正月十五日（甲申），常青奏言：十二月二十七日，接到署守備陳邦光兩稟。一稱：『林爽文等於十一月二十七夜，搶劫大墩營盤，遊擊耿世文等全軍俱陷。二十九日，即攻入彰化縣城，知府孫景燧、理番同知長庚、前署彰化縣事俸滿同知劉享基、署典史事鹿仔港巡檢馮啟宗、北協中營都司王宗武及弁兵數十人，俱被殺害。復來犯鹿仔港，並分擾淡水、諸邑，賊黨蔓延，難以抵御，懇即興師救援』。一稱：『十八日有咳莊等莊賊匪，謀犯鹿仔港。陳邦光傳會泉、粵義民，預先埋伏，隨合義民百餘，誘賊至埋伏處所，兩頭夾攻，殺賊百餘名，焚燬咳哈、湳仔、內灣、二八水等處賊莊。又約牛馬頭等莊義民，於二十日辰刻，由沙轆進攻水裏、大肚、茄投等賊巢；並率義民襲後，追逐至貓霧捒。賊匪退踞烏日莊。緣該處有大溪阻隔，不能飛渡』各等情。又於十二日午刻，率同各義民從鹿仔港抵彰。賊匪聞知，隨出西門外，施放槍砲。陳邦光合義民分為兩隊攻殺，賊人退走。當即擒獲執旗之偽副元帥楊振國、偽協鎮高文麟、偽先鋒陳高、偽辦理水師軍務楊軒等四名，殺死賊夥百餘名，獲馬二匹、砲位刀械八十餘件，餘賊四散奔逃。陳邦光入城查看，有參革前任彰化縣知縣張貞生、丁憂典史李爾和、教諭王梁、訓導陳■〈王定〉被羈未釋，並居民鋪戶受困在內。因彰城逼近賊巢，民心驚惶，各義民又無糧食可支，難以駐紮，隨護衛受困官親及居民男婦，一同回至鹿港保守。又將擒獲偽官楊振國等四名，押回鹿仔港，裝入檻車，交丁憂典史李爾和、受傷之北協外委許瑪，分撥兵丁，配船解送泉州，聽候勘訊。又續據陳邦光稟稱：『二十三日林爽文黨羽陳泮、吳領等，燒燬泉、粵民莊。隨率義民前往追捕，殺死賊夥三十餘名，拾獲紅旗器械四十餘件。查陳泮、吳領與林爽文同惡相濟，均應一並剿滅，以絕根株。但南北投虎仔坑等處，阻隔溪河，必得三面夾攻，方能克勝。今各義民俱肯奮力捕匪，惟因利器無多；且鹿仔港地方踞虎仔坑尚有七、八十里。現在鼓舞眾義民，同守鹿仔港、彰城。一面出巡查捕』等情。查該署備節次撲捕賊匪，及義民等同必協力，俱屬奮勇可嘉，俟分別查明，請旨優獎。據解逆犯四名，臣現委員飛赴迎提，即於泉州審明辦理。再查漳匪作孽，泉、粵之人素與為仇，到處俱有義民共相抵御，不獨現在足資保護，即將來收拿匪犯，亦可得力。臣於淡水、鹿港、鹿耳，俱已發有簡明告示，派員分赴各處遍貼曉諭，以勵眾志，而固人心。至水師提臣黃士簡自金門收泊料羅，續於二十八日，又自料羅放洋，計期兩、三日內，即可前抵鹿耳。陸路提臣任承恩系由蚶江出口，亦於二十八日放洋，旋因風雨驟作，寄泊臭塗澳外。該處與鹿仔港相對，一俟風定，即可揚帆直達。惟是賊情猖獗，到處蔓延，自澎湖至鹿耳門系屬台郡咽喉，尤宜厚集兵力。臣前經續調督撫標兵一千名，原令由南台出口，前往鹿耳，以備策應。第恐海道紆回，風汛難定，適預備之延、建兵一千名，亦已分起前來；因令督撫標兵仍駐省城防守，將延、建兵一千名，派延平協副將林天洛管帶，由陸路兼程赴廈；並派先經調來之汀州鎮總兵普吉保統率登舟。又於水師提標五營內預備兵丁六百名，派令興化協副將格繃額帶領，亦從廈門配船飛渡，均由鹿耳赴台，隨同水師提臣協力進剿。至續派之福寧鎮及銅山、羅源等營，共兵一千名，亦催令陸續繼進。奏入。
