黄水，或停潴心下，则常山能吐之；或结癖胁间，则常山能破其癖而下之。其有纯热无寒，或蕴热内实之证，投以常山，大便点滴而下，似泄不泄，须用北大黄为佐，大泄数下，然后获愈也。又妇人产后，败血流经，亦能令人寒热如疟，至暮则发，发则身痛如被杖，宜通经活血之剂，鹿角屑和血止痛如神。