康熙二十一年（一六八二、壬戌）春正月十九日（丁卯），议政王大臣会议：『逆贼吴三桂骸骨分发各省，吴世璠首级交与刑部悬挂示众。逆党夏国相应凌迟处死；及势迫投降巴养元等五人应立斩枭示』。上曰：『此中尚有可议者否』？大学士勒德洪、明珠奏曰：『此辈罪犯已极，应正国法，似无可议。又逆贼耿精忠等十人应凌迟处死，其逆党黄国瑞等十九人应立斩』。上曰：『耿精忠身造罪孽，应当极刑；其子等俱行凌迟，亦有可悯！可改为斩否』？明珠奏曰：『耿精忠之罪，较尚之信尤为重大。尚之信不过纵酒行凶，口出妄言；耿精忠负恩谋反，且与安亲王书内多有狂脖之语，甚为可恶』！上又曰：『贼党官员内，尚有可矜者否』？明珠奏曰：『此内有陈梦雷、金镜、田起蛟、李学诗四人犯罪固应处死，然尚有可宥之处』。上曰：『耿精忠等事关重大，着议政王、大臣、九卿、詹事、科道会同详议。其吴三桂骸骨分发各省及吴世璠首级悬示、夏国相凌迟、巴养元等枭示等事，亦示九卿等知之』。明珠奏曰：『春正虽不用刑，但此辈罪恶甚大，与寻常不同；应于两、三日完结』。
二十日（戊辰），议政王大臣等会议逆贼耿精忠等分别凌迟、处斩具题。得旨：『耿精忠革去王爵，着即凌迟处死；其子耿显祚革去散秩大臣，着即处斩。徐文耀、王世瑜、白显中、江元勋、曾养性、王振邦、蒋得■〈车宏〉、刘进忠，俱即凌迟处死；黄国瑞、林芳孙、廖廷云、李似桂、夏季旺、吕应斗、武灏、司定猷、沈伟、郭景汾、罗万里、祖弘勋、陈仪、陈斌、吕八，俱着即处斩。耿精忠、刘进忠首级，着枭示。田起蛟、金镜、李学诗、陈梦雷，俱从宽免死：内系旗人，给与伊本主为奴；系民，入官，给披甲新演洲为奴。余如议』。
－－以上见「大清圣祖仁皇帝实录」卷一百。
二月十三日（辛卯），叙恢复海澄、厦门、金门功，给福建总督姚启圣拜他喇布勒哈番又一拖沙喇哈番。
－－见「大清圣祖仁皇帝实录」卷一百一。
夏四月十七日（甲午），先是，福建提督施琅奏：『贼■〈舟宗〉久泊澎湖，悉力固守。当此冬春之际，飓风时发，我舟骤难过洋，臣见在练习水师；又遣间谍通臣旧时部曲，使为内应。请俟明年三、四月间进兵，可获全胜』。上允之。至是，施琅又奏：『夏至南风盛发，不可进兵；请至十月大举』。上命议政王大臣等集议，佥谓师期不便屡迁，应檄总督姚启圣、提督施琅克期于夏至后进取台湾。得旨：『进剿海寇，关系重大。总督姚启圣、提督施琅身在地方，务将海面形势、贼中情状审察确实，如有可破可剿之机，着协谋合虑，酌行剿抚，毋失机会』。
五月二十一日（戊辰），户科给事中孙蕙条陈台湾进兵宜缓。上谕大学士等曰：『朕昨览此本，意以其言为当。今据报，总督姚启圣、提督旋琅于五月初四日已帅师进取台湾。大兵启行之后，金门、厦门及陆诸隘口所关甚要，速移文福建将军、巡抚、陆路提督、总兵官等，务期有裨地方，协志和衷，严加防御，以固守要隘』。
二十八日（乙亥），安塘笔帖式报称：『大兵进取台湾，以风大不得前；总督姚启圣尚驻铜山，提督施琅移泊云霄。闻海贼刘国轩等扼守澎湖诸隘，瞷我兵前进，即抄袭其后』。于是议政王大臣等会议：『请檄总督姚启圣、提督施琅：若目前风大，未便进剿，即统官兵回汛，整饬舟师，相机再举』。从之。
－－以上见「大清圣祖仁皇帝实录」卷一百二。
秋七月二十八日（癸酉），上谕大学士等曰：『天道关于人事；彗星上见，政事必有阙失。其应行应革者，令九卿、詹事、科道会议以闻』。于是尚书介山、侍郎沙赖、科尔坤等奏：『请安插裁汰各省兵丁，令其得所』。尚书魏象枢奏：『请察裁兵中，或有效力行间者，不令裁汰』。尚书梁清标奏：『今天下太平，凡事不宜开端；当以安静为主』。左都御史徐元文奏：『请暂停台湾进剿』。侍郎杜臻奏：『请全复浙省运丁裁扣钱粮』。汉给事中御史等奏：『请潼关收税免差』。少詹事及满给事中等奏：『大同、宣府宜设满洲官兵，则无田产满兵，皆有裨益』。上曰：『裁兵务使得所、慎勿汰及效力之人；另降谕旨。梁清标所言，凡事不宜开端，当安静；甚得为治之要。近总督姚启圣疏称十月进剿台湾，可暂行停止；俟十月后，再行定夺。复运丁钱粮及免差潼关收税，令各所司议奏。大同、宜府设满洲官兵事宜，令该部于议覆凯音布。噶尔泰等条奏时，一并确议以闻』。
－－见「大清圣祖仁皇帝实录」卷一百三。
八月二十七日（壬寅），福建总督姚启圣疏言：『闽省有绿旗兵，又有汉军甲兵进取台湾，防守地方业已足用。大兵似宜撤回』。上命将军喇哈达等尽率福建大兵还京师。
－－见「大清圣祖仁皇帝实录」卷一百四。
冬十月初六日（己卯），福建提督施琅疏言：『臣于水师营中，简精兵二万余、战船三百艘，已足破灭海寇。请令督、抚趣办粮饷给臣军，而独任臣以讨贼，无拘时日。
臣整理舟师，时加操练；但遇风利。即可进兵』。得旨：『进剿海寇，关系紧要。着该督、抚同心协力催趱粮饷，勿致迟误。前姚启圣具题功罪定例，交与施琅遵行。海寇固无能为，郑锦在时，犹苟延抗拒；郑锦死，首寇既除，余党彼此稽疑各不相下，众皆离心，乘此扑灭甚易。施琅相机自行进剿。极为合宜』。
十三日（丙戌），福建总督姚启圣疏言：『兴化一郡滨海要冲，原设兴化总兵一员，管辖中、左、右三营。今将中营兵一千名改设水师铜山营、左营兵一千名改设水师平海营，止存右营兵一千名，未免汛广兵单。兹准陆路提臣咨报：「兴化镇总兵林承病故，要地似难乏员」。臣查同安地方，向因寇踞金、厦诸岛，题设总镇。今外有水师提镇官兵、内有陆路提标官兵，拟将同安镇标中、左二营官兵二千员名并入兴化镇标，凑足三千，就近弹压；将同安总兵吴英调补。其同安镇标右营补入同安城守营，归副将管辖。部议不准行。得旨：『吴英着照该督所请，调补兴化总兵官；应设兵丁，尔部议奏』。
－－以上见「大清圣祖仁皇帝实录」卷一百五。