上命軍機大臣傳諭常青、黃仕簡、任承恩、徐嗣曾曰：賊匪等敢用槍砲攻犯城池，罪大惡極，不特首惡之父、兄、妻子，應行緣坐，即如現在拿獲之楊振國等四犯，俱曾受偽職，並與官兵抗拒者，亦應一例緣坐。該犯等，系漳州民人，其家屬想仍在內地，若此時遽行查辦，恐漳民聞而生駭，轉多未便。著常青俟楊振國等四犯解到時，訊明各要犯家屬下落，密為存記。俟黃仕簡等在台搜捕賊匪事竣，大兵撤回時，按名查拿辦理，自無虞其兔脫漏網。至署守備陳邦光督率兵民，殺退賊眾，並擒獲賊目，解送內地審辦，尚屬奮勇可嘉！著常青於事竣後，查明給咨送部引見。其義民鄉勇等，亦著分別旌賞，以示獎勵。至賊匪滋擾鳳山時，參將瑚圖里乘馬追賊，轉被賊人乘虛撲入城內，兵丁衝散，瑚圖里由南而去，不知下落。是該參將之不能抵御賊眾，由於兵散，與臨陣退縮者不同；此時，尚可不治以委城而去之罪。若該參將能收集兵民，再行出力殺賊，則其功罪足相抵。統俟常青於事竣後，查明具奏到日，再行核辦。其知縣湯大奎，雖未能堵賊守城，但既經自刎，究屬可憫！亦應查明議卹。至黃士簡與任承恩，因海洋風色不順，難涉險輕進，朕亦不責以遲延。計此時各路大兵，俱已早到，黃仕簡等，務宜督率兵弁，分路會剿，奮勇剿賊，速奏蕆功。
上又命軍機大臣傳諭李侍堯曰：謀逆首犯與各要犯家屬，均當一律緣坐。但該犯等俱系漳州民人，其家屬想仍在內地。著將常青奏到之摺，並所降諭旨抄錄一分，寄與李侍堯閱看，以便該督到閩時遵辦。其署守備陳邦光如何出力，及參將瑚圖里作何下落之處？如李侍堯到彼，常青未及查辦，著該督查明分別具奏。
十八日（丁巳），孫士毅奏言：聞台匪糾眾滋事，已將調撥弁兵等事，料理停妥，兼程赴潮。並密札該處鎮將等暗行訪查，凡在漳、泉等處遊食民人，有回潮形跡可疑者，一面盤詰，一面拘管，無許輕易釋放。奏入。
上命軍機大臣傳諭孫士毅曰：現在臺灣剿捕賊匪，即有粵東義民在彼幫同官兵出力殺賊者，此時，如有回潮民人，正系不肯從賊及避亂回籍之人，該督應令地方官收卹安慰，何得轉令拘管，不准釋放？是驅良民轉令從賊，更屬不成事體，著傳旨嚴行申飭。該督系軍機司員出身，曾經隨同出兵，非若未經軍務者可比，乃於事體輕重，毫無定見，適足為朕所輕矣。孫士毅當於該處明白曉諭，以此事辦理錯誤，現奉諭旨訓飭。所有回潮民人，仍俱各安生業，毋須拘管；俾該處民人安居樂業，不致驚疑。設遇有漳州台匪餘黨竄匿粵省，自應訪拿究辨。
臣等謹案督臣孫士毅，因搜訪逸匪，並令遇有回潮民人，概行拘管。止知緝捕為亟，而不覺失於太過。設臺灣被難之人，聞信不敢回籍，誠如聖諭，良民或轉致從賊，更復成何事體！蒙皇上傳旨嚴飭，並明示以回潮之民，正系不肯從賊，其避難回籍者，應令地方官收卹安撫。聖慈寬大，如覆載之無所不容。粵莊義民等，所由聞風感勵，協同官兵剿捕，始終不懈，益徵德化之入人者深也！
二十日（已丑），常青奏言：據台地文武將賊目高文麟等管解到泉，親提研訊。緣高文麟、楊軒素與逆首林爽文往來，楊振國（即楊詠）系彰化縣差役，陳高系與逆黨劉賢士認識。逆犯林爽文住居彰化大里杙莊，恃其山路險僻，丁族眾多，平日窩賊搶竊，擾害良民，並恐官府訪拿，樹黨結會，共相幫護。凡入會者，令其對天跪地立誓，並不寫帖立簿，只以舉指為號。經彰化縣知縣俞峻訪聞，差役楊詠往拘。因林爽文先曾犯竊被獲，即系楊詠得錢賣放，該縣將楊詠責比收禁。並訪知楊光勳案內逸犯張烈等五名，亦逃避林爽文莊內。該縣以各犯恃眾負固，稟知鎮道帶兵搜拿。林爽文乘莊眾驚懼，遂起意拒官，糾合同會莊眾，殺害知縣、副將、遊擊、兵役多人。復思攻佔縣城，可與官兵抵御。即於沿路糾邀無賴匪徒三、四千人，於十一月二十九日攻破彰化。林爽文既得縣城，自稱號主大元帥，並搶奪店鋪綢布豎立旗號，書寫「順天」字樣。其現獲之楊詠，林爽文念其從前賣放之情，許為副元帥；高文麟許為總爺；楊軒委辦軍務，各賊即分路往攻諸羅、淡水，留高文麟等帶同匪黨數百人，保守彰化。旋經鹿仔港守備陳邦光並泉州義民林湊、林文濬、黃奠邦、許伯達等，募集鄉勇，同往攻殺，賊眾紛散。將逆犯高文麟等四名擒獲，押解來泉。該犯等膽敢從賊肆擾，攻佔城池，領受偽職，實屬罪大惡極，不容一刻稽誅。但案關大逆，應請交刑部再行確審。因解送省城，交撫臣徐嗣曾遴委妥員管解，並飭沿途倍加防護，以保無虞。其押犯來泉之典史李爾和、外委許瑪，情願仍回台地，協力剿賊，將來視其功績，另予優敘。義民林文濬協同押犯，洵屬可嘉！臣當即給賞花紅銀兩，以示鼓勵。並令回台傳示各義民，共加感奮。又向該犯等詰問天地會起於何時？在會共若干人？據楊詠、楊軒同供：『天地會，是五十年十二月內，有漳州平和縣人莊煙（即嚴煙）過台，來興起的。聽得嚴煙說及起會的根源，是廣東有姓洪的和尚，叫洪二房，同一姓朱的人起的。洪二房和尚居住後溪鳳花亭，不知是何府縣地方；姓朱的年纔十五、六歲，不知叫什麼名字；也不知住在那裡』等語。臣因該犯等既經嚴煙告知起會根由，豈有未得詳細之理。再四詰其鳳花亭實在何處？朱姓實系何名？堅稱不知。查該犯等狡惡異常，情詞閃爍，四人本籍多在漳屬，其中自難保無勾連串結情事。但，現在該處民情，尚屬寧靜，若一涉張皇，轉恐驚疑四起，惟有密飭該鎮道等，悉心訪察，加意嚴防，俟台匪蕩平，以次查辦。一面飛咨提臣，即於台地追究嚴煙下落，再加碓究。至所稱廣東之和尚洪二房及朱姓等，尤關緊要，臣隨派心腹妥弁帶領咨文，飛投廣東督撫二臣，務期不動聲色，密查辦理。又水師提臣黃仕簡，於十二月二十九日已抵澎湖，風信順利，三十日即可由鹿耳門進口。陸路提臣任承恩暨所領官兵，俱於初四日在崇武澳得有順風，一齊放洋。奏入。
上命軍機大臣傳諭常青、徐嗣曾曰：常青辦理此事，初時未免稍涉矜張，嗣據該督等節次奏到，調度進剿各事宜，辦理漸有主見。至所獲匪犯，朕意本欲令其解京，今該督於獲犯審明後，即請解京審辦，並鎮靜辦理各事宜，皆與朕意適合。不意常青竟能如此，甚屬可嘉！至嚴煙籍隸漳州，不難即時擒獲。並著常青於拿獲該犯後，一並妥速解京。前因該處善後事宜要緊，恐常青究系初任，因思李侍堯外任有年，較為諳練，是以降旨調任，令其前往辦理。此時，該督惟應督率弁兵於應行辦理之事，悉心調度，以期迅速蕆事。朕必加恩、加獎，更不必以調任縈心，稍存疑畏，轉於剿捕無益。現在，黃士簡、任承恩，自必已到臺灣，厚集兵勢，合力剿捕，賊匪自無難立就殲滅，一得捷音，迅速馳奏。
上又命軍機大臣傳諭孫士毅曰：臺灣逆匪倡立會名，戕官佔城，實屬罪大惡極。至所供起會根由，系和尚洪二房，並姓朱的，俱是廣東人。朱姓年祗十五、六歲，何能糾眾匪徒？興起會名？輒敢有謀叛等事。恐即系洪二房依附朱姓名目，從中煽誘；又如從前朱一貴謀逆情事，皆未可定，不可不嚴行根究。著孫士毅查明後溪鳳花亭，究在何府州縣？即將和尚洪二房並朱姓嚴密跴緝，迅速查拿。一經緝獲到案，訊得確情，即一並派委妥幹員役迅速解京，歸案審辦。並著飭令沿途地方，一體小心押送，毋得稍有疏虞。
同日，汀州鎮總兵普吉保奏言：前接撫臣來咨酌調汀州、邵武官兵，前赴汀州府屬之永定、上杭二縣駐紮，聽候進剿。即於汀標三營派撥兵丁五百名，自汀起行；一面飛調邵武都司定柱帶兵三百名，駐紮上杭。臣亦前抵永定彈壓。督臣調臣赴泉，密商機務，隨即日起身。途次復接督臣來文，鳳山縣亦被賊匪攻陷，望救孔急，飛調臣統領建寧、延平二處兵丁一千名、水師提標兵六百名，由廈門配船飛渡鹿耳門進剿。臣於正月初三日到泉。查延、建官兵尚未到，隨與督臣面商，台郡現在危急，不可稍待，臣即於初四日由泉星馳赴廈，將水提標兵六百名，先行配船飛渡。其延、建官兵，飛催接續赴廈渡台，統領合剿。奏入，報聞。
二十一日（庚寅），上命軍機大臣傳諭李侍堯曰：臺灣地方，自康熙年間始隸版圖，因遠隔海洋，該處府廳各縣，俱未建立城垣。後經朱一貴聚眾滋事，平定後，總督滿保曾議建城。惟時以地處海外，無城雖難於防守，然失之易、復之亦易，是以未經建立，以節煩費。但該處久成郡縣，與內地無異，而城圍尚相沿用竹、木編插，不足以垂久遠。且此次林爽文糾眾猝起，縣城遂被砍破，究由■〈艹〈束刂〉〉竹不能防御所致。朕意，與其失之復取，既煩我兵力，又駭眾聽聞，何如有城可守而勿失，更為有備無虞乎！況方今國帑充盈，該處郡城廳縣不過五處，即建立城垣，動用不過百萬，何惜而不為？至建立城垣，該處可立窯座，或用外磚內土之法；如窯座不便，該處遍地皆山，即開採石料以代磚工，更為鞏固。著李侍堯於台匪蕩平之後，詳細熟商歸入善後事宜案內，一並妥議；勘估繪圖具奏。
上又命軍機大臣傳諭劉長麟、閔鶚元、琅玕、徐嗣曾曰：高文麟等，系台匪案內領受偽職要犯，必須解京嚴行究訊，盡法懲治。著沿途各督撫於該犯等到境時，務須遴委妥員，多派兵役，小心防範，迅速解京，毋致中途稍有疏虞，致干咎戾。
二十二日（辛卯），徐嗣曾奏言：准督臣咨商，將臣預調之延、建兵一千名，及督臣續調福寧各鎮營兵一千名，俱令由陸路赴廈，徑進鹿耳門，為提臣黃仕簡一路接應。俱經陸續到廈。總兵郝壯猷於十二月二十二日放洋。副將徐鼎士等於十二月二十二日自南台下船至閩安，屢次放洋，俱被風阻。臣於初八日親赴督催，該副將等已先於初七日放洋。臣親至五虎門瞭望一帶洋面，並無船隻停擱。閩安等處，地方緊要，臣即順道將沿海各口岸逐一履看。其汛兵單少之處，先經臣於省標內派兵二百名，前赴增駐，以資截拿。現在巡防甚為嚴密。昨據興泉道萬鍾傑稟報：『差探，賊分南北二路攻犯臺灣郡城，適澎湖遊擊蔡攀龍領兵到台，自十八、九至二十二，連日打仗得勝。二十五日夜，賊自北路來攻。柴大紀督同護安平協林光玉等，施放大砲，賊俱退避』等語。茲提臣黃仕簡、任承恩各路官兵，先後抵台，烏合之眾，自必立就撲滅。特剿捕之時，若逃入台地內山，官兵長圍攻逼，搜拿不患不淨。惟海洋瞬息千里，倘賊匪竄逸內渡，或恐漏網。現已飛咨水陸提臣及領兵鎮將，一面剿殺賊匪，一面即於沿海■〈氵义〉港搜拿賊船，先行燒沉淨盡，預絕其遠颺之路。而漳州一屬，系賊匪原籍，誠慮有勾串連結情事。臣密札該道朱元會知府黃彬，不動聲色，妥為防範。復會同督臣出示曉諭，以賊匪雖系漳人，其在台滋事，與原籍親屬毫無干涉。惟藏頓隱匿，例應同罪；將來賊匪潛逃回籍，即捕獲首報！並懸賞格，剴切曉諭。至渡台官兵，配坐戰船之外，需用商船，皆系原價雇備。應給兵糧，亦皆動碾倉谷。惟漳、泉一帶民食，素資台米，今商販不繼，恐致糧價稍昂，現在設法招商運赴下游糶濟。其過兵處所，俱飭令大員妥為經理，並無絲毫擾累民間。體訪輿情，各俱安貼。奏入。
上命軍機大臣傳諭李侍堯、常青、徐嗣曾曰：地方偶有聚眾滋事之處，總督既經前往，巡撫自當在省鎮靜，不應輕離會城，以致人心疑駭。昨孫士毅奏，親赴潮州彈壓；今徐嗣曾復有前往閩安之奏。惟知出力急公，而不權事體之輕重緩急，朕並不嘉其不辭勞苦，轉為朕所鄙矣。此時各路官兵，自早已分頭會剿，賊匪無難立就殲滅。惟竄匿賊黨，恐有逃至內地者，當於各海口不動聲色，嚴行防範截拿。此則徐嗣曾應辦之事，該撫務督飭所屬嚴行妥辦，不可張皇疏忽。如得有剿賊情形信息，仍著由驛迅速具奏。
二十三日（壬辰），南澳鎮總兵陸廷柱奏言：前准福建提臣黃仕簡札，酌派南澳左營兵丁，預備調用。隨即就每營飭挑備戰兵丁各三百名，預備調遣應援。嗣又准兩廣總督札，將先派水師一千名帶領，竟由陸路直抵廈門，聽候閩浙總督調遣等因。隨即檄調署澄海協就近抵澳，彈壓地方。並飛飭各官兵星夜兼程赴廈。臣即於初六日戌時，登舟渡海，前往廈門聽候調遣。奏入，報聞。
二十四日（癸巳），孫士毅奏言：途次接准閩省咨會，令粵省派兵二、三千名，於本省交界處所駐紮，預備徵調。臣思水師一項，若待徵調始行就道，恐海洋風信靡常，守候稽延。是以，擬將派定附近潮州之水師兵一千名，先委將弁統領，徑由閩省詔安縣陸路，前抵廈門，聽候閩浙督臣常青調遣。此外，水師五百名、陸路一千五百名，照依閩省來咨，調集交界地方，俟有徵調，再行起程。至碣石鎮標水師五百名、南澳右營及澄海、海門水師五百名，分起接續前進。署提臣彭承堯、護惠潮道顧聲雷，已於正月初八日，先赴黃岡地方稽查彈壓。臣即於正月初九日，親赴閩粵交界處，督率照料，點送出境。按照兵數，每名令其裹帶一月口糧，以備緩急應用。其水師一千名，應得出兵分例，臣於藩庫內支項酌給，統俟蕆事後，照例核實報銷。此外，現在交界處等候之水陸兵二千名，尚未赴閩，每日給以口糧；其應得出兵分例，暫緩給領。再，臣風聞有福建興化、泉州及廣東潮州之在台貿易客民，聚眾數千人，隨同官兵奮力拒賊，彼此互有殺傷等因。臣既乘機出示剴切曉諭潮民，俾知感動。仍暗加密訪，如有潮屬民人在台入夥從逆，究出姓名，即與叛逆奸匪一律從嚴辦理。緣潮郡民人，在台貿易者頗多，如此分別良歹，明示勸懲，庶幾將來知所趨向。並俟兵事略蕆，臣即咨會閩省督撫分晰查明，移知粵省辦理。再，臣派撥南澳各營水師兵一千名，先赴廈門，聽候調遣。署提臣彭承堯咨商，請以南澳鎮總兵陸廷柱統領前往；臣以南澳緊接臺灣，地方緊要，該鎮未便遠離，是以飛調左翼鎮李化龍領兵，仍令陸廷柱留營督率防範。茲接該鎮陸廷柱呈報，先已稟知閩浙督臣，自願赴台剿賊；復準署提臣彭承堯咨調領兵之文，即於正月初六日馳赴廈門聽調等語。是該鎮未接改委文行，一聞調派，星速起程，尚屬勇往。且該鎮曾任臺灣，彼處情形熟悉，軍營多一得力之人，更為有益。南澳營務，現有署澄海協廖光宇前往代理。臣與署提臣往來潮州、黃岡、澄海等處，距南澳不遠，足資彈壓。奏入。
上命軍機大臣傳諭孫士毅、常青、李侍堯、李世傑、徐嗣曾、琅玕曰：閱孫士毅摺內，接准閩省咨會，原不過令其預備，何嘗有徵調之語。乃該督不揆事理輕重，率行派委將弁，紛紛帶兵即赴廈門。實屬非是。辦一烏魯匪犯，遽行令廣東、浙江、江南等省，紛紛徵調，成何事體！外省習氣，非失之懈弛，即過於矜張。偶遇地方此等事件，率奏請親往，以見其急公勉力，為站腳地步。全不計事體之緩急輕重，及騷動地方，甚無謂也。試思粵省巡撫現未回任，該督又遠赴潮州，海疆重地，關係緊要，茭塘沙灣附近省垣，該督如此辦理張皇，萬一有一、二奸匪乘勢鼓動，又將何以應之乎！孫士毅接奉前旨，即星速回駐省城。其所派水師一千名、既已起身，聽閩省督提調遣；若事已定，即令撤回。其續派之兵，俱著撤回本營。總以鎮靜地方，安戢人心為要。
臣等謹按奸民倡亂之初，若地方大吏稍涉張皇，百姓易生疑懼，或恐別滋事端。皇上諄諄告誡，屢諭督撫提鎮等，不動聲色，處以鎮靜，俾良善自安。所由軍行之際，闔境安堵無驚，洵緩戢之至計也。
二十五日（甲午），常青奏言：官兵出口，屢被風阻收泊各澳。茲據報：黃仕簡於十二月二十八日放洋，由鹿耳門前進。任承恩於正月初四日放洋，由鹿仔港前進。其由閩安出口之總兵郝壯猷及副將徐鼎士等，亦因風汛不順，迄今並無抵淡水信息。現在福寧延建各兵，亦俱接踵繼進。臣並令調來之汀州鎮總兵普吉保，添帶水師兵六百名，由廈門出口。並准兩廣督臣孫士毅派撥粵兵一千名到廈，協同進剿，兵力已屬厚集。計此時，兩督臣亦自必到台，分路攻剿。至台郡情形，接據探差稟報，自十二月十八、十九至二十日等日，賊人往犯郡城，經柴大紀同澎湖遊擊蔡攀龍等，帶兵打仗，屢加殲戮。城內聚集義民鄉勇，協同抵敵；義民並不受值，鄉勇日給錢文，人心甚固，可保無虞。其鹿仔港一路，已據署守備陳邦光率同泉、粵義民殺退賊人，協力固守。又淡水、新莊之艋舺一帶，亦經署都司易連召募義民，共相保護。官兵到日，義民響應，自必倍加奮勇，即可剪除淨盡。至內地各境，俱皆寧謐。其餘沿海口岸，嚴飭文武員弁實力巡查；已據漳浦縣羅澤坤稟報，盤獲匪犯陳樵一名，現在飭提確究。再查彰化縣俞峻，系上年十月甫經抵任，實因緝拿賊匪，致被狀害，並無別項劣蹟。奏入，報聞